More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0017 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0017  ribonuclease HII  100 
 
 
206 aa  424  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00136282  unclonable  9.28974e-07 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  63.29 
 
 
207 aa  266  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  68.6 
 
 
208 aa  263  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  1.50276e-09  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  62.93 
 
 
205 aa  262  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  63.41 
 
 
206 aa  258  3e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  6.92909e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0017  ribonuclease HII  64.39 
 
 
299 aa  250  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  61.46 
 
 
206 aa  241  6e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  51.93 
 
 
208 aa  181  5e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2825  RNase HII  50.82 
 
 
202 aa  175  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  47.67 
 
 
242 aa  173  2e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  49.22 
 
 
204 aa  172  3e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  52.72 
 
 
198 aa  172  4e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  2.94513e-05 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  51.38 
 
 
191 aa  172  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  49.17 
 
 
206 aa  168  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  4.38708e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  48.21 
 
 
256 aa  167  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05540  putative ribonuclease HII  46.7 
 
 
199 aa  167  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.734266  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  49.22 
 
 
283 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  52.75 
 
 
269 aa  163  1e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  49.18 
 
 
198 aa  164  1e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  45.31 
 
 
250 aa  163  2e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  46.63 
 
 
199 aa  163  2e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  47.67 
 
 
283 aa  162  4e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  49.72 
 
 
203 aa  162  4e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  50.28 
 
 
218 aa  161  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0404  ribonuclease HII  48.47 
 
 
203 aa  161  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.505687 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  47.67 
 
 
283 aa  161  8e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  45.83 
 
 
202 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  45.6 
 
 
225 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  49.73 
 
 
196 aa  160  1e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  47.83 
 
 
211 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  49.2 
 
 
199 aa  159  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  50.83 
 
 
198 aa  159  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1547  ribonuclease HII  46.04 
 
 
198 aa  159  3e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.040973  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  45.64 
 
 
253 aa  158  4e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  50.28 
 
 
248 aa  158  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1756  ribonuclease HII  53.59 
 
 
196 aa  158  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384083  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  49.17 
 
 
210 aa  158  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  46.84 
 
 
197 aa  158  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  47.83 
 
 
212 aa  158  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  47.72 
 
 
208 aa  158  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  44.39 
 
 
211 aa  157  7e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  47.67 
 
 
207 aa  157  9e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  50.83 
 
 
201 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  45.36 
 
 
338 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  50.83 
 
 
201 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  50.28 
 
 
248 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  51.04 
 
 
260 aa  156  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.19683e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  49.45 
 
 
249 aa  156  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  45.99 
 
 
198 aa  155  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  45.31 
 
 
253 aa  155  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  45.99 
 
 
198 aa  155  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  45.99 
 
 
198 aa  155  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  46.97 
 
 
210 aa  155  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  46.91 
 
 
208 aa  155  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  48.94 
 
 
240 aa  155  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  48.62 
 
 
213 aa  155  5e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  45.88 
 
 
279 aa  155  5e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  48.62 
 
 
217 aa  154  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  48.62 
 
 
217 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  50.28 
 
 
207 aa  154  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  45.99 
 
 
198 aa  154  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  49.46 
 
 
201 aa  155  6e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  45.99 
 
 
198 aa  154  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  45.99 
 
 
198 aa  154  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.69157e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  50.28 
 
 
207 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  49.2 
 
 
226 aa  154  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  1.43368e-05  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  44.92 
 
 
254 aa  154  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  48.95 
 
 
207 aa  154  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  47.06 
 
 
202 aa  154  8e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  47.06 
 
 
202 aa  154  8e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  46.88 
 
 
213 aa  154  8e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1185  hypothetical protein  48.62 
 
 
194 aa  154  1e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.130682 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  45.3 
 
 
198 aa  154  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  48.37 
 
 
236 aa  154  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1286  ribonuclease H  50.53 
 
 
199 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  45.99 
 
 
198 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  47.69 
 
 
219 aa  153  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  49.72 
 
 
207 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  45.08 
 
 
203 aa  153  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  45.99 
 
 
198 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  48.62 
 
 
214 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  50.28 
 
 
207 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  48.62 
 
 
199 aa  153  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  51.38 
 
 
208 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  46.67 
 
 
214 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  48.63 
 
 
229 aa  152  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  48.62 
 
 
214 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  50.28 
 
 
207 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  48.62 
 
 
214 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  44.92 
 
 
198 aa  152  3e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  49.75 
 
 
209 aa  152  3e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  44.92 
 
 
198 aa  152  3e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  48.91 
 
 
214 aa  152  3e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  44.92 
 
 
198 aa  152  3e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  47.51 
 
 
257 aa  152  3e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  49.75 
 
 
209 aa  152  3e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  49.46 
 
 
232 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  47.57 
 
 
201 aa  152  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  50.83 
 
 
240 aa  152  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  47.15 
 
 
277 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>