222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04868 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0415  glycoside hydrolase 15-like protein  52.98 
 
 		 624 aa  651    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0518  glycoside hydrolase 15-related  53.39 
 
 		 606 aa  636    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04868  glycosyl hydrolase, family 15  100 
 
 		 592 aa  1216    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3132  glycoside hydrolase 15-related  54.29 
 
 		 598 aa  670    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0235  glycoside hydrolase 15-related  55.31 
 
 		 599 aa  659    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1816  glycoside hydrolase 15-related  54.04 
 
 		 596 aa  657    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1528  glycoside hydrolase 15-related  53.14 
 
 		 593 aa  636    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0006  glycoside hydrolase 15-related  54.56 
 
 		 595 aa  651    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780753 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3154  glycoside hydrolase 15-related  78.58 
 
 		 593 aa  967    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4211  glycoside hydrolase 15-related protein  53.75 
 
 		 657 aa  643    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.775495  normal  0.475845 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0525  glycoside hydrolase 15-related  54.95 
 
 		 606 aa  645    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.262384 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0502  glycoside hydrolase 15-related  53.56 
 
 		 606 aa  637    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.830994  normal  0.0194391 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3791  hypothetical protein  54.5 
 
 		 598 aa  648    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000380463 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0986  glycoside hydrolase 15-related  53.22 
 
 		 640 aa  639    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0307  glycoside hydrolase 15-related  51.09 
 
 		 603 aa  642    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0356  glycoside hydrolase 15-related  51.96 
 
 		 620 aa  632  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1121  glycoside hydrolase 15-related  54.64 
 
 		 595 aa  634  1e-180  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1778  glycoside hydrolase 15-related  52.96 
 
 		 598 aa  629  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743693  normal  0.0628922 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3916  glycoside hydrolase 15-related  52.99 
 
 		 618 aa  627  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.267662 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1018  glycoside hydrolase 15-related  50.17 
 
 		 589 aa  593  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0623694  normal  0.517609 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3609  glycoside hydrolase 15-related  50.93 
 
 		 598 aa  591  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1504  glycoside hydrolase 15-related  50.17 
 
 		 594 aa  577  1.0000000000000001e-163  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3614  glycoside hydrolase 15-related  48.99 
 
 		 597 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.633662  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3025  glycoside hydrolase 15-related  48.31 
 
 		 597 aa  559  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0399  glucoamylase-related protein, trehalase  38.66 
 
 		 593 aa  420  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4023  glycoside hydrolase 15-related  39.15 
 
 		 593 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000792533  normal  0.121588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2230  glycoside hydrolase 15-related  38.14 
 
 		 594 aa  403  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  34.42 
 
 		 613 aa  296  7e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  35.73 
 
 		 596 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  34.83 
 
 		 595 aa  295  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  33.22 
 
 		 613 aa  290  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  33.5 
 
 		 625 aa  290  4e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  35.23 
 
 		 594 aa  290  7e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  34.39 
 
 		 594 aa  289  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4753  glycoside hydrolase 15-related  32.89 
 
 		 617 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  33.49 
 
 		 610 aa  286  7e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  33.72 
 
 		 627 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  32.46 
 
 		 612 aa  284  4.0000000000000003e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  34 
 
 		 599 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  35.12 
 
 		 586 aa  280  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  32.9 
 
 		 619 aa  278  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  32.37 
 
 		 619 aa  278  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  32.55 
 
 		 606 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  33.06 
 
 		 600 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  33.39 
 
 		 611 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  32.78 
 
 		 850 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  32.47 
 
 		 623 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  34.33 
 
 		 599 aa  273  7e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  32.07 
 
 		 605 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4692  glycoside hydrolase 15-related  32.25 
 
 		 627 aa  271  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.761206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2935  glycoside hydrolase 15-related protein  36.12 
 
 		 617 aa  271  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  33.56 
 
 		 597 aa  271  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  33 
 
 		 605 aa  270  5.9999999999999995e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2196  glycoside hydrolase family protein 15  32.57 
 
 		 625 aa  270  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119453  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  34.11 
 
 		 601 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  32.47 
 
 		 623 aa  267  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  33.17 
 
 		 616 aa  266  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  32.78 
 
 		 612 aa  266  8e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  33.01 
 
 		 602 aa  266  8e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  32.39 
 
 		 608 aa  266  8.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  32.18 
 
 		 617 aa  265  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  32.03 
 
 		 599 aa  265  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  32.27 
 
 		 598 aa  264  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5896  glycoside hydrolase 15-related  33.05 
 
 		 609 aa  264  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0215966 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3936  glycoside hydrolase 15-related  31.58 
 
 		 603 aa  264  4e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00859022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4323  glycoside hydrolase 15-related  32.04 
 
 		 627 aa  264  4e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.322378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  32.85 
 
 		 636 aa  262  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  33.67 
 
 		 611 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  31.83 
 
 		 602 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  33.83 
 
 		 609 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  31.82 
 
 		 609 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  33.45 
 
 		 602 aa  262  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  33.45 
 
 		 602 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  33.83 
 
 		 609 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2015  glycoside hydrolase 15-related  33.06 
 
 		 623 aa  261  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0969063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  34.15 
 
 		 612 aa  260  6e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  32.07 
 
 		 605 aa  259  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2475  glycoside hydrolase 15-related  32.24 
 
 		 621 aa  259  7e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  34.62 
 
 		 601 aa  259  9e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1434  glycoside hydrolase 15-related  32.19 
 
 		 616 aa  259  9e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  33.67 
 
 		 609 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  33.33 
 
 		 609 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  33.22 
 
 		 609 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  33.67 
 
 		 609 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  32.66 
 
 		 593 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  32.89 
 
 		 626 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  32.94 
 
 		 600 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1274  glycoside hydrolase 15-related  32.2 
 
 		 628 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.716617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  31.54 
 
 		 601 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  30.96 
 
 		 596 aa  254  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  30.88 
 
 		 594 aa  254  3e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  31.52 
 
 		 613 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  30.91 
 
 		 679 aa  253  5.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  31.78 
 
 		 611 aa  253  6e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  32.4 
 
 		 627 aa  253  6e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1490  glycoside hydrolase 15-related  31.64 
 
 		 894 aa  253  7e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2670  glycoside hydrolase 15-related protein  31.58 
 
 		 659 aa  253  7e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206997  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  34.05 
 
 		 665 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4840  glycoside hydrolase 15-related  30.67 
 
 		 635 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0898211  normal  0.818713 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  30.24 
 
 		 677 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>