More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2155 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2155  aminotransferase, class V  100 
 
 		 427 aa  887    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0697123  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1965  twin-arginine translocation pathway signal  90.16 
 
 		 426 aa  778    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0412227  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1852  twin-arginine translocation pathway signal  69.09 
 
 		 431 aa  632  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4214  aminotransferase, class V  64.17 
 
 		 428 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33720  PvdN  63.06 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000909297  hitchhiker  0.00809469 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2865  aminotransferase  62.76 
 
 		 427 aa  554  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1642  aminotransferase, class V  59.62 
 
 		 429 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3786  aminotransferase, class V  63.23 
 
 		 430 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3538  aminotransferase class V  62.53 
 
 		 423 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3921  aminotransferase class V  40.71 
 
 		 445 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1687  twin-arginine translocation pathway signal  41.19 
 
 		 440 aa  318  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  25.12 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  23.69 
 
 		 438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  27.65 
 
 		 476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  26.83 
 
 		 437 aa  130  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  23.08 
 
 		 428 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  26.99 
 
 		 469 aa  114  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2039  aminotransferase class V  24.29 
 
 		 460 aa  110  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4973  putative aminotransferase  25.69 
 
 		 437 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3800  aminotransferase class V  24.32 
 
 		 433 aa  108  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  29.71 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  22.65 
 
 		 393 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  26.37 
 
 		 381 aa  100  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  23.94 
 
 		 394 aa  99.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  25.19 
 
 		 377 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  24.19 
 
 		 407 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2611  aminotransferase, class V  22.68 
 
 		 441 aa  97.8  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.189769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  26.58 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  25.59 
 
 		 462 aa  94.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  22.19 
 
 		 381 aa  94.7  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  25.48 
 
 		 377 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  25.72 
 
 		 391 aa  93.2  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  24.8 
 
 		 389 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  24.74 
 
 		 415 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  24.43 
 
 		 393 aa  92.8  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  23.77 
 
 		 377 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  23.32 
 
 		 390 aa  91.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  26.79 
 
 		 377 aa  91.3  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  21.11 
 
 		 393 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0775  putative isopenicillin N epimerase  24.06 
 
 		 464 aa  90.9  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  23.77 
 
 		 378 aa  90.1  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1215  selenocysteine lyase  24.09 
 
 		 385 aa  90.1  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00299865  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0692  putative isopenicillin N epimerase  23.76 
 
 		 385 aa  89.7  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1739  putative isopenicillin N epimerase  23.76 
 
 		 385 aa  89.7  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1140  isopenicillin N epimerase  23.76 
 
 		 385 aa  89.7  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  25.4 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  25.22 
 
 		 378 aa  88.6  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  23.58 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2417  putative aminotransferase class-V  23.43 
 
 		 385 aa  86.7  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  23.73 
 
 		 411 aa  86.3  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1092  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  23.87 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  25.19 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  25.86 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  23.76 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  23.75 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  23.59 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  24.19 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  22.85 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  25.38 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  22.09 
 
 		 896 aa  84  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5319  aminotransferase class V  24.4 
 
 		 495 aa  83.6  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837464 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1124  aminotransferase, class V  24.43 
 
 		 488 aa  83.6  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5559  aminotransferase class V  22 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  23.59 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  23.51 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  25.2 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2091  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25 
 
 		 419 aa  81.3  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000201738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  24.53 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  25.33 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl248  selenocysteine lyase, class V pyridoxal phosphate aminotransferase, cysteine desulfurase  22.69 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.00113755  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0743  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.45 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1607  aminotransferase class V  21.38 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0469  aminotransferase, class V  21.2 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.14848  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  25.38 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  21.96 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  22.61 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  22.89 
 
 		 879 aa  79.3  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  23.27 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0027  aminotransferase class V  25.41 
 
 		 455 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  26.67 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  21.45 
 
 		 390 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3507  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.96 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  22.38 
 
 		 394 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  23.16 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1746  aminotransferase class V  22.96 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.676598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1478  twin-arginine translocation pathway signal  20.22 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  23.21 
 
 		 880 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  24.04 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  23.66 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  22.9 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3698  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.96 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  23.66 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  23.66 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  23.66 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3575  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.02 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  22.19 
 
 		 885 aa  77  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  22.82 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0489  probable cysteine desulfurase  20.94 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0840  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.21 
 
 		 437 aa  77  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.550163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>