83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3887 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 615 aa  1252    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  53.89 
 
 		 1118 aa  484  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1565  hypothetical protein  45.32 
 
 		 436 aa  337  5e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2033  hypothetical protein  45.03 
 
 		 453 aa  329  9e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.234826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1593  rhs element Vgr protein  44.33 
 
 		 435 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3709  hypothetical protein  43.8 
 
 		 436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3479  hypothetical protein  39.83 
 
 		 522 aa  270  7e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.928514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3260  hypothetical protein  38.72 
 
 		 494 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3334  hypothetical protein  38.19 
 
 		 513 aa  249  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3818  hypothetical protein  34.41 
 
 		 675 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  33.02 
 
 		 686 aa  195  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0814  rhs element Vgr protein  33.01 
 
 		 485 aa  172  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0711  hypothetical protein  30.17 
 
 		 698 aa  127  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0552  hypothetical protein  43.1 
 
 		 200 aa  97.4  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1797  hypothetical protein  29.75 
 
 		 969 aa  94  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06791  hypothetical protein  27.76 
 
 		 503 aa  89.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4353  peptidoglycan-binding LysM  27.24 
 
 		 963 aa  89.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000300174 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0527  peptidoglycan-binding LysM  26.35 
 
 		 960 aa  82.8  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.711409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1974  hypothetical protein  40.2 
 
 		 193 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342868  normal  0.816033 
 
 
-
 
NC_003296  RS03735  hypothetical protein  48.35 
 
 		 96 aa  78.2  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3620  hypothetical protein  44.44 
 
 		 94 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4177  hypothetical protein  44.79 
 
 		 95 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.977344 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0639  hypothetical protein  43.33 
 
 		 95 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0662  hypothetical protein  30.93 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.53388  normal  0.263798 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6901  hypothetical protein  43.33 
 
 		 95 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04765  hypothetical protein  29.66 
 
 		 802 aa  73.6  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3773  hypothetical protein  39.33 
 
 		 94 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.040505 
 
 
-
 
NC_003296  RS04689  hypothetical protein  33.33 
 
 		 740 aa  72  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0313625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3309  hypothetical protein  33.65 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3750  hypothetical protein  38.2 
 
 		 94 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4613  hypothetical protein  38.2 
 
 		 94 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2698  hypothetical protein  34.48 
 
 		 800 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1512  hypothetical protein  31.18 
 
 		 768 aa  67  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  27.48 
 
 		 726 aa  67  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02034  hypothetical protein  33.51 
 
 		 720 aa  67  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5988  hypothetical protein  40.23 
 
 		 94 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0524925 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2660  hypothetical protein  39.08 
 
 		 94 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935328  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2049  hypothetical protein  39.08 
 
 		 94 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2689  hypothetical protein  37.93 
 
 		 94 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2707  hypothetical protein  37.93 
 
 		 94 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2581  hypothetical protein  37.93 
 
 		 94 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.559543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0454  hypothetical protein  32.9 
 
 		 733 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0142365  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0989  hypothetical protein  30.19 
 
 		 791 aa  62  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1854  hypothetical protein  42.7 
 
 		 101 aa  62  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000134574  hitchhiker  0.0000000000036226 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1795  hypothetical protein  26.82 
 
 		 815 aa  60.1  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  25 
 
 		 462 aa  59.3  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4489  hypothetical protein  27.38 
 
 		 577 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5734  hypothetical protein  27.38 
 
 		 577 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.363284 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1529  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5125  hypothetical protein  27.38 
 
 		 577 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  32.69 
 
 		 530 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  34.93 
 
 		 539 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2701  hypothetical protein  31.54 
 
 		 802 aa  55.1  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1584  hypothetical protein  31.54 
 
 		 769 aa  55.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1609  hypothetical protein  31.54 
 
 		 769 aa  55.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186349  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1768  hypothetical protein  31.54 
 
 		 802 aa  54.7  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  26.75 
 
 		 1338 aa  54.3  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6317  hypothetical protein  41.77 
 
 		 95 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  27.04 
 
 		 349 aa  52  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3320  hypothetical protein  28.98 
 
 		 670 aa  50.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2918  hypothetical protein  31.9 
 
 		 200 aa  50.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942656 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0847  hypothetical protein  30.62 
 
 		 345 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3175  hypothetical protein  30.62 
 
 		 345 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2626  hypothetical protein  29.94 
 
 		 753 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18473  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1112  PAAR repeat-containing protein  37.33 
 
 		 137 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0479  hypothetical protein  29.94 
 
 		 753 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0982  hypothetical protein  27.07 
 
 		 344 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3273  hypothetical protein  28.91 
 
 		 345 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  37.33 
 
 		 88 aa  45.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2607  hypothetical protein  34.78 
 
 		 178 aa  45.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.220719 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0266  hypothetical protein  37.66 
 
 		 203 aa  45.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  26.98 
 
 		 407 aa  45.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21490  hypothetical protein  31.87 
 
 		 882 aa  45.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.680315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  27.95 
 
 		 345 aa  45.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1016  hypothetical protein  27.07 
 
 		 344 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  27.31 
 
 		 407 aa  44.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3359  hypothetical protein  27.07 
 
 		 344 aa  44.7  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0644  bacteriophage GP29 protein  37.33 
 
 		 173 aa  44.3  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1845  PAAR repeat-containing protein  38.03 
 
 		 135 aa  44.3  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5071  PAAR repeat-containing protein  36.67 
 
 		 136 aa  43.9  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.104912 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  31.22 
 
 		 1892 aa  43.9  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  27.39 
 
 		 514 aa  43.9  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1004  hypothetical protein  26.64 
 
 		 344 aa  43.9  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>