124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1247 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1247  secreted protein Hcp  100 
 
 		 172 aa  360  6e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03240  secreted protein Hcp  99.42 
 
 		 172 aa  358  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000126332  hitchhiker  9.98491e-17 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43070  secreted protein Hcp  99.42 
 
 		 172 aa  358  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000428975  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44890  secreted protein Hcp  99.42 
 
 		 172 aa  358  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00654526  normal  0.188551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69560  secreted protein Hcp  99.42 
 
 		 172 aa  358  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00260129  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5435  secreted protein Hcp  93.02 
 
 		 172 aa  339  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2328  hypothetical protein  86.47 
 
 		 171 aa  315  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2045  hypothetical protein  85.29 
 
 		 171 aa  314  5e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4487  hypothetical protein  75 
 
 		 172 aa  291  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0180  hypothetical protein  61.76 
 
 		 172 aa  231  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1153  Hcp1 family type VI secretion system effector  61.4 
 
 		 171 aa  224  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.465729  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1113  hcp  60 
 
 		 172 aa  218  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1233  hypothetical protein  60 
 
 		 172 aa  218  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189483 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0344  type VI secretion system effector, Hcp1 family  59.41 
 
 		 172 aa  216  7.999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2697  type VI secretion system effector, Hcp1 family  59.41 
 
 		 172 aa  216  8.999999999999998e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.788661  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0312  hypothetical protein  59.41 
 
 		 172 aa  216  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3906  hypothetical protein  59.41 
 
 		 172 aa  216  8.999999999999998e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0385  Hcp1 family type VI secretion system effector  59.41 
 
 		 172 aa  216  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1606  type VI secretion system effector, Hcp1 family  59.41 
 
 		 172 aa  216  8.999999999999998e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4256  type VI secretion system effector, Hcp1 family  59.41 
 
 		 172 aa  216  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3233  Hcp1 family type VI secretion system effector  57.89 
 
 		 171 aa  216  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2514  Hcp1 family type VI secretion system effector  58.24 
 
 		 172 aa  216  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.908248  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2615  hcp protein  57.31 
 
 		 171 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191752 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4082  hcp protein  57.31 
 
 		 171 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000915297 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0054  type VI secretion system effector, Hcp1 family  58.82 
 
 		 172 aa  215  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3239  type VI secretion system effector, Hcp1 family  59.41 
 
 		 172 aa  215  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2826  type VI secretion system effector, Hcp1 family  58.82 
 
 		 172 aa  216  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2118  hypothetical protein  57.31 
 
 		 171 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0647  type VI secretion system effector, Hcp1 family  58.82 
 
 		 172 aa  215  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2558  type VI secretion system effector, Hcp1 family  58.82 
 
 		 172 aa  216  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0417  type VI secretion system effector, Hcp1 family  58.82 
 
 		 172 aa  216  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1163  type VI secretion system effector, Hcp1 family  58.82 
 
 		 172 aa  216  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.838462  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1501  type VI secretion system effector, Hcp1 family  58.82 
 
 		 172 aa  216  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0061  type VI secretion system effector, Hcp1 family  58.82 
 
 		 172 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0241  hypothetical protein  58.82 
 
 		 172 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0243  hypothetical protein  58.82 
 
 		 172 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0249  hypothetical protein  58.82 
 
 		 172 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1025  hcp protein  58.24 
 
 		 172 aa  213  9e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0116  hcp protein  57.65 
 
 		 172 aa  213  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0058  hypothetical protein  58.82 
 
 		 172 aa  212  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1182  hypothetical protein  56.47 
 
 		 172 aa  206  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1211  hypothetical protein  56.47 
 
 		 172 aa  206  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1195  hypothetical protein  56.47 
 
 		 172 aa  205  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000449  Hcp protein  56.21 
 
 		 172 aa  203  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000134513  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_35  secreted protein Hcp-2 (haemolysin co-regulated protein)  56.21 
 
 		 172 aa  203  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1202  secreted protein Hcp-1 (haemolysin co-regulated protein)  54.44 
 
 		 173 aa  200  8e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1357  secreted protein Hcp-2 (haemolysin co-regulated protein)  55.03 
 
 		 172 aa  200  8e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1188  secreted protein Hcp  56.29 
 
 		 173 aa  198  3.9999999999999996e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05871  hypothetical protein  54.6 
 
 		 166 aa  191  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2539  secreted protein Hcp  54.55 
 
 		 171 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0301409  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3174  hcp protein  43.2 
 
 		 161 aa  157  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0280  hypothetical protein  43.79 
 
 		 161 aa  151  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0868  hcp protein  40.83 
 
 		 162 aa  147  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0533  type VI secretion system effector, Hcp1 family  50.85 
 
 		 124 aa  125  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5212  hypothetical protein  41.07 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1626  type VI secretion system effector, Hcp1 family  39.52 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2816  hypothetical protein  37.35 
 
 		 161 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0619  hypothetical protein  37.95 
 
 		 161 aa  117  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0130418 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3644  type VI secretion system effector, Hcp1 family  40.59 
 
 		 159 aa  117  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5261  hypothetical protein  37.35 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1588  hypothetical protein  38.6 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00504704  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0441  type VI secretion system effector, Hcp1 family  39.52 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3506  type VI secretion system effector, Hcp1 family  40.59 
 
 		 159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1198  hypothetical protein  38.07 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00141696  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1304  Hcp1 family type VI secretion system effector  38.07 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.543696  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0406  hypothetical protein  38.07 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191771  hitchhiker  0.0000230132 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3645  Hcp1 family type VI secretion system effector  37.95 
 
 		 161 aa  111  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4049  type VI secretion system effector, Hcp1 family  38.92 
 
 		 157 aa  111  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3256  Hcp1 family type VI secretion system effector  35.33 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2696  type VI secretion system effector, Hcp1 family  36.31 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0159  hypothetical protein  35.54 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354123  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3128  hypothetical protein  34.34 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0741  type VI secretion system effector, Hcp1 family  38.32 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.155948  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2983  hypothetical protein  38.6 
 
 		 159 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1885  hypothetical protein  38.24 
 
 		 190 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0109727  hitchhiker  0.0000606082 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3060  Hcp1 family type VI secretion system effector  38.6 
 
 		 159 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0013  secreted protein Hcp, potential oxidative stress protein  36.09 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4027  type VI secretion system effector, Hcp1 family  38.69 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0731  hypothetical protein  34.34 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2506  hypothetical protein  34.34 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0803  Hcp1 family type VI secretion system effector  34.34 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0782  hypothetical protein  33.73 
 
 		 163 aa  104  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0171  hypothetical protein  33.53 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000104194 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2981  hypothetical protein  33.53 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000297859 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0251  Hcp1 family type VI secretion system effector  35.33 
 
 		 159 aa  101  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0224  hypothetical protein  36.42 
 
 		 160 aa  100  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.156413  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0226  hypothetical protein  36.42 
 
 		 160 aa  100  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1346  hypothetical protein  35.67 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1459  Hcp1 family type VI secretion system effector  35.67 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.303873  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2272  type VI secretion system effector, Hcp1 family  34.3 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1788  hypothetical protein  34.34 
 
 		 163 aa  99  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4078  type VI secretion system effector, Hcp1 family  34.66 
 
 		 159 aa  97.4  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00339373  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0574  type VI secretion system effector, Hcp1 family  34.52 
 
 		 182 aa  96.7  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.237126  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0019  hypothetical protein  31.55 
 
 		 162 aa  93.2  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.965697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3977  type VI secretion system effector, Hcp1 family  33.53 
 
 		 159 aa  92.4  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4093  type VI secretion system effector, Hcp1 family  33.33 
 
 		 159 aa  90.9  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3004  hypothetical protein  34.85 
 
 		 132 aa  90.5  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00118578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1216  HNH endonuclease domain-containing protein  35.67 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.516867  normal  0.131262 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1097  type VI secretion system effector, Hcp1 family  33.33 
 
 		 159 aa  85.5  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7365  Hcp1 family type VI secretion system effector  33.53 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.22797 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>