87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7365 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7365  Hcp1 family type VI secretion system effector  100 
 
 		 166 aa  343  6e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.22797 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1247  secreted protein Hcp  33.53 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69560  secreted protein Hcp  33.53 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00260129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44890  secreted protein Hcp  33.53 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00654526  normal  0.188551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43070  secreted protein Hcp  33.53 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000428975  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03240  secreted protein Hcp  33.53 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000126332  hitchhiker  9.98491e-17 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1588  hypothetical protein  31.65 
 
 		 163 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00504704  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2328  hypothetical protein  33.53 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5435  secreted protein Hcp  31.74 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2045  hypothetical protein  32.34 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0280  hypothetical protein  28.47 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4487  hypothetical protein  29.34 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_35  secreted protein Hcp-2 (haemolysin co-regulated protein)  27.54 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0312  hypothetical protein  29.94 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0385  Hcp1 family type VI secretion system effector  29.94 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3906  hypothetical protein  29.94 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3174  hcp protein  26.39 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1202  secreted protein Hcp-1 (haemolysin co-regulated protein)  26.35 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1357  secreted protein Hcp-2 (haemolysin co-regulated protein)  26.35 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000449  Hcp protein  26.95 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000134513  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0019  hypothetical protein  27.34 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.965697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0868  hcp protein  27.97 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1153  Hcp1 family type VI secretion system effector  28.74 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.465729  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0243  hypothetical protein  27.71 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0241  hypothetical protein  27.71 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0249  hypothetical protein  27.71 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1233  hypothetical protein  27.11 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189483 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2539  secreted protein Hcp  36.04 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0301409  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1113  hcp  27.11 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3128  hypothetical protein  27.82 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4082  hcp protein  30.16 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000915297 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0619  hypothetical protein  24.05 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0130418 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0159  hypothetical protein  25 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354123  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05871  hypothetical protein  25.45 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5261  hypothetical protein  24.68 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4256  type VI secretion system effector, Hcp1 family  28.74 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2816  hypothetical protein  26.42 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2118  hypothetical protein  30.16 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2697  type VI secretion system effector, Hcp1 family  28.74 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.788661  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1606  type VI secretion system effector, Hcp1 family  28.74 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0344  type VI secretion system effector, Hcp1 family  28.74 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2615  hcp protein  29.37 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191752 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0054  type VI secretion system effector, Hcp1 family  28.74 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3239  type VI secretion system effector, Hcp1 family  28.74 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3645  Hcp1 family type VI secretion system effector  25.32 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0417  type VI secretion system effector, Hcp1 family  27.11 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1163  type VI secretion system effector, Hcp1 family  27.11 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.838462  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1501  type VI secretion system effector, Hcp1 family  27.11 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2558  type VI secretion system effector, Hcp1 family  27.11 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2826  type VI secretion system effector, Hcp1 family  27.11 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0647  type VI secretion system effector, Hcp1 family  28.14 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0061  type VI secretion system effector, Hcp1 family  28.14 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3233  Hcp1 family type VI secretion system effector  28.35 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0180  hypothetical protein  27.92 
 
 		 172 aa  52.4  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0058  hypothetical protein  28.76 
 
 		 172 aa  51.2  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1025  hcp protein  25.15 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1188  secreted protein Hcp  27.74 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0116  hcp protein  24.55 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2514  Hcp1 family type VI secretion system effector  24.1 
 
 		 172 aa  47.4  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.908248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26650  hypothetical protein  27.08 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.410921  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1465  hypothetical protein  27.12 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1885  hypothetical protein  29.41 
 
 		 190 aa  45.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0109727  hitchhiker  0.0000606082 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3060  Hcp1 family type VI secretion system effector  28.57 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2983  hypothetical protein  28.57 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1195  hypothetical protein  26.81 
 
 		 172 aa  44.3  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1209  type VI secretion system effector, Hcp1 family  26.17 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1731  hypothetical protein  28.57 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0163556  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1182  hypothetical protein  26.81 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1211  hypothetical protein  26.81 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02047  Hcp family protein  22.63 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106829  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0731  hypothetical protein  23.31 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1586  hypothetical protein  27.54 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0453642  normal  0.164589 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4027  type VI secretion system effector, Hcp1 family  29.41 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2506  hypothetical protein  23.31 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0013  secreted protein Hcp, potential oxidative stress protein  23.95 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0803  Hcp1 family type VI secretion system effector  23.31 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2077  type VI secretion system effector, Hcp1 family  26.02 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00363318  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0782  hypothetical protein  22.56 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1788  hypothetical protein  24.06 
 
 		 163 aa  42  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1459  Hcp1 family type VI secretion system effector  28.57 
 
 		 159 aa  42  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.303873  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1346  hypothetical protein  28.57 
 
 		 159 aa  42  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3041  type VI secretion system effector, Hcp1 family  25.47 
 
 		 165 aa  42  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3506  type VI secretion system effector, Hcp1 family  28.57 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3256  Hcp1 family type VI secretion system effector  24.79 
 
 		 167 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3644  type VI secretion system effector, Hcp1 family  27.73 
 
 		 159 aa  41.2  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2272  type VI secretion system effector, Hcp1 family  26.4 
 
 		 159 aa  40.8  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4078  type VI secretion system effector, Hcp1 family  25.79 
 
 		 159 aa  40.8  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00339373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>