95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2077 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2077  type VI secretion system effector, Hcp1 family  100 
 
 
148 aa  297  3e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00363318  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2445  hypothetical protein  31.01 
 
 
162 aa  66.6  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349183  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3123  hypothetical protein  31.1 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.006821  normal  0.0439497 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3479  hypothetical protein  31.1 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2045  hypothetical protein  28.03 
 
 
171 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3375  hypothetical protein  30.77 
 
 
161 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.693838 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3382  putative cytoplasmic protein  30.77 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.963871 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2328  hypothetical protein  27.27 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3476  hypothetical protein  30.77 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.669725  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3308  putative cytoplasmic protein  30.77 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0280  hypothetical protein  29.01 
 
 
161 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3302  putative cytoplasmic protein  30.07 
 
 
161 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3031  type VI secretion system effector, Hcp1 family  30.15 
 
 
160 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350836  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0058  hypothetical protein  29.32 
 
 
172 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0938  protein of unknown function DUF796  28.24 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124942  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0019  hypothetical protein  28.77 
 
 
162 aa  51.6  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.965697  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05871  hypothetical protein  29.85 
 
 
166 aa  51.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000449  Hcp protein  29.85 
 
 
172 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000134513  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0157  hypothetical protein  27.4 
 
 
162 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01030  hypothetical protein  27.4 
 
 
162 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0441  type VI secretion system effector, Hcp1 family  26.43 
 
 
159 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0312  hypothetical protein  25.95 
 
 
172 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3906  hypothetical protein  25.95 
 
 
172 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0385  Hcp1 family type VI secretion system effector  25.95 
 
 
172 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2615  hcp protein  25.93 
 
 
171 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0191752 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3233  Hcp1 family type VI secretion system effector  25.95 
 
 
171 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0868  hcp protein  28.24 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0197  hypothetical protein  27.91 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5980  hypothetical protein  27.15 
 
 
162 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4082  hcp protein  25.93 
 
 
171 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000915297 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5435  secreted protein Hcp  28.03 
 
 
172 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2118  hypothetical protein  25.93 
 
 
171 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1588  hypothetical protein  25 
 
 
163 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00504704  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2324  hypothetical protein  28.57 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.233734  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1025  hcp protein  26.72 
 
 
172 aa  47  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2539  secreted protein Hcp  29.17 
 
 
171 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0301409  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1202  secreted protein Hcp-1 (haemolysin co-regulated protein)  26.52 
 
 
173 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26650  hypothetical protein  27.08 
 
 
160 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.410921  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1233  hypothetical protein  25.95 
 
 
172 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.189483 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2175  hypothetical protein  25.34 
 
 
178 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000201065  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1113  hcp  25.95 
 
 
172 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3060  Hcp1 family type VI secretion system effector  30.33 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1357  secreted protein Hcp-2 (haemolysin co-regulated protein)  26.12 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2983  hypothetical protein  30.33 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0116  hcp protein  26.72 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0180  hypothetical protein  25.95 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0249  hypothetical protein  25.19 
 
 
172 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02047  Hcp family protein  26.28 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106829  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0344  type VI secretion system effector, Hcp1 family  26.36 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1606  type VI secretion system effector, Hcp1 family  25.58 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2697  type VI secretion system effector, Hcp1 family  25.58 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.788661  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4256  type VI secretion system effector, Hcp1 family  26.36 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0829  hypothetical protein  26.52 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0241  hypothetical protein  25.19 
 
 
172 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4487  hypothetical protein  27.27 
 
 
172 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1188  secreted protein Hcp  26.61 
 
 
173 aa  45.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0243  hypothetical protein  25.19 
 
 
172 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0159  hypothetical protein  28.85 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354123  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2258  hypothetical protein  28.67 
 
 
176 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0708616  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0054  type VI secretion system effector, Hcp1 family  25.58 
 
 
172 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0647  type VI secretion system effector, Hcp1 family  25.58 
 
 
172 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3239  type VI secretion system effector, Hcp1 family  25.58 
 
 
172 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2558  type VI secretion system effector, Hcp1 family  24.81 
 
 
172 aa  44.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1501  type VI secretion system effector, Hcp1 family  24.81 
 
 
172 aa  44.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1163  type VI secretion system effector, Hcp1 family  24.81 
 
 
172 aa  44.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.838462  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0417  type VI secretion system effector, Hcp1 family  24.81 
 
 
172 aa  44.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2826  type VI secretion system effector, Hcp1 family  24.81 
 
 
172 aa  44.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1731  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0163556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1885  hypothetical protein  29.51 
 
 
190 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0109727  hitchhiker  0.0000606082 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4089  hypothetical protein  28.47 
 
 
161 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000825402 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0061  type VI secretion system effector, Hcp1 family  26.36 
 
 
172 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2362  type VI secretion system effector, Hcp1 family  25 
 
 
161 aa  43.9  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1247  secreted protein Hcp  25.76 
 
 
172 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3645  Hcp1 family type VI secretion system effector  24.38 
 
 
161 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265959  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3128  hypothetical protein  24.38 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03240  secreted protein Hcp  25.76 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000126332  hitchhiker  9.98491e-17 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43070  secreted protein Hcp  25.76 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000428975  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44890  secreted protein Hcp  25.76 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00654526  normal  0.188551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69560  secreted protein Hcp  25.76 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00260129  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1209  type VI secretion system effector, Hcp1 family  28.57 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3174  hcp protein  25.58 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4039  hypothetical protein  30.94 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999117  normal  0.702683 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5261  hypothetical protein  23.6 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2816  hypothetical protein  29.67 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7365  Hcp1 family type VI secretion system effector  26.02 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.22797 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2696  type VI secretion system effector, Hcp1 family  23.4 
 
 
159 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0548  protein of unknown function DUF796  27.04 
 
 
160 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3005  hypothetical protein  30.58 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3041  type VI secretion system effector, Hcp1 family  29.09 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3644  type VI secretion system effector, Hcp1 family  27.34 
 
 
159 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1465  hypothetical protein  24.37 
 
 
160 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6675  hypothetical protein  26.52 
 
 
160 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499457  normal  0.705135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2091  putative cytoplasmic protein  28.68 
 
 
160 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1346  hypothetical protein  24.81 
 
 
159 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1459  Hcp1 family type VI secretion system effector  24.81 
 
 
159 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.303873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>