125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5261 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5261  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  329  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0619  hypothetical protein  95.03 
 
 
161 aa  317  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0130418 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3645  Hcp1 family type VI secretion system effector  86.96 
 
 
161 aa  296  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265959  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0731  hypothetical protein  77.02 
 
 
163 aa  267  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2506  hypothetical protein  77.02 
 
 
163 aa  267  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0803  Hcp1 family type VI secretion system effector  77.02 
 
 
163 aa  267  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0782  hypothetical protein  76.4 
 
 
163 aa  267  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0171  hypothetical protein  76.4 
 
 
163 aa  265  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000104194 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2981  hypothetical protein  76.4 
 
 
163 aa  265  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000297859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3256  Hcp1 family type VI secretion system effector  78.12 
 
 
167 aa  264  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3128  hypothetical protein  75.62 
 
 
163 aa  259  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1788  hypothetical protein  76.4 
 
 
163 aa  249  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0159  hypothetical protein  54.09 
 
 
161 aa  196  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354123  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2816  hypothetical protein  55.35 
 
 
161 aa  194  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3004  hypothetical protein  51.97 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00118578  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3174  hcp protein  36.71 
 
 
161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2328  hypothetical protein  37.35 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0868  hcp protein  36.65 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5435  secreted protein Hcp  38.32 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2045  hypothetical protein  36.14 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0280  hypothetical protein  35.8 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03240  secreted protein Hcp  37.95 
 
 
172 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000126332  hitchhiker  9.98491e-17 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43070  secreted protein Hcp  37.95 
 
 
172 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000428975  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44890  secreted protein Hcp  37.95 
 
 
172 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00654526  normal  0.188551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69560  secreted protein Hcp  37.95 
 
 
172 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00260129  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1247  secreted protein Hcp  37.35 
 
 
172 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1025  hcp protein  35.54 
 
 
172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0116  hcp protein  34.94 
 
 
172 aa  115  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0829  hypothetical protein  36.31 
 
 
166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0180  hypothetical protein  32.53 
 
 
172 aa  113  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4487  hypothetical protein  32.53 
 
 
172 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2514  Hcp1 family type VI secretion system effector  31.55 
 
 
172 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.908248  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2118  hypothetical protein  34.32 
 
 
171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0312  hypothetical protein  33.53 
 
 
172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3906  hypothetical protein  33.53 
 
 
172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0385  Hcp1 family type VI secretion system effector  33.53 
 
 
172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4082  hcp protein  34.32 
 
 
171 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000915297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2615  hcp protein  34.32 
 
 
171 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0191752 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3233  Hcp1 family type VI secretion system effector  30.72 
 
 
171 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0019  hypothetical protein  31.65 
 
 
162 aa  104  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.965697  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4256  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.53 
 
 
172 aa  103  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0344  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.53 
 
 
172 aa  103  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0417  type VI secretion system effector, Hcp1 family  30.12 
 
 
172 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1153  Hcp1 family type VI secretion system effector  30.36 
 
 
171 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.465729  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2558  type VI secretion system effector, Hcp1 family  30.12 
 
 
172 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2826  type VI secretion system effector, Hcp1 family  30.12 
 
 
172 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1501  type VI secretion system effector, Hcp1 family  30.12 
 
 
172 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1163  type VI secretion system effector, Hcp1 family  30.12 
 
 
172 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.838462  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0241  hypothetical protein  33.57 
 
 
172 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0243  hypothetical protein  33.57 
 
 
172 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0061  type VI secretion system effector, Hcp1 family  31.14 
 
 
172 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1113  hcp  34.27 
 
 
172 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1233  hypothetical protein  34.27 
 
 
172 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.189483 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0249  hypothetical protein  33.57 
 
 
172 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1606  type VI secretion system effector, Hcp1 family  30.72 
 
 
172 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2697  type VI secretion system effector, Hcp1 family  30.72 
 
 
172 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.788661  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3239  type VI secretion system effector, Hcp1 family  31.74 
 
 
172 aa  101  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0647  type VI secretion system effector, Hcp1 family  31.14 
 
 
172 aa  101  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0054  type VI secretion system effector, Hcp1 family  30.12 
 
 
172 aa  101  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1195  hypothetical protein  30.95 
 
 
172 aa  100  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1182  hypothetical protein  30.95 
 
 
172 aa  100  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1211  hypothetical protein  30.95 
 
 
172 aa  100  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0058  hypothetical protein  29.52 
 
 
172 aa  97.4  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1188  secreted protein Hcp  29.17 
 
 
173 aa  93.6  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_35  secreted protein Hcp-2 (haemolysin co-regulated protein)  29.17 
 
 
172 aa  87.4  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1588  hypothetical protein  29.49 
 
 
163 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00504704  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2539  secreted protein Hcp  30.32 
 
 
171 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0301409  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1357  secreted protein Hcp-2 (haemolysin co-regulated protein)  27.98 
 
 
172 aa  84.7  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000449  Hcp protein  29.34 
 
 
172 aa  84  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000134513  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1202  secreted protein Hcp-1 (haemolysin co-regulated protein)  27.54 
 
 
173 aa  83.6  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05871  hypothetical protein  28.86 
 
 
166 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0013  secreted protein Hcp, potential oxidative stress protein  31.87 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0533  type VI secretion system effector, Hcp1 family  30.39 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2962  hypothetical protein  30.88 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2928  Hcp1 family type VI secretion system effector  30.15 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0546725  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3561  hypothetical protein  29.41 
 
 
167 aa  67  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00586235  normal  0.966398 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2637  hypothetical protein  29.41 
 
 
167 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0034666  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0383  hypothetical protein  29.41 
 
 
167 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.211293  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0469  hypothetical protein  29.41 
 
 
167 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000529011  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0447  Hcp1 family type VI secretion system effector  29.41 
 
 
167 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0406517  normal  0.642596 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0404  Hcp1 family type VI secretion system effector  29.41 
 
 
167 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000425347  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3642  hypothetical protein  30.88 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0878118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3633  hypothetical protein  30.88 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3658  hypothetical protein  30.88 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2175  hypothetical protein  28.95 
 
 
178 aa  62  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000201065  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4915  type VI secretion system effector, Hcp1 family  27.97 
 
 
167 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00101993  hitchhiker  0.00306602 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7365  Hcp1 family type VI secretion system effector  24.68 
 
 
166 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.22797 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2696  type VI secretion system effector, Hcp1 family  29.8 
 
 
159 aa  53.9  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2983  hypothetical protein  25.34 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3060  Hcp1 family type VI secretion system effector  25.34 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3506  type VI secretion system effector, Hcp1 family  26.76 
 
 
159 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5212  hypothetical protein  23.08 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3644  type VI secretion system effector, Hcp1 family  26.67 
 
 
159 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1885  hypothetical protein  25.34 
 
 
190 aa  52  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0109727  hitchhiker  0.0000606082 
 
 
-
 
NC_003296  RS01963  hypothetical protein  26.45 
 
 
167 aa  51.2  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.229622  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0742  hypothetical protein  26.38 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0853186  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0535  hypothetical protein  26.38 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0606  hypothetical protein  26.38 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2125  hcp protein  26.38 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.579935  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2027  hcp protein  26.38 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>