More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2549 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  92.67 
 
 
463 aa  854  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  99.14 
 
 
463 aa  930  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  80.8 
 
 
465 aa  731  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  100 
 
 
463 aa  935  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  95.78 
 
 
463 aa  879  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  80.22 
 
 
465 aa  729  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  78.22 
 
 
463 aa  726  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3223  FAD dependent oxidoreductase  68.81 
 
 
465 aa  610  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188463  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  65.15 
 
 
491 aa  609  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  64.94 
 
 
521 aa  605  1e-172  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  65.15 
 
 
462 aa  607  1e-172  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  64.58 
 
 
462 aa  605  1e-172  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  64.94 
 
 
462 aa  606  1e-172  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  64.15 
 
 
462 aa  600  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  1.45397e-07 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  64 
 
 
462 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  63.85 
 
 
463 aa  582  1e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  55.12 
 
 
466 aa  508  1e-142  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  54.03 
 
 
466 aa  493  1e-138  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  45.09 
 
 
466 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  44.98 
 
 
486 aa  338  1e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  42.61 
 
 
473 aa  300  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  41.91 
 
 
470 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3646  hypothetical protein  40.9 
 
 
469 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0271589 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0634  FAD dependent oxidoreductase  36.32 
 
 
476 aa  252  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  34.35 
 
 
454 aa  203  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  34.22 
 
 
463 aa  201  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  36.39 
 
 
496 aa  197  5e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  32.06 
 
 
472 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  32.23 
 
 
464 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  35.55 
 
 
462 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  34.79 
 
 
482 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  34.26 
 
 
466 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  34.95 
 
 
460 aa  185  2e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  33.7 
 
 
473 aa  185  2e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  34.27 
 
 
460 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  34.11 
 
 
460 aa  183  5e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  33.18 
 
 
473 aa  183  7e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 
465 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  33.68 
 
 
476 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  34.51 
 
 
462 aa  180  6e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  33.19 
 
 
480 aa  179  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  32.56 
 
 
466 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  33.47 
 
 
468 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  31.78 
 
 
460 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  33.92 
 
 
464 aa  177  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  33.92 
 
 
477 aa  175  1e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  33.63 
 
 
464 aa  174  2e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 
459 aa  174  3e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  33.7 
 
 
468 aa  173  7e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 
460 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  31.87 
 
 
439 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  32.96 
 
 
475 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  31.87 
 
 
439 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  31.78 
 
 
474 aa  171  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  32.93 
 
 
462 aa  169  9e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  32.21 
 
 
464 aa  167  3e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  32.57 
 
 
460 aa  167  3e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 
441 aa  167  3e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 
466 aa  167  3e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  34.59 
 
 
468 aa  166  7e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 
456 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 
456 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  33.78 
 
 
475 aa  166  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 
480 aa  165  1e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 
443 aa  164  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  32.37 
 
 
431 aa  164  4e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 
457 aa  164  4e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  31.24 
 
 
483 aa  164  4e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  30.45 
 
 
433 aa  163  5e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  32.04 
 
 
437 aa  163  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 
437 aa  163  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  33.07 
 
 
438 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 
463 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.36 
 
 
426 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.36 
 
 
426 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 
426 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.36 
 
 
426 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  32.36 
 
 
426 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  32.36 
 
 
426 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 
426 aa  161  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 
426 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.1 
 
 
426 aa  160  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  32.03 
 
 
487 aa  159  8e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.36 
 
 
426 aa  159  9e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  31.65 
 
 
431 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  30.88 
 
 
457 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  34.15 
 
 
468 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 
427 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 
431 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 
423 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 
427 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 
472 aa  156  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 
456 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  28.24 
 
 
427 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 
444 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  30.84 
 
 
431 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  31.57 
 
 
433 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  32.52 
 
 
468 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 
453 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 
425 aa  154  3e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>