120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_82790 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_08201  component of the holoenzyme form of RNA polymerase transcription factor (Eurofung)  63.13 
 
 		 818 aa  1035    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0920251 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05940  general RNA polymerase II transcription factor, putative  55.61 
 
 		 866 aa  898    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.687804  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82790  DNA helicase  100 
 
 		 838 aa  1748    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34480  predicted protein  53.32 
 
 		 781 aa  771    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20574  predicted protein  51.41 
 
 		 720 aa  734    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000077682  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  31.21 
 
 		 549 aa  301  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  31.27 
 
 		 551 aa  302  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  29.92 
 
 		 558 aa  292  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  31.79 
 
 		 590 aa  290  5.0000000000000004e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.31 
 
 		 558 aa  282  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  30.2 
 
 		 548 aa  279  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  29.8 
 
 		 554 aa  278  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3950  helicase domain-containing protein  29.55 
 
 		 581 aa  277  5e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  30.83 
 
 		 557 aa  277  7e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0809  type III restriction protein res subunit  30.46 
 
 		 556 aa  276  8e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  29.9 
 
 		 548 aa  275  3e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.71 
 
 		 550 aa  275  3e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  29.62 
 
 		 550 aa  273  9e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4341  helicase domain-containing protein  29.55 
 
 		 559 aa  273  9e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3947  helicase domain-containing protein  29.95 
 
 		 546 aa  272  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.22 
 
 		 548 aa  271  5e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  30.25 
 
 		 548 aa  269  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4400  helicase-like  30.39 
 
 		 545 aa  269  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  28.5 
 
 		 561 aa  268  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  28.76 
 
 		 548 aa  268  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4485  type III restriction enzyme, res subunit  30.62 
 
 		 549 aa  267  5e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4572  type III restriction enzyme, res subunit  30.62 
 
 		 549 aa  267  5e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0637895 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4868  type III restriction enzyme, res subunit  30.62 
 
 		 549 aa  267  5e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  28.27 
 
 		 558 aa  267  7e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  31.16 
 
 		 551 aa  267  7e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1697  type III restriction enzyme, res subunit  30.28 
 
 		 549 aa  263  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  37.07 
 
 		 555 aa  263  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0173  helicase domain-containing protein  29.41 
 
 		 545 aa  261  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0878922 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  29.64 
 
 		 548 aa  261  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5056  type III restriction enzyme, res subunit  30.1 
 
 		 549 aa  260  6e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  28.43 
 
 		 550 aa  259  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10878  DNA helicase ercc3  30 
 
 		 542 aa  257  8e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000621155  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1210  helicase domain protein  29.39 
 
 		 555 aa  254  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  36.17 
 
 		 548 aa  248  4e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  37.14 
 
 		 602 aa  244  5e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  28.2 
 
 		 564 aa  241  5e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  29.67 
 
 		 658 aa  184  5.0000000000000004e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  27.8 
 
 		 666 aa  171  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  29.24 
 
 		 630 aa  156  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  27.8 
 
 		 649 aa  152  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  29.09 
 
 		 491 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  26.75 
 
 		 551 aa  140  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  27.25 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  26.75 
 
 		 531 aa  135  3.9999999999999996e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  27.1 
 
 		 444 aa  131  6e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  26.85 
 
 		 443 aa  120  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  27.8 
 
 		 444 aa  119  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  26.42 
 
 		 479 aa  119  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  26.39 
 
 		 517 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  26.04 
 
 		 499 aa  118  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  28.3 
 
 		 466 aa  117  8.999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  27.54 
 
 		 470 aa  117  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  27.1 
 
 		 466 aa  114  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  25.44 
 
 		 440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  26.17 
 
 		 488 aa  111  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  25.55 
 
 		 468 aa  110  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  25.66 
 
 		 590 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  26.91 
 
 		 449 aa  109  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  25.34 
 
 		 479 aa  109  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  28.23 
 
 		 462 aa  107  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  24.79 
 
 		 654 aa  105  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  24.57 
 
 		 494 aa  104  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  25.37 
 
 		 456 aa  103  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  26.37 
 
 		 531 aa  103  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  26.62 
 
 		 509 aa  102  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  24.81 
 
 		 652 aa  101  5e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  26.75 
 
 		 509 aa  100  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  25.79 
 
 		 451 aa  100  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  26.46 
 
 		 451 aa  97.1  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  23.85 
 
 		 479 aa  96.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  23.68 
 
 		 485 aa  94.7  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  23.68 
 
 		 485 aa  94.7  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  23.59 
 
 		 479 aa  94.4  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  23.82 
 
 		 479 aa  94  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  25.79 
 
 		 451 aa  93.6  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  23.44 
 
 		 650 aa  93.2  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  23.3 
 
 		 463 aa  91.7  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  23.77 
 
 		 479 aa  90.5  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  24.53 
 
 		 647 aa  90.1  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.27 
 
 		 633 aa  84  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  24.51 
 
 		 630 aa  82  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  27.8 
 
 		 455 aa  72.4  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  24.06 
 
 		 464 aa  66.6  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  23.08 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  24.54 
 
 		 795 aa  58.9  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  25.07 
 
 		 581 aa  58.2  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0822  helicase domain-containing protein  22.58 
 
 		 886 aa  54.7  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  24.68 
 
 		 951 aa  54.7  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  21.38 
 
 		 809 aa  54.3  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  21.38 
 
 		 809 aa  54.3  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  25.87 
 
 		 920 aa  53.9  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  23.46 
 
 		 979 aa  53.5  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  24.09 
 
 		 796 aa  52  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  20.74 
 
 		 925 aa  50.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  24.2 
 
 		 796 aa  50.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>