More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_41413 on replicon NC_011698
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011698  PHATRDRAFT_41413  predicted protein  100 
 
 
377 aa  775    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.659296  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  40.84 
 
 
334 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.01 
 
 
335 aa  187  3e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  39.62 
 
 
334 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4195  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.91 
 
 
334 aa  186  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.03 
 
 
333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  39.46 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  41.03 
 
 
333 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  41.03 
 
 
333 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  37.54 
 
 
386 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.28 
 
 
335 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2135  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.65 
 
 
344 aa  172  9e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06817  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_7G04530)  34.09 
 
 
353 aa  170  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.369571 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4889  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.23 
 
 
347 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2291  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.54 
 
 
338 aa  165  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.312969 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2673  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.62 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2718  alcohol dehydrogenase  37.62 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00325052  normal  0.0915296 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3719  alcohol dehydrogenase  38.22 
 
 
338 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4558  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.22 
 
 
338 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3805  alcohol dehydrogenase  38.22 
 
 
338 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2704  alcohol dehydrogenase  37.62 
 
 
343 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.335803  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2188  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.51 
 
 
347 aa  162  9e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.357964  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2249  alcohol dehydrogenase  36.61 
 
 
339 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4094  alcohol dehydrogenase  35.81 
 
 
347 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal  0.466223 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0381  alcohol dehydrogenase  34.92 
 
 
340 aa  155  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.9 
 
 
341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5327  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.24 
 
 
335 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0585  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.37 
 
 
344 aa  152  8e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.56281  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1876  putative oxidoreductase  36.74 
 
 
337 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0365812  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3707  alcohol dehydrogenase  38.22 
 
 
338 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.226872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5531  alcohol dehydrogenase  38.22 
 
 
338 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2927  alcohol dehydrogenase  38.01 
 
 
334 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1158  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.06 
 
 
338 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2218  alcohol dehydrogenase  36.11 
 
 
333 aa  149  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2257  alcohol dehydrogenase  36.11 
 
 
333 aa  149  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0563  alcohol dehydrogenase  34.74 
 
 
332 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.0336788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.1 
 
 
349 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2179  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.72 
 
 
338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127497  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.1 
 
 
334 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3317  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.62 
 
 
336 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0428  alcohol dehydrogenase  37.06 
 
 
334 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6896  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.29 
 
 
346 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00938562  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2386  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.2 
 
 
341 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.625543  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 
332 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0373  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.96 
 
 
334 aa  142  9e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.317567  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3459  alcohol dehydrogenase  35.62 
 
 
339 aa  142  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.39 
 
 
334 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000493623  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17140  predicted NADP-dependent oxidoreductase  36.69 
 
 
336 aa  142  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0314613  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3134  alcohol dehydrogenase  34.55 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374024  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2648  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  35.42 
 
 
422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446063  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.91 
 
 
337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.39 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.27647 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2509  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.42 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2145  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.47 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25360  predicted NADP-dependent oxidoreductase  36.31 
 
 
339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.50036  normal  0.987423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.63 
 
 
332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1579  alcohol dehydrogenase  32.8 
 
 
331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0936386 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2983  hypothetical protein  37.3 
 
 
332 aa  140  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0247  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  35.11 
 
 
338 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1846  alcohol dehydrogenase  32.97 
 
 
338 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02530  predicted NADP-dependent oxidoreductase  34.7 
 
 
332 aa  139  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0491149  normal  0.895622 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11258  YfmJ  30.77 
 
 
331 aa  139  7.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.780208  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0294  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.17 
 
 
338 aa  139  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0941  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  35.11 
 
 
406 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0284  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  35.11 
 
 
479 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  35.11 
 
 
427 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1628  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  35.11 
 
 
469 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1674  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
332 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.568438  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1518  alcohol dehydrogenase  32.48 
 
 
331 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0829184  normal  0.0167196 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1097  alcohol dehydrogenase  28.81 
 
 
337 aa  138  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0525  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  35.42 
 
 
338 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1585  alcohol dehydrogenase  32.48 
 
 
331 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114628  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1102  alcohol dehydrogenase  35.47 
 
 
332 aa  137  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0826967  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.65 
 
 
344 aa  136  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6181  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.71 
 
 
338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.128263 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.37 
 
 
337 aa  136  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.58 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3535  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.2 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0909  alcohol dehydrogenase  32.15 
 
 
330 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2132  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.39 
 
 
338 aa  134  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2403  alcohol dehydrogenase  31.27 
 
 
332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.37265 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 
334 aa  133  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2759  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3516  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.6 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  31.03 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03835  predicted NADP-dependent oxidoreductase  29.45 
 
 
332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0444273  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3414  alcohol dehydrogenase  34.19 
 
 
334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2565  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.92 
 
 
338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164505  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2060  alcohol dehydrogenase  32.88 
 
 
332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.881671  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1786  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.53 
 
 
334 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67922  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15930  predicted NADP-dependent oxidoreductase  34.5 
 
 
336 aa  130  5.0000000000000004e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1808  alcohol dehydrogenase  34.47 
 
 
332 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  31.7 
 
 
332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0105  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.52 
 
 
337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.778561  normal  0.320434 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  31.91 
 
 
343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4613  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.65 
 
 
340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.714391 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3852  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.88 
 
 
339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.291549  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3364  alcohol dehydrogenase  33.01 
 
 
332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.357267  normal  0.197117 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1209  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.19 
 
 
339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000799112 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.46 
 
 
336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>