More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_41063 on replicon NC_011695
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011695  PHATRDRAFT_41063  predicted protein  100 
 
 
174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.123824  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  40.38 
 
 
442 aa  75.5  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  38.53 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  42.86 
 
 
442 aa  71.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  39.05 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  42.86 
 
 
442 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  37.84 
 
 
443 aa  69.3  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  43.81 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  39.05 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  43.81 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  38.1 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  39.81 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  35.86 
 
 
447 aa  68.2  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0300  Phosphoglycerate mutase  42.06 
 
 
197 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  38.83 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  40.95 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  38.83 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1088  Phosphoglycerate mutase  44.34 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  35.58 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  36.28 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  38.83 
 
 
445 aa  65.1  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  38.83 
 
 
227 aa  64.7  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1756  phosphoglycerate mutase-like protein  32.69 
 
 
219 aa  64.7  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.14183 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.23 
 
 
442 aa  64.7  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  38.83 
 
 
448 aa  64.3  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  37.93 
 
 
442 aa  64.3  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 
194 aa  64.3  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  39.81 
 
 
200 aa  64.3  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.23 
 
 
442 aa  63.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3374  Phosphoglycerate mutase  46.75 
 
 
189 aa  63.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.0226984 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1141  phosphoglycerate mutase  39.47 
 
 
197 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1313  phosphoglycerate mutase  40.35 
 
 
202 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  40.19 
 
 
213 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  34.95 
 
 
227 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  35.92 
 
 
226 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  45.59 
 
 
444 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  36.94 
 
 
224 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  36.07 
 
 
217 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  49.21 
 
 
459 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0069  broad-specificity phosphatase PhoE  41.58 
 
 
197 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  35.92 
 
 
226 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  41.54 
 
 
207 aa  62.4  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  46.27 
 
 
448 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  43.42 
 
 
442 aa  61.6  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  35.24 
 
 
198 aa  61.6  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 
192 aa  61.6  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  35.92 
 
 
452 aa  61.2  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1020  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 
196 aa  61.2  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 
221 aa  61.2  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  38.74 
 
 
197 aa  60.8  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10190  fructose-2,6-bisphosphatase  40.37 
 
 
221 aa  60.8  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.149459  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  33.01 
 
 
447 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  50 
 
 
218 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  36.36 
 
 
189 aa  60.1  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.84 
 
 
197 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 
198 aa  59.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  37.96 
 
 
210 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  39.82 
 
 
198 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
196 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  36.27 
 
 
189 aa  58.9  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 
208 aa  58.5  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
196 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  40.95 
 
 
205 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  38.1 
 
 
223 aa  58.2  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  36.89 
 
 
214 aa  57.8  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  36.89 
 
 
214 aa  57.8  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  37.14 
 
 
214 aa  57.8  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  34.17 
 
 
198 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  39.32 
 
 
213 aa  57.8  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0536  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 
196 aa  57.8  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  38.83 
 
 
212 aa  57.4  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  37.96 
 
 
224 aa  57.8  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1393  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
197 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960696  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  39.05 
 
 
214 aa  57.4  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  37.61 
 
 
196 aa  57  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  38.83 
 
 
240 aa  57  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 
210 aa  56.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 
213 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1881  Phosphoglycerate mutase  32.69 
 
 
203 aa  56.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8222  phosphoglyceromutase  42.86 
 
 
251 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
195 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0606  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
218 aa  56.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2908  Phosphoglycerate mutase  34.31 
 
 
219 aa  56.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  40.95 
 
 
218 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0429  phosphoglycerate mutase family protein  33.64 
 
 
217 aa  56.6  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  36.04 
 
 
197 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  35.51 
 
 
215 aa  55.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  36.54 
 
 
215 aa  55.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  46.15 
 
 
190 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  40.2 
 
 
212 aa  55.8  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  35.14 
 
 
194 aa  56.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3403  aminotransferase class I and II  39.81 
 
 
188 aa  55.5  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0624643  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 
214 aa  55.5  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  32.74 
 
 
197 aa  55.5  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  33.64 
 
 
211 aa  55.5  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  36.19 
 
 
196 aa  55.1  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  38.83 
 
 
181 aa  55.5  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  36.11 
 
 
195 aa  55.5  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  37.14 
 
 
203 aa  55.1  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>