267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_39403 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_39403  predicted protein  100 
 
 
263 aa  539  9.999999999999999e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.676878  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  36.7 
 
 
114 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  35.85 
 
 
113 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1047  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
121 aa  64.7  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.439434  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  35.51 
 
 
112 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  35.85 
 
 
113 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  32.38 
 
 
113 aa  63.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
114 aa  63.2  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  34.29 
 
 
123 aa  62.8  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  30.48 
 
 
114 aa  62  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 
114 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  31.43 
 
 
114 aa  61.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  32.41 
 
 
116 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  31.78 
 
 
114 aa  60.1  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5553  histidine triad (HIT) protein  30.7 
 
 
120 aa  59.7  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555493  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  33.98 
 
 
114 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1581  histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 
114 aa  58.9  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 
114 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  32.38 
 
 
114 aa  58.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
121 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0455  HIT domain-containing protein  38.89 
 
 
113 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.378719  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2653  histidine triad (HIT) protein  32.71 
 
 
114 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3216  histidine triad (HIT) protein  35.51 
 
 
114 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000109851  hitchhiker  0.0000000041955 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  31.73 
 
 
113 aa  57.4  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  30.36 
 
 
114 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_397  HIT domain protein  37.5 
 
 
113 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.647527  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  32.04 
 
 
114 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  32.38 
 
 
367 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  30.48 
 
 
116 aa  57  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  32.38 
 
 
114 aa  56.6  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  32.69 
 
 
115 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0432  histidine triad (HIT) protein  40.85 
 
 
113 aa  56.6  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  34.95 
 
 
112 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  32.38 
 
 
114 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
115 aa  56.2  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1179  histidine triad (HIT) protein  30 
 
 
119 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2381  histidine triad (HIT) protein  34.17 
 
 
125 aa  56.2  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.116169  normal  0.191 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0315  histidine triad (HIT) protein  33.65 
 
 
112 aa  56.2  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130359 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  31.43 
 
 
114 aa  55.8  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1295  HIT family protein  30.48 
 
 
116 aa  55.8  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  34.95 
 
 
112 aa  55.8  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  35.92 
 
 
112 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  32.74 
 
 
113 aa  55.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1705  HIT family protein  34.82 
 
 
112 aa  54.7  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  31.43 
 
 
114 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01700  HIT family protein  30.43 
 
 
129 aa  55.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127711  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1679  histidine triad (HIT) protein  33.61 
 
 
124 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0702  histidine triad (HIT) protein  30 
 
 
118 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  36.04 
 
 
141 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  29.25 
 
 
116 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0740  histidine triad (HIT) protein  32.69 
 
 
126 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66623  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1856  histidine triad (HIT) protein  31.15 
 
 
124 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.474639  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  28.7 
 
 
115 aa  53.9  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.429773  normal  0.93129 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004003  HIT family hydrolase  29.52 
 
 
116 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  33.01 
 
 
112 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0860  histidine triad (HIT) protein  30.63 
 
 
119 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  31.78 
 
 
114 aa  53.9  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  29.91 
 
 
114 aa  53.1  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2189  histidine triad (HIT) protein  32.08 
 
 
119 aa  53.1  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2566  histidine triad (HIT) protein  32.52 
 
 
125 aa  53.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  30.48 
 
 
113 aa  53.1  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  36.04 
 
 
141 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  31.25 
 
 
120 aa  53.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3057  histidine triad (HIT) protein  30 
 
 
115 aa  53.1  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.750318  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0811  histidine triad (HIT) protein  27.27 
 
 
117 aa  52.8  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01519  hypothetical protein  28.57 
 
 
116 aa  52.8  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  29.36 
 
 
135 aa  52.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1430  HIT family hydrolase  29.81 
 
 
111 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3592  histidine triad (HIT) protein  30.43 
 
 
120 aa  52.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  28.04 
 
 
140 aa  52.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01311  HIT (histidine triad) family protein  29.81 
 
 
111 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4573  histidine triad (HIT) protein  33.98 
 
 
112 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2955  histidine triad (HIT) protein  28.8 
 
 
123 aa  52.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.550959  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  28.04 
 
 
118 aa  52.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1423  histidine triad (HIT) protein  28.83 
 
 
111 aa  52  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1687  HIT family protein  27.68 
 
 
129 aa  51.6  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  35 
 
 
137 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0600  HIT family protein  33.98 
 
 
112 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5107  histidine triad (HIT) protein  32.04 
 
 
126 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484505  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  28.3 
 
 
115 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13460  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  29.91 
 
 
118 aa  51.6  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.216687 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1591  histidine triad (HIT) protein  42.31 
 
 
129 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  28.04 
 
 
113 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03141  HIT (histidine triad) family protein  24.44 
 
 
146 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1052  histidine triad (HIT) protein  27.27 
 
 
132 aa  51.6  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1125  HIT family protein  30.43 
 
 
122 aa  51.2  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17260  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  29.73 
 
 
124 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219207  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00741  HIT (histidine triad) family protein  28.16 
 
 
113 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.39075  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  29.63 
 
 
115 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1883  histidine triad (HIT) protein  31.25 
 
 
118 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1152  histidine triad domain-containing protein  32.69 
 
 
113 aa  50.8  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0864  adenosine 5'-monophosphoramidase  32.69 
 
 
113 aa  50.8  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1522  histidine triad (HIT) protein  30.43 
 
 
117 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0679  histidine triad (HIT) protein  30.65 
 
 
123 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.778303  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0788  histidine triad (HIT) protein  32.38 
 
 
113 aa  51.2  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.927193  normal  0.0285897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1829  putative HIT family protein  31.48 
 
 
145 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2038  histidine triad (HIT) protein  31.07 
 
 
126 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923798  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1487  histidine triad family protein  28.57 
 
 
116 aa  50.1  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.194182  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00761  HIT (histidine triad) family protein  27.62 
 
 
113 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0278345  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0115  histidine triad (HIT) protein  29.46 
 
 
118 aa  50.4  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>