More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_36359 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_36359  predicted protein  100 
 
 
266 aa  549  1e-155  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.091025  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  41.32 
 
 
239 aa  206  4e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  43.62 
 
 
260 aa  205  7e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  41.25 
 
 
252 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1199  undecaprenyl diphosphate synthase  43.22 
 
 
244 aa  202  5e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  42.68 
 
 
260 aa  201  8e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3193  undecaprenyl diphosphate synthase  41.32 
 
 
250 aa  201  8e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0231414 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  43.21 
 
 
260 aa  201  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  43.21 
 
 
260 aa  201  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  43.21 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  43.21 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  43.21 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  43.21 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  43.21 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1279  undecaprenyl diphosphate synthase  42.8 
 
 
225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.8 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  41.74 
 
 
248 aa  199  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  42.8 
 
 
260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  42.8 
 
 
260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  42.8 
 
 
260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  42.8 
 
 
260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  41.98 
 
 
260 aa  199  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.11 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.53 
 
 
267 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2592  undecaprenyl diphosphate synthase  40.51 
 
 
238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.427666  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1447  undecaprenyl diphosphate synthase  42.55 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  43.83 
 
 
249 aa  196  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.27 
 
 
252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.67 
 
 
252 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  41.91 
 
 
234 aa  195  7e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  40.8 
 
 
254 aa  195  8.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  44.21 
 
 
244 aa  194  9e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1526  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.95 
 
 
250 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00254317  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45 
 
 
255 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  40 
 
 
240 aa  194  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  42.13 
 
 
236 aa  193  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.64 
 
 
252 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  42.44 
 
 
232 aa  193  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.54 
 
 
251 aa  192  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.11 
 
 
249 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.55 
 
 
261 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.8 
 
 
256 aa  192  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  42.55 
 
 
254 aa  192  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  40.85 
 
 
257 aa  192  7e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  40.33 
 
 
260 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.8 
 
 
259 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.32 
 
 
251 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.98 
 
 
249 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  41.32 
 
 
251 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.950032  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.96 
 
 
252 aa  190  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.44 
 
 
249 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  46.28 
 
 
254 aa  190  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2457  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.04 
 
 
241 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413258 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.33 
 
 
260 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09951  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.65 
 
 
265 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.99 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  42.02 
 
 
251 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  42.46 
 
 
255 aa  189  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.51 
 
 
267 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.5 
 
 
252 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  39.92 
 
 
260 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  41.67 
 
 
251 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  41.84 
 
 
264 aa  188  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0518  undecaprenyl diphosphate synthase  45.99 
 
 
280 aa  188  7e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  40.32 
 
 
257 aa  188  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.68 
 
 
254 aa  188  9e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.33 
 
 
258 aa  187  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  41.15 
 
 
251 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.49 
 
 
252 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1105  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.41 
 
 
251 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177859  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  40.85 
 
 
236 aa  187  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2675  undecaprenyl diphosphate synthase  38.93 
 
 
242 aa  187  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.93656  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  42.02 
 
 
251 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  41.15 
 
 
251 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.26 
 
 
254 aa  187  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  42.02 
 
 
245 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.71 
 
 
266 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.41 
 
 
249 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2801  undecaprenyl diphosphate synthase  42 
 
 
259 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0010789  normal  0.698237 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1408  undecaprenyl pyrophosphate synthetase protein  39.67 
 
 
258 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.07 
 
 
260 aa  186  3e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0355  undecaprenyl diphosphate synthase  40.85 
 
 
236 aa  186  3e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.580646  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1282  undecaprenyl diphosphate synthase  40.16 
 
 
258 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.222938 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  43.03 
 
 
266 aa  186  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1346  undecaprenyl diphosphate synthase  40.16 
 
 
258 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0661425  normal  0.552617 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  40 
 
 
256 aa  186  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1533  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.75 
 
 
252 aa  186  5e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.554505  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1746  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.46 
 
 
253 aa  185  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  39.59 
 
 
265 aa  185  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  39.83 
 
 
251 aa  186  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  41.1 
 
 
228 aa  185  7e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1712  undecaprenyl diphosphate synthase  38.37 
 
 
252 aa  185  7e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.6 
 
 
246 aa  185  8e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1193  undecaprenyl diphosphate synthase  40.51 
 
 
238 aa  184  9e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000857215  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  41.7 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  38.84 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1126  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.8 
 
 
243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.3 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38950  undecaprenyl diphosphate synthase  42.15 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.522438  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  40.66 
 
 
240 aa  184  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>