More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_23646 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_23646  predicted protein  100 
 
 		 648 aa  1329    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16391  predicted protein  72.77 
 
 		 590 aa  808    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.87 
 
 		 685 aa  625  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3001  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.6 
 
 		 676 aa  626  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0623369  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04557  mitochondrial inner membrane AAA protease Yta12, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02680)  50.08 
 
 		 883 aa  617  1e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34770  Mitochondrial respiratory chain complexes assembly protein RCA1 (TAT-binding homolog 12)  50.55 
 
 		 867 aa  615  1e-175  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00577984  normal  0.0143281 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0030  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.16 
 
 		 696 aa  611  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.876867  normal  0.384468 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05140  ATPase, putative  51.66 
 
 		 817 aa  600  1e-170  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0164604  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0466  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.8 
 
 		 673 aa  599  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0613  cell division protein, ATP-dependent metalloprotease  51.61 
 
 		 692 aa  600  1e-170  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  52.01 
 
 		 691 aa  595  1e-169  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13471  predicted protein  61.34 
 
 		 476 aa  586  1e-166  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155639  normal  0.170565 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82096  AAA+-type ATPase  48.01 
 
 		 787 aa  572  1.0000000000000001e-162  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.176589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.65 
 
 		 697 aa  549  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07931  putative transmembrane AAA-metalloprotease FtsH  49.43 
 
 		 691 aa  543  1e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1654  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.17 
 
 		 652 aa  527  1e-148  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0047  cell division protein FtsH, putative  56.34 
 
 		 673 aa  522  1e-147  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2600  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.86 
 
 		 641 aa  523  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.82 
 
 		 697 aa  508  9.999999999999999e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.12 
 
 		 694 aa  490  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.4836  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.22 
 
 		 639 aa  482  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.22 
 
 		 602 aa  483  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.64 
 
 		 647 aa  483  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4465  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.71 
 
 		 610 aa  480  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08270  ATP-dependent metallopeptidase M41, FtsH  52.16 
 
 		 616 aa  478  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.6 
 
 		 616 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0123  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.74 
 
 		 699 aa  477  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0078  peptidase M41, FtsH  48.64 
 
 		 706 aa  476  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0143352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0007  peptidase M41, FtsH  48.55 
 
 		 699 aa  478  1e-133  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.6 
 
 		 616 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  53.28 
 
 		 627 aa  476  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2678  FtsH-2 peptidase  47.37 
 
 		 694 aa  478  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  51.05 
 
 		 641 aa  474  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.14 
 
 		 686 aa  475  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.84 
 
 		 615 aa  472  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.02 
 
 		 653 aa  475  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0873  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.27 
 
 		 645 aa  470  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0168176  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.5 
 
 		 631 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.55 
 
 		 651 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  51.6 
 
 		 615 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.17 
 
 		 616 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  47.83 
 
 		 638 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.21 
 
 		 714 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  50.84 
 
 		 628 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.21 
 
 		 696 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.53 
 
 		 630 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  49.28 
 
 		 646 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.72 
 
 		 630 aa  468  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.53 
 
 		 646 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.74 
 
 		 640 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  50.53 
 
 		 659 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.95 
 
 		 640 aa  467  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 		 649 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.53 
 
 		 646 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.63 
 
 		 612 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.53 
 
 		 642 aa  462  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  50.74 
 
 		 639 aa  465  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  50.82 
 
 		 682 aa  463  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.22 
 
 		 655 aa  464  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.84 
 
 		 628 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1721  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.84 
 
 		 628 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.54064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.98 
 
 		 620 aa  462  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  47.9 
 
 		 613 aa  464  1e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.44 
 
 		 623 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.89 
 
 		 634 aa  465  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.32 
 
 		 639 aa  462  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.95 
 
 		 638 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.92 
 
 		 608 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.8 
 
 		 679 aa  463  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  48.69 
 
 		 628 aa  463  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.74 
 
 		 639 aa  465  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0074  cell division protein  48.4 
 
 		 645 aa  460  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.33 
 
 		 637 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  49.68 
 
 		 700 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  49.89 
 
 		 633 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.4 
 
 		 645 aa  460  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  49.68 
 
 		 633 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  49.58 
 
 		 627 aa  462  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.68 
 
 		 605 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4439  FtsH peptidase  50.1 
 
 		 632 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.82 
 
 		 639 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1231  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.19 
 
 		 617 aa  459  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.901618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  49.9 
 
 		 629 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.96 
 
 		 613 aa  460  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  50.21 
 
 		 613 aa  459  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.14 
 
 		 640 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0193  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.93 
 
 		 607 aa  459  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  49.47 
 
 		 633 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  48.3 
 
 		 626 aa  456  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  46.64 
 
 		 624 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.9 
 
 		 631 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.972429  normal  0.432924 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.47 
 
 		 633 aa  456  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  49.47 
 
 		 633 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4255  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.3 
 
 		 632 aa  455  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  51.27 
 
 		 645 aa  457  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  50.1 
 
 		 628 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.1 
 
 		 628 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4241  FtsH-2 peptidase  50.32 
 
 		 621 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0580  cell division protein FtsH  50.1 
 
 		 628 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51431  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4825  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.63 
 
 		 610 aa  456  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185194  normal  0.513387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>