75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_19568 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_19568  predicted protein  100 
 
 
485 aa  984    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.921701  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01971  RuvB-like helicase 1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBV9]  62.42 
 
 
458 aa  565  1e-160  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000052606  hitchhiker  0.00951448 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00990  RVB1, putative  57.61 
 
 
484 aa  554  1e-156  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31398  predicted protein  60.31 
 
 
455 aa  548  1e-155  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556143  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37582  RUVB-like protein  59.43 
 
 
459 aa  548  1e-154  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.262753 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0862  TIP49-like  44.74 
 
 
441 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43499  predicted protein  42.55 
 
 
462 aa  352  1e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0715  TIP49 domain-containing protein  41.48 
 
 
451 aa  350  2e-95  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06840  conserved hypothetical protein  42.39 
 
 
463 aa  349  5e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.247034  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0616  TBP-interacting protein TIP49  41.41 
 
 
450 aa  348  2e-94  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1694  TIP49-like protein  40.04 
 
 
451 aa  346  5e-94  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.252738 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1220  TIP49 domain protein  42.23 
 
 
448 aa  342  9e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.478544  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29898  transcriptional regulator  41.72 
 
 
484 aa  341  1e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.287738  normal  0.530711 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0904  TIP49-like protein  42.29 
 
 
456 aa  340  2.9999999999999998e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175331  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2236  TIP49-like protein  40.75 
 
 
450 aa  339  7e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.385068 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00327  RuvB-like helicase 2 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGK3]  39.13 
 
 
468 aa  334  2e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0596  TBP-interacting protein TIP49  43.01 
 
 
452 aa  333  4e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.739423 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0253  TIP49 domain protein  42.64 
 
 
452 aa  315  8e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.632673  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50825  predicted protein  39.04 
 
 
451 aa  311  2e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2106  AAA ATPase  40.3 
 
 
371 aa  47.8  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0648  AAA ATPase central domain protein  44.64 
 
 
585 aa  45.8  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  38.46 
 
 
371 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  45.16 
 
 
612 aa  45.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  38.46 
 
 
371 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.65 
 
 
651 aa  45.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.76 
 
 
731 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.77 
 
 
621 aa  45.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1152  peptidase M41, FtsH  63.16 
 
 
599 aa  45.1  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86905  cytoplasmic protein involved in protein transport between ER and Golgi ATPase  34.78 
 
 
794 aa  44.7  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1702  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.83 
 
 
346 aa  44.7  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.77 
 
 
621 aa  44.7  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.76 
 
 
731 aa  44.7  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1645  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.83 
 
 
346 aa  44.7  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1213  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.83 
 
 
346 aa  44.3  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.91 
 
 
640 aa  44.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0172  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.86 
 
 
646 aa  44.3  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.91 
 
 
639 aa  44.3  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  40.91 
 
 
639 aa  44.3  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  40.91 
 
 
641 aa  44.3  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.91 
 
 
639 aa  44.3  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.77 
 
 
631 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.972429  normal  0.432924 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2862  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.77 
 
 
629 aa  43.9  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198246  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.12 
 
 
638 aa  43.9  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  39.77 
 
 
629 aa  43.9  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0816  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.77 
 
 
627 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1174  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.77 
 
 
631 aa  44.3  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378107  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.77 
 
 
631 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4439  FtsH peptidase  39.77 
 
 
632 aa  43.9  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172586  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.86 
 
 
604 aa  43.9  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.86 
 
 
608 aa  43.9  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  25.55 
 
 
308 aa  43.9  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1186  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.77 
 
 
631 aa  44.3  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.21079 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.91 
 
 
655 aa  43.9  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.61 
 
 
731 aa  43.9  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2387  Holliday junction DNA helicase RuvB  46 
 
 
360 aa  43.9  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.61 
 
 
731 aa  43.9  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0811  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.37 
 
 
663 aa  43.9  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.569146  hitchhiker  0.0043584 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0879  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.77 
 
 
629 aa  43.9  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200568  normal  0.0679699 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0571  cell division protein FtsH  39.77 
 
 
628 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  42.86 
 
 
499 aa  43.5  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1512  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.77 
 
 
628 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580139  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.77 
 
 
628 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0777  cell division protein FtsH  39.77 
 
 
628 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  42.37 
 
 
775 aa  43.5  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0580  cell division protein FtsH  39.77 
 
 
628 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51431  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1288  cell division protein FtsH  39.77 
 
 
628 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725972  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.39 
 
 
642 aa  43.5  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1615  cell division protein FtsH  39.77 
 
 
628 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24975  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.39 
 
 
640 aa  43.5  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  39.77 
 
 
628 aa  43.5  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1322  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.16 
 
 
598 aa  43.5  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.358408  normal  0.0936427 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3787  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.89 
 
 
359 aa  43.5  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.77 
 
 
631 aa  43.5  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1422  ATPase central domain-containing protein  30.27 
 
 
715 aa  43.5  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  62.16 
 
 
632 aa  43.5  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>