More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_17228 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_17228  predicted protein  100 
 
 		 389 aa  795    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  47.57 
 
 		 928 aa  278  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  48.2 
 
 		 979 aa  273  4.0000000000000004e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  46.69 
 
 		 976 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3381  DNA polymerase I  46.36 
 
 		 1004 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  46.03 
 
 		 968 aa  263  4e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  47.02 
 
 		 978 aa  263  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  46.03 
 
 		 979 aa  261  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  46.03 
 
 		 978 aa  261  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5204  DNA polymerase I  45.29 
 
 		 1025 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  45.45 
 
 		 992 aa  259  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0453  DNA polymerase I  47.62 
 
 		 1014 aa  257  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4857  DNA polymerase I  48.48 
 
 		 1021 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.450809 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0848  DNA polymerase I  46.69 
 
 		 1032 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7357  DNA polymerase I  47.99 
 
 		 1020 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  46.82 
 
 		 937 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0956  DNA polymerase I  46.33 
 
 		 1033 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  46.18 
 
 		 935 aa  251  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0357  DNA polymerase I  47.12 
 
 		 1010 aa  248  9e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  46.49 
 
 		 937 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  46.49 
 
 		 937 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0221  DNA polymerase I  44.44 
 
 		 973 aa  245  9e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.324106 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4103  DNA polymerase I  49.42 
 
 		 999 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4423  DNA polymerase I  49.42 
 
 		 1016 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1504  DNA polymerase I  45.95 
 
 		 915 aa  240  4e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0625  DNA polymerase I  43.58 
 
 		 937 aa  239  5e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.480617 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1853  DNA polymerase I  44.33 
 
 		 940 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  43.08 
 
 		 924 aa  236  6e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  41.86 
 
 		 941 aa  233  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2846  DNA polymerase I  44.22 
 
 		 943 aa  230  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.411951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  44.33 
 
 		 932 aa  229  6e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0278  DNA polymerase I  41.46 
 
 		 945 aa  229  8e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1683  DNA polymerase I  44.44 
 
 		 929 aa  227  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.569036  normal  0.718828 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2377  DNA polymerase I  42.26 
 
 		 1000 aa  227  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  45.1 
 
 		 891 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1501  DNA polymerase I  41.87 
 
 		 1024 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0825  5'-3' exonuclease  42.57 
 
 		 474 aa  219  6e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0774  ribonuclease H  41.55 
 
 		 474 aa  217  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.245945  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2694  DNA polymerase I  41.98 
 
 		 1047 aa  216  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2471  DNA polymerase I  41.98 
 
 		 1047 aa  216  8e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195384  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  38.89 
 
 		 891 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2399  DNA polymerase I  41.49 
 
 		 1047 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0678  DNA polymerase I  41.46 
 
 		 1016 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80797  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3536  DNA polymerase I  41.27 
 
 		 1060 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  45.7 
 
 		 484 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  45.28 
 
 		 892 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0080  DNA polymerase I  42.86 
 
 		 944 aa  211  2e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.432939  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1391  DNA polymerase I  40.43 
 
 		 1013 aa  209  4e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.413806 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  39.67 
 
 		 902 aa  209  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  42.64 
 
 		 480 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0949  ribonuclease H  45.7 
 
 		 482 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  40 
 
 		 893 aa  205  9e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  39.47 
 
 		 908 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  37.29 
 
 		 870 aa  203  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  37.62 
 
 		 876 aa  202  7e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  37.03 
 
 		 903 aa  202  8e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  38.44 
 
 		 911 aa  201  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  35.49 
 
 		 877 aa  199  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  39.93 
 
 		 912 aa  199  9e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  35.49 
 
 		 877 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  35.02 
 
 		 891 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  35.02 
 
 		 891 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  35.02 
 
 		 891 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  35.34 
 
 		 939 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  35.49 
 
 		 877 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  35.49 
 
 		 877 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  38.44 
 
 		 892 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  38.07 
 
 		 934 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  35.49 
 
 		 877 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  37.37 
 
 		 878 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2744  DNA polymerase I  38.73 
 
 		 1043 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.560241 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  35.15 
 
 		 877 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  34.01 
 
 		 299 aa  196  7e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  36.88 
 
 		 866 aa  195  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  38.49 
 
 		 943 aa  194  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  38.36 
 
 		 932 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  41.83 
 
 		 928 aa  193  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  38.36 
 
 		 932 aa  194  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  38.36 
 
 		 932 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0048  DNA polymerase I  41.46 
 
 		 861 aa  193  4e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  36.97 
 
 		 933 aa  193  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  34.81 
 
 		 877 aa  193  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  41.11 
 
 		 892 aa  192  8e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  41 
 
 		 930 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  41.22 
 
 		 929 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  34.34 
 
 		 916 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  37.99 
 
 		 930 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_002978  WD1003  DNA polymerase I  38.41 
 
 		 858 aa  191  2e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.842634  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  42.15 
 
 		 931 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  36.18 
 
 		 892 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  38.61 
 
 		 911 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  34.47 
 
 		 877 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  36.75 
 
 		 923 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  37.79 
 
 		 926 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  39.69 
 
 		 951 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  36.42 
 
 		 929 aa  190  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  36.39 
 
 		 940 aa  190  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  36.01 
 
 		 895 aa  189  5.999999999999999e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  36.14 
 
 		 945 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  36.18 
 
 		 892 aa  189  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>