More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16073 on replicon NC_011691
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011691  PHATRDRAFT_16073  predicted protein  100 
 
 
474 aa  978    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.760064  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24935  helicase_1  51.93 
 
 
455 aa  360  4e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43135  predicted protein  43.59 
 
 
587 aa  340  2.9999999999999998e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46542  predicted protein  42.02 
 
 
545 aa  311  1e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.893722  normal  0.156385 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05150  conserved hypothetical protein  38.82 
 
 
606 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05623  conserved hypothetical protein  33.89 
 
 
567 aa  256  6e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0060242 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00220  RNA helicase, putative  35.4 
 
 
710 aa  244  3e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.063496  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25999  predicted protein  36.21 
 
 
485 aa  238  2e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81459  RNA-dependent helicase  35.17 
 
 
567 aa  236  7e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.3042 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01060  conserved hypothetical protein  35.59 
 
 
607 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0340674  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01949  ATP-dependent RNA helicase has1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBY1]  36.4 
 
 
609 aa  229  8e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.429941  normal  0.205998 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46259  predicted protein  35.45 
 
 
589 aa  225  2e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00894  DEAD box RNA helicase HelA, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15620)  37.47 
 
 
641 aa  222  9e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.859671  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3137  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.21 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.417065  normal  0.231067 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0808  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.1 
 
 
448 aa  209  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.61 
 
 
439 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.48 
 
 
497 aa  204  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1199  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.79 
 
 
578 aa  203  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2609  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.79 
 
 
577 aa  203  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0924  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.67 
 
 
403 aa  203  5e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42318  predicted protein  31.95 
 
 
481 aa  203  6e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.712949  normal  0.0619314 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00589  ATP-dependent RNA helicase dbp4 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BFU1]  34.97 
 
 
812 aa  202  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51414  ATP-dependent RNA helicase DBP4 (Helicase CA4) (Helicase UF1)  34.67 
 
 
765 aa  202  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1778  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.66 
 
 
479 aa  202  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17560  DNA/RNA helicase, superfamily II  33.51 
 
 
731 aa  201  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0588083  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.79 
 
 
581 aa  201  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0314  DEAD/DEAH box helicase  36.26 
 
 
476 aa  200  5e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1516  DEAD/DEAH box helicase-like  34.77 
 
 
492 aa  199  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.44 
 
 
484 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.95 
 
 
487 aa  199  9e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1053  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.16 
 
 
484 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.51 
 
 
448 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487867  normal  0.156887 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.24 
 
 
571 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3520  DEAD/DEAH box helicase-like  31.47 
 
 
579 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.87 
 
 
452 aa  197  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00281492  normal  0.0306725 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000619  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.77 
 
 
522 aa  197  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2902  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.86 
 
 
598 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0368123 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2088  putative ATP-dependent RNA helicase 1  35.31 
 
 
453 aa  197  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.936977 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1646  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.51 
 
 
545 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00683  ATP-dependent RNA helicase DbpA  34.22 
 
 
459 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0400  DEAD/DEAH box helicase-like  33.72 
 
 
477 aa  195  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12071  putative ATP-dependent RNA helicase  33.51 
 
 
593 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1225  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.05 
 
 
646 aa  196  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.115574 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  35.31 
 
 
425 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.121425 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2450  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.93 
 
 
508 aa  195  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0131519  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.86 
 
 
599 aa  195  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_002978  WD1236  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34 
 
 
408 aa  194  3e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.08 
 
 
502 aa  194  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0263323 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12081  putative ATP-dependent RNA helicase  33.51 
 
 
593 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06483  hypothetical protein  36.31 
 
 
527 aa  193  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1112  DEAD/DEAH box helicase-like  33.24 
 
 
593 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.446454  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54281  Mitochondrial RNA helicase of the DEAD box family  33.59 
 
 
468 aa  193  4e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0633704 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0603  DEAD/DEAH box helicase-like protein  31.84 
 
 
591 aa  194  4e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.97 
 
 
640 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.97 
 
 
640 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.97 
 
 
640 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.97 
 
 
640 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13235  fructose-bisphosphate aldolase  35.14 
 
 
627 aa  193  6e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00390046  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3703  DEAD/DEAH box helicase-like  35.07 
 
 
481 aa  193  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621227  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3878  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.75 
 
 
486 aa  193  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04825  ATP-dependent RNA helicase  33.96 
 
 
614 aa  193  7e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1648  DEAD/DEAH box helicase-like  31.23 
 
 
607 aa  192  8e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  33.6 
 
 
485 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2155  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35 
 
 
504 aa  192  8e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659506  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0950  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.25 
 
 
432 aa  192  8e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2698  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  33.6 
 
 
473 aa  192  9e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0914  ATP-dependent RNA helicase  33.6 
 
 
485 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348859  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3028  DEAD/DEAH box helicase-like  34.28 
 
 
506 aa  192  9e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.287974  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3204  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.78 
 
 
559 aa  192  9e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0748  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  33.6 
 
 
485 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0248  ATP-dependent RNA helicase RhlE  33.6 
 
 
485 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5998  DEAD/DEAH box helicase  33.06 
 
 
484 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1915  DEAD/DEAH box helicase  34.32 
 
 
393 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4192  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.99 
 
 
474 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2460  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  33.6 
 
 
485 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2582  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.85 
 
 
427 aa  192  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.397451 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.97 
 
 
640 aa  192  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1383  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.07 
 
 
433 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  34.02 
 
 
482 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  34.02 
 
 
559 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  34.02 
 
 
482 aa  192  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  34.02 
 
 
482 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1793  DEAD/DEAH box helicase  35.62 
 
 
491 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  34.02 
 
 
482 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  34.02 
 
 
481 aa  192  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2746  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.41 
 
 
678 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633229  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3459  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.09 
 
 
624 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.319039  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  34.02 
 
 
482 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.61 
 
 
526 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.61 
 
 
515 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1775  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  30.62 
 
 
562 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1022  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.6 
 
 
435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0284952 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.61 
 
 
525 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  35.81 
 
 
469 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05215  putative ATP-dependent RNA helicase  31.59 
 
 
424 aa  191  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.190417  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.6 
 
 
599 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1847  ATP-dependent RNA helicase DbpA  34.83 
 
 
457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.61 
 
 
525 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11921  putative ATP-dependent RNA helicase  33.06 
 
 
595 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.412089  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0933  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.97 
 
 
479 aa  190  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461598  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>