More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_65880 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_65880  putative two-component response regulator  100 
 
 		 244 aa  487  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0780512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5717  putative two-component response regulator  99.18 
 
 		 245 aa  484  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2033  two component transcriptional regulator  81.4 
 
 		 238 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3730  winged helix family two component transcriptional regulator  80.99 
 
 		 238 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2176  two component transcriptional regulator  80.99 
 
 		 238 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120128  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2473  DNA-binding response regulator  58.09 
 
 		 242 aa  280  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0200  two component transcriptional regulator  57.5 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2983  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.7 
 
 		 242 aa  248  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000906081  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1282  two component transcriptional regulator  51.52 
 
 		 249 aa  231  6e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0545  two component transcriptional regulator  47.68 
 
 		 250 aa  211  7.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3045  two component transcriptional regulator  48.93 
 
 		 232 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3772  two component transcriptional regulator  48.93 
 
 		 232 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0655  two component transcriptional regulator  46.55 
 
 		 242 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.379452 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1874  two component transcriptional regulator  48.93 
 
 		 235 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2052  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.91 
 
 		 242 aa  208  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293024  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003939  TorCAD operon transcriptional regulatory protein TorR  46.03 
 
 		 236 aa  201  9e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0753413  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00276  two-component response regulator  44.26 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 		 244 aa  200  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01583  DNA-binding transcriptional regulator TorR  44.63 
 
 		 237 aa  198  7e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1322  DNA-binding transcriptional regulator TorR  46.84 
 
 		 234 aa  198  7.999999999999999e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000612091  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1985  DNA-binding transcriptional regulator TorR  45.96 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0983  DNA-binding transcriptional regulator TorR  47.18 
 
 		 236 aa  196  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.291581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.5 
 
 		 245 aa  194  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  47.46 
 
 		 239 aa  194  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2279  two component transcriptional regulator  47.5 
 
 		 234 aa  194  8.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.957974 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  44.21 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  47.21 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3347  DNA-binding transcriptional regulator TorR  46.15 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000384276  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  42.98 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  42.98 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  42.02 
 
 		 236 aa  192  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  43.33 
 
 		 241 aa  192  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2803  DNA-binding transcriptional regulator TorR  46.59 
 
 		 241 aa  192  5e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0082  two-component response regulator  41.25 
 
 		 235 aa  192  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1990  DNA-binding transcriptional regulator TorR  44.98 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.697946  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  45.15 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1947  two-component response regulator  39.83 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000743409  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0713  two-component response regulator  38.46 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  46.41 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 262 aa  188  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1828  DNA-binding transcriptional regulator TorR  44.54 
 
 		 240 aa  188  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0601  two-component response regulator  41.45 
 
 		 238 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000457476  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1112  DNA-binding transcriptional regulator TorR  45.16 
 
 		 236 aa  188  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1051  DNA-binding transcriptional regulator TorR  45.16 
 
 		 236 aa  188  8e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.44318 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1150  DNA-binding transcriptional regulator TorR  44.94 
 
 		 236 aa  188  9e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.202106 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00933  two-component response regulator  39 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0207  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.46 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00814931  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3217  DNA-binding transcriptional regulator TorR  44.94 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3217  DNA-binding transcriptional regulator TorR  44.94 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3356  DNA-binding transcriptional regulator TorR  44.94 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1047  DNA-binding transcriptional regulator TorR  45.38 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.499715  normal  0.229032 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004461  aerobic respiration control protein ArcA  39 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000105121  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00621  osmolarity response regulator  42.32 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3367  DNA-binding transcriptional regulator TorR  45.34 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3241  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.23 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4347  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 		 244 aa  186  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.215798  normal  0.0155623 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1228  DNA-binding transcriptional regulator TorR  44.76 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  44.26 
 
 		 244 aa  185  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  43.15 
 
 		 240 aa  185  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0786  two-component response regulator  40.17 
 
 		 238 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00613295  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  43.83 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0562  two-component response regulator  39.57 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  43.29 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3534  DNA-binding transcriptional regulator TorR  44.09 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.176306 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3762  two-component response regulator  39.42 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0487627  decreased coverage  0.0000265862 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3842  two-component response regulator  40.17 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000808868  hitchhiker  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4949  two-component response regulator  39.26 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3660  two-component response regulator  40.17 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0335884  decreased coverage  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3719  two-component response regulator  40.17 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000224737  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0815  two-component response regulator  39.42 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000717024  decreased coverage  0.00000744043 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04277  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with ArcB or CpxA  39.26 
 
 		 238 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.896117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3596  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.26 
 
 		 238 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3988  two-component response regulator  39.17 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5012  two-component response regulator  39.26 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0537303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  42.55 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5000  two-component response regulator  39.26 
 
 		 238 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  43.16 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4922  two-component response regulator  39.26 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000490343  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4952  two-component response regulator  39.26 
 
 		 238 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.198521  normal  0.89803 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3655  two-component response regulator  39.26 
 
 		 238 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4956  two-component response regulator  39.26 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.211871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0651  two-component response regulator  39.17 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000404261  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04242  hypothetical protein  39.26 
 
 		 238 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.889846  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3371  two-component response regulator  39.17 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000464227  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5916  two-component response regulator  39.26 
 
 		 238 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.284367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4849  two-component response regulator  39.26 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4637  two-component response regulator  39.26 
 
 		 238 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0297029  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5008  two-component response regulator  39.26 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.80206 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0650  two-component response regulator  39.17 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000223196  hitchhiker  0.00939579 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0678  two-component response regulator  39.17 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000157437  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  43.59 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  45.34 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.73 
 
 		 275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.15 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2558  two-component response regulator  38.98 
 
 		 239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  42.74 
 
 		 239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  42.74 
 
 		 239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  42.74 
 
 		 239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  42.74 
 
 		 239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  42.74 
 
 		 239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>