153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_42920 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5420  hypothetical protein  87.13 
 
 		 443 aa  813    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5579  hypothetical protein  88.04 
 
 		 443 aa  822    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42920  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  909    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  78.56 
 
 		 443 aa  729    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3605  hypothetical protein  99.32 
 
 		 443 aa  903    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2552  hypothetical protein  65.28 
 
 		 432 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0100062  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1115  putative type VI secretion protein VasE  46.83 
 
 		 440 aa  424  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  40.09 
 
 		 443 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  41.67 
 
 		 444 aa  335  7e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  41.04 
 
 		 444 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  41.44 
 
 		 444 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  41.72 
 
 		 444 aa  332  6e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  41.04 
 
 		 455 aa  330  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  38.29 
 
 		 444 aa  323  4e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0514  type VI secretion protein, VC_A0114 family  40.59 
 
 		 443 aa  320  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  39.37 
 
 		 445 aa  318  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  38.37 
 
 		 445 aa  318  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  37.1 
 
 		 444 aa  316  5e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  38.29 
 
 		 444 aa  315  9e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  41.63 
 
 		 444 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  36.84 
 
 		 442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  38.8 
 
 		 446 aa  308  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00252  ImpJ  39.82 
 
 		 445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  38.11 
 
 		 468 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1594  hypothetical protein  38.86 
 
 		 472 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0397  hypothetical protein  38.19 
 
 		 467 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0991372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1207  ImpJ  38.19 
 
 		 454 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.740729  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1591  hypothetical protein  38.19 
 
 		 467 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1776  hypothetical protein  38.19 
 
 		 467 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2967  hypothetical protein  38.19 
 
 		 467 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0446  hypothetical protein  38.19 
 
 		 467 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2842  hypothetical protein  37.97 
 
 		 467 aa  299  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000430  uncharacterized protein ImpJ/VasE  34.46 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.959162  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0211  type VI secretion protein, VC_A0114 family  37.13 
 
 		 458 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05852  hypothetical protein  34.9 
 
 		 441 aa  295  9e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  37.78 
 
 		 445 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  37.56 
 
 		 445 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2800  type VI secretion protein, VC_A0114 family  37.16 
 
 		 445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  36.18 
 
 		 443 aa  279  7e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2466  type VI secretion protein, VC_A0114 family  36.59 
 
 		 446 aa  279  8e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3231  type VI secretion protein  34.39 
 
 		 445 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  36.18 
 
 		 443 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  36.18 
 
 		 443 aa  278  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0393  type VI secretion protein  36.04 
 
 		 448 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0320  hypothetical protein  36.04 
 
 		 448 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2998  hypothetical protein  36.34 
 
 		 448 aa  270  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1104  hypothetical protein  35.07 
 
 		 443 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1223  hypothetical protein  35.07 
 
 		 443 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.629455 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000014  uncharacterized protein ImpJ/VasE  35.17 
 
 		 429 aa  262  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2120  hypothetical protein  34.55 
 
 		 445 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2617  hypothetical protein  34.55 
 
 		 445 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500578  normal  0.0201893 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1608  hypothetical protein  34.97 
 
 		 480 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25923  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0161  hypothetical protein  34.97 
 
 		 449 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0138  hypothetical protein  34.97 
 
 		 452 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4080  hypothetical protein  35.08 
 
 		 445 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365614  hitchhiker  0.000139294 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  35.12 
 
 		 447 aa  256  5e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4055  type VI secretion protein  36.28 
 
 		 445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000569036 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0125  hypothetical protein  34.74 
 
 		 480 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  35.12 
 
 		 443 aa  253  5.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6677  type VI secretion protein  33.93 
 
 		 449 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3024  type VI secretion protein  34.3 
 
 		 449 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6110  type VI secretion protein  34.23 
 
 		 448 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  32.07 
 
 		 449 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  32.07 
 
 		 449 aa  238  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  32.07 
 
 		 449 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0319  type VI secretion protein, family  32.13 
 
 		 447 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0302  hypothetical protein  32.13 
 
 		 447 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.392469  normal  0.385972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0313  type VI secretion protein, family  32.13 
 
 		 447 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.471816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0307  type VI secretion protein  32.13 
 
 		 447 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300554  normal  0.0525484 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0936  type VI secretion protein, VC_A0114 family  33.11 
 
 		 447 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0984  hypothetical protein  32.36 
 
 		 448 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3046  type VI secretion protein, VC_A0114 family  31.74 
 
 		 445 aa  224  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00998983  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3478  hypothetical protein  33.18 
 
 		 447 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0329  hypothetical protein  33.71 
 
 		 448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1691  hypothetical protein  33.48 
 
 		 448 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2089  putative temperature-dependent protein secretion, ImpJ  34.52 
 
 		 448 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0238  hypothetical protein  33.48 
 
 		 448 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1913  hypothetical protein  33.48 
 
 		 448 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0926  hypothetical protein  33.48 
 
 		 448 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1213  hypothetical protein  33.48 
 
 		 448 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2188  hypothetical protein  33.48 
 
 		 448 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2354  type VI secretion protein, VC_A0114 family  29.91 
 
 		 446 aa  216  8e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3913  type VI secretion protein  32.45 
 
 		 416 aa  203  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3552  type VI secretion protein  31.33 
 
 		 451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0196523  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3423  hypothetical protein  31.33 
 
 		 451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2088  hypothetical protein  30.42 
 
 		 453 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0852077  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0803  hypothetical protein  30.42 
 
 		 453 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0715  hypothetical protein  30.42 
 
 		 453 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.147759  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2451  hypothetical protein  28.12 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1887  hypothetical protein  30.53 
 
 		 453 aa  160  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0024  hypothetical protein  33.46 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.668164  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0023  hypothetical protein  46.15 
 
 		 159 aa  155  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2642  hypothetical protein  28.31 
 
 		 448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0464  hypothetical protein  28.31 
 
 		 448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0442  type VI secretion protein  28.31 
 
 		 448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236466  normal  0.429573 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02042  hypothetical protein  27.5 
 
 		 433 aa  154  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2967  hypothetical protein  29.13 
 
 		 448 aa  153  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3639  hypothetical protein  29.66 
 
 		 468 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507255  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3556  hypothetical protein  28.16 
 
 		 448 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0420358  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0378  hypothetical protein  28.16 
 
 		 448 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.493285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>