More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_12291 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_12291  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  100 
 
 		 246 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.782206  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1165  ATPase  95.53 
 
 		 246 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0611  ATPase  80.89 
 
 		 248 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.355376  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14241  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  80.89 
 
 		 248 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12101  ABC transporter for amino acids, ATP binding component  68.16 
 
 		 246 aa  355  3.9999999999999996e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14761  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  69.83 
 
 		 248 aa  349  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0558262 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0850  ATPase  66.53 
 
 		 246 aa  346  2e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.736744  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1806  ATPase  65.04 
 
 		 247 aa  343  2e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.842088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0985  ABC transporter related  59.26 
 
 		 247 aa  303  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.178128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  59.5 
 
 		 246 aa  299  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  57.61 
 
 		 246 aa  295  4e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  57.61 
 
 		 247 aa  293  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  57.61 
 
 		 247 aa  292  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2001  ABC transporter related  57.74 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  57.02 
 
 		 249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  53.6 
 
 		 252 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  58.22 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  54.51 
 
 		 252 aa  276  3e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  53.72 
 
 		 252 aa  275  6e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  55.79 
 
 		 243 aa  275  7e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  56.96 
 
 		 258 aa  274  8e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  56.96 
 
 		 258 aa  274  8e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  55.88 
 
 		 243 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  56.15 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  56.96 
 
 		 263 aa  272  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  53.06 
 
 		 251 aa  273  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  56.54 
 
 		 266 aa  272  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  57.33 
 
 		 273 aa  272  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.54 
 
 		 269 aa  272  3e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.54 
 
 		 249 aa  272  4.0000000000000004e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  58.41 
 
 		 268 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  56.54 
 
 		 257 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  59.29 
 
 		 262 aa  271  6e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  59.29 
 
 		 262 aa  271  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  52.23 
 
 		 259 aa  271  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  58.22 
 
 		 263 aa  271  7e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  54.29 
 
 		 244 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  54.55 
 
 		 253 aa  271  9e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  56.54 
 
 		 257 aa  271  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  56.33 
 
 		 248 aa  271  9e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  55.7 
 
 		 269 aa  270  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0249  ATPase  52.89 
 
 		 261 aa  271  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  53.91 
 
 		 253 aa  270  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.89 
 
 		 252 aa  270  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.31 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.31 
 
 		 252 aa  270  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.92 
 
 		 284 aa  270  2e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  53.69 
 
 		 246 aa  269  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4427  ABC transporter related  57.14 
 
 		 254 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120026  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  54.13 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  57.78 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  53.72 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  56.44 
 
 		 273 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  54.13 
 
 		 253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.89 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.89 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  53.31 
 
 		 245 aa  269  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  58.41 
 
 		 262 aa  268  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05950  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.41 
 
 		 247 aa  268  4e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0299  ABC transporter-related protein  52.46 
 
 		 252 aa  268  4e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  55.92 
 
 		 248 aa  269  4e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  52.48 
 
 		 252 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  52.48 
 
 		 252 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  52.48 
 
 		 252 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  53.91 
 
 		 255 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.48 
 
 		 252 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  52.48 
 
 		 252 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  52.48 
 
 		 244 aa  268  5.9999999999999995e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  57.78 
 
 		 258 aa  268  7e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  55.31 
 
 		 242 aa  268  8e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  56.64 
 
 		 267 aa  268  8.999999999999999e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  54.13 
 
 		 253 aa  267  8.999999999999999e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.1 
 
 		 253 aa  267  1e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1100  ABC transporter related  54.39 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  56.19 
 
 		 242 aa  267  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  51.85 
 
 		 245 aa  267  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  52.87 
 
 		 244 aa  267  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  56.3 
 
 		 257 aa  267  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.89 
 
 		 251 aa  266  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  53.31 
 
 		 259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0834  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  53.31 
 
 		 249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  53.31 
 
 		 245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  58.22 
 
 		 244 aa  265  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  55.33 
 
 		 254 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  56.89 
 
 		 250 aa  265  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  57.4 
 
 		 242 aa  265  4e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  53.28 
 
 		 246 aa  265  4e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  52.46 
 
 		 253 aa  265  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4395  ABC transporter related  53.06 
 
 		 243 aa  265  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0223537  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  55.04 
 
 		 243 aa  265  5e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  53.5 
 
 		 246 aa  265  5e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  54.29 
 
 		 247 aa  265  5e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  53.69 
 
 		 253 aa  265  5.999999999999999e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  55.88 
 
 		 243 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  54.13 
 
 		 267 aa  265  7e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  52.46 
 
 		 245 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  54.87 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  54.67 
 
 		 262 aa  264  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  53.72 
 
 		 251 aa  263  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000214  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.32 
 
 		 244 aa  264  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>