More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4497 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4497  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 256 aa  525  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00119302  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1210  two component LuxR family transcriptional regulator  65.29 
 
 		 239 aa  329  3e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27359 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4369  LuxR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 102 aa  106  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4247  two component LuxR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.798903  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.38 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  30.46 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2239  two component LuxR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 210 aa  67  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1021  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.35 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.794365 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.39 
 
 		 1648 aa  63.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0670  two component LuxR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.74 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.32 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2281  two component transcriptional regulator, LuxR family  22.97 
 
 		 214 aa  62  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5975  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.68 
 
 		 231 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574546 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2079  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.63 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.79 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.74 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 216 aa  62  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  25.47 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0905  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  27.65 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0826046  hitchhiker  0.00000533581 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.34 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.34 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0613  nitrate/nitrite response regulator NarP  30.13 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.11 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.29 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.94 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0304  two component LuxR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.29 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.682063 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1927  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.29 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.54 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  23.76 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24710  putative two-component response regulator  27.38 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1290  two component LuxR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.542915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.18 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  29.83 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1260  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  28.98 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2033  LuxR family DNA-binding response regulator  26.51 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.74 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  27.57 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  29.83 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1780  EsrB  30.77 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.111024  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2345  two component transcriptional regulator  26.82 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499423  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2093  putative two-component response regulator  27.38 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3163  two component LuxR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.932633  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429674  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3175  LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 148 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3945  putative DNA-binding response regulator EsrB  28.9 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  25 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1504  hypothetical protein  29.28 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000918459 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0859  two component LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3002  LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000242381  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4126  transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353041 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1873  response regulator receiver protein  27.17 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1971  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.25 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2780  two component LuxR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1620  two component LuxR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 206 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0222153 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  26.97 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  26.97 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  26.97 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  26.97 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1551  two component LuxR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 229 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3974  two component LuxR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 208 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3833  putative DNA-binding response regulator EsrB  28.32 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  26.97 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3919  two component LuxR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 208 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.01 
 
 		 218 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2872  two component LuxR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891055  hitchhiker  0.000000000201971 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3992  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.91 
 
 		 214 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2902  two component LuxR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  27.11 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2437  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.43 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  27.11 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  27.11 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  27.11 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2114  LuxR response regulator receiver  28.49 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  27.11 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1526  two-component response regulator EsrB  30.22 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  hitchhiker  0.00169027 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1950  hypothetical protein  30.22 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094858 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1489  EsrB  30.22 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.121116  normal  0.320198 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>