More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1210 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1210  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  490  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27359 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4497  two component LuxR family transcriptional regulator  65.29 
 
 		 256 aa  329  3e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00119302  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4369  LuxR family transcriptional regulator  65 
 
 		 102 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4247  two component LuxR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.798903  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.34 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 208 aa  72  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2239  two component LuxR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.11 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1504  hypothetical protein  30.34 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000918459 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1780  EsrB  30.34 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.111024  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1526  two-component response regulator EsrB  30.34 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  hitchhiker  0.00169027 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1950  hypothetical protein  30.34 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094858 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1489  EsrB  30.34 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.121116  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.77 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.77 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.21 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.003137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30650  response regulator GacA  26.67 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700013 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1104  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.07 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2613  response regulator GacA  26.67 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.466832  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  31.32 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 233 aa  62  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1873  response regulator receiver protein  26.4 
 
 		 215 aa  62  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 212 aa  62  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  25.86 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02279  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with EvgS  27.06 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1288  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.06 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02240  hypothetical protein  27.06 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2655  DNA-binding transcriptional activator EvgA  27.06 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1123  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.54 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3600  DNA-binding transcriptional activator EvgA  27.06 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0441797 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1300  DNA-binding transcriptional activator EvgA  27.06 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2506  DNA-binding transcriptional activator EvgA  27.06 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00265649  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2227  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.79 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.632961  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2519  DNA-binding transcriptional activator EvgA  27.06 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  31.32 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2101  LuxR family DNA-binding response regulator  26.97 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00862279  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.93 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  28.26 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1021  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.74 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.794365 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0905  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  28.82 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0826046  hitchhiker  0.00000533581 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3638  two component LuxR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.489861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1765  two component LuxR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456405  hitchhiker  0.00257365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4099  DNA-binding response regulator GacA  29.11 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.427607  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.67 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1260  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  28.25 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2246  two component LuxR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0703025  hitchhiker  0.00413313 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2738  DNA-binding transcriptional activator EvgA  27.06 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2079  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.24 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.32 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.00104431 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0670  two component LuxR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1943  two component LuxR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.74 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.25 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6306  response regulator receiver protein  26.8 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0259699  normal  0.0492304 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  31.46 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  31.46 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  31.46 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1561  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.25 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  31.46 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  31.46 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  31.46 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  31.46 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4664  two component LuxR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1620  two component LuxR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0222153 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2281  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.24 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2015  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.38 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  27.47 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1884  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.79 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3974  two component LuxR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  28.26 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1518.1  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000399536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0560  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0224831  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0385  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.27 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1734  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.02 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0851  DNA-binding response regulator  34 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464733  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  30.99 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0766  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2151  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.639034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>