204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1221 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_1637  TPR repeat-containing molluscan rhodopsin  78.82 
 
 		 488 aa  725    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1693  hypothetical protein  78.82 
 
 		 488 aa  727    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1221  Tol-Pal system YbgF  100 
 
 		 505 aa  1025    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3169  tetratricopeptide TPR_2  38.83 
 
 		 334 aa  206  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3198  tol-pal system protein YbgF  39.33 
 
 		 329 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3493  tol-pal system protein YbgF  37.75 
 
 		 328 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0902147 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3624  tol-pal system protein YbgF  35.45 
 
 		 333 aa  170  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2625  Tol-Pal system YbgF  36.25 
 
 		 345 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5489  tol-pal system protein YbgF  29.55 
 
 		 304 aa  106  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39153  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4747  hypothetical protein  35.12 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4333  tol-pal system protein YbgF  37.04 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2713  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 305 aa  97.8  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0957329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6876  hypothetical protein  33.85 
 
 		 348 aa  97.1  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.617207  normal  0.0553562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0281  tol-pal system protein YbgF  35.29 
 
 		 313 aa  97.1  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433103  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  32.54 
 
 		 301 aa  95.9  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3081  Tol-Pal system YbgF  36.25 
 
 		 307 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  34.71 
 
 		 279 aa  94  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4143  hypothetical protein  31.88 
 
 		 345 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3508  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 		 336 aa  92  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.024508  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1816  hypothetical protein  31.39 
 
 		 321 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18225  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1315  tol-pal system protein YbgF  30.6 
 
 		 345 aa  90.9  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5388  tol-pal system protein YbgF  31.94 
 
 		 339 aa  89  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.986897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0778  tol-pal system protein YbgF  28.1 
 
 		 386 aa  89.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3636  tol-pal system protein YbgF  30.77 
 
 		 395 aa  88.2  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.655529  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5310  tol-pal system protein YbgF  34.71 
 
 		 341 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4842  tol-pal system protein YbgF  34.71 
 
 		 341 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.29028  normal  0.989146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4425  tol-pal system protein YbgF  34.92 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.667598 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2414  hypothetical protein  31.76 
 
 		 291 aa  79.3  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3115  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 308 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.479676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  33.68 
 
 		 269 aa  72  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1113  Tol-Pal system YbgF  33.33 
 
 		 272 aa  72.4  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636864  normal  0.58924 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  28.85 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  28.23 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  30.7 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  29.73 
 
 		 487 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 272 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  32.63 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  32 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  32.63 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  32.63 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  27.83 
 
 		 283 aa  67  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1209  hypothetical protein  32.54 
 
 		 286 aa  66.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 257 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  31.9 
 
 		 265 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  30.28 
 
 		 254 aa  65.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  30.77 
 
 		 258 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3402  Tol-Pal system YbgF  28.93 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.517203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  34.02 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  30.28 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  31.03 
 
 		 263 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  31.03 
 
 		 263 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  30.56 
 
 		 258 aa  63.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  31.03 
 
 		 263 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  31.03 
 
 		 263 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  31.03 
 
 		 263 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  29.91 
 
 		 222 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  31.03 
 
 		 263 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  31.03 
 
 		 263 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  31.03 
 
 		 263 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 255 aa  63.2  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  31.03 
 
 		 263 aa  62.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  32.53 
 
 		 264 aa  63.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 275 aa  62.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  29.89 
 
 		 262 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 257 aa  62.4  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  29.89 
 
 		 262 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  28.89 
 
 		 254 aa  62.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  29.89 
 
 		 262 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  29.89 
 
 		 262 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  29.89 
 
 		 262 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2363  tetratricopeptide TPR_2  31.25 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.574477 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  31.68 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  27.52 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  31 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  32 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  26.62 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 242 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  28.33 
 
 		 263 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 252 aa  59.7  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  25.69 
 
 		 268 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0889  hypothetical protein  31.18 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  31.37 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2746  hypothetical protein  31 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  28.71 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  28.43 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  25.49 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  25.5 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1529  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  normal  0.395847 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0667  hypothetical protein  29.91 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1697  tetratricopeptide domain-containing protein  31.63 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000538849  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2320  hypothetical protein  29.91 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.152947  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0564  hypothetical protein  29.91 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.85427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0977  hypothetical protein  29.51 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  29.41 
 
 		 261 aa  57  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  28.16 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  29.41 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>