More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0702 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0702  transcriptional regulator  100 
 
 		 119 aa  244  3e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.271355  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0323  transcriptional regulator  36.61 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0420386  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0245  transcriptional regulator  31.19 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000476333  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0636  transcriptional regulator, MerR family  27.43 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  35.45 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1161  transcriptional regulator, MerR family  28.44 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0215718 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1560  transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 		 151 aa  62  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000421328  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  32.14 
 
 		 449 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  31.93 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3223  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0351444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3639  putative transcriptional regulator, MerR family  28.44 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 390 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0626  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 115 aa  57  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3633  transcriptional regulator, MerR family  28.81 
 
 		 156 aa  57  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2770  regulatory protein MerR  26.85 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2649  MerR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2558  transcriptional regulator, MerR family  30.63 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.327244 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04780  transcriptional regulator, MerR family  28.7 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000795596  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1332  transcriptional regulator, MerR family  32.74 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0224558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2620  MerR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2664  MerR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.674524 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  29.73 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3923  transcriptional regulator, MerR family  28.07 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0531  transcriptional regulator, MerR family  27.64 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  29.73 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7602  putative transcriptional regulator, MerR family  30.36 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1791  MerR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0701164 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0427  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1187  transcriptional regulator, MerR family  29.66 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02350  transcriptional regulator, MerR family  30.36 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0160379  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  32.04 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000675  redox-sensitive transcriptional activator soxR  30.28 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.27209  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4735  transcriptional regulator, MerR family  29.66 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1612  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  32.11 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  34.26 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18180  predicted transcriptional regulator  26.5 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.575083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0461  MerR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 174 aa  50.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0313707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1570  transcriptional regulator  23.68 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1319  transcriptional regulator, MerR family  30.58 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.026746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3285  transcriptional regulator, MerR family  27.43 
 
 		 128 aa  50.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200558  normal  0.212235 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1915  putative transcriptional regulator, MerR family  30.56 
 
 		 166 aa  50.4  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  28.7 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7947  putative transcriptional regulator, MerR family  25.23 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0886  mercuric resistance operon regulatory protein  29.66 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3920  MerR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4449  mercuric resistance operon regulatory protein  29.66 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00937003  normal  0.868186 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4804  MerR family transcriptional regulator  33 
 
 		 341 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 267 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0079  transcriptional regulator  27.35 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 272 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3347  MerR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0923  MerR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3280  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6425  transcriptional regulator, MerR family  27.43 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  30.09 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.39 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01184  Transcriptional regulator, MerR family protein  36.36 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14720  predicted transcriptional regulator  31.31 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.590627  normal  0.772199 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  33.01 
 
 		 271 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2322  transcriptional regulator, MerR family  34.43 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0487  transcriptional regulator, MerR family  24.17 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.452136  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4570  regulatory protein MerR  25 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 390 aa  49.7  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2312  putative transcriptional regulator, MerR family  24.78 
 
 		 198 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1810  transcriptional regulator, MerR family  27.43 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  normal  0.140149 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  36.49 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1095  MerR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1034  SoxR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  37.68 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  35.92 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2821  MerR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2165  MerR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0369388  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3218  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1098  transcriptional regulator, MerR family  35.21 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5668  transcriptional regulator, MerR family  26.47 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0738  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0876776  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1569  MerR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.418349 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  26.4 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0411  MerR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.715886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0743  MerR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1287  MerR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2120  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00663209  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1892  MerR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  28.32 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2837  MerR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1968  transcriptional regulator, MerR family  26.36 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0139  transcriptional regulator, MerR family  26.89 
 
 		 183 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2511  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.22268  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06555  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  29.29 
 
 		 145 aa  47.4  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2081  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.665595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0840  transcriptional regulator  25.44 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.413569 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2796  MerR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 132 aa  47.4  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3338  transcriptional regulator, MerR family  28.18 
 
 		 124 aa  47.4  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.770495  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 126 aa  47  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2820  MerR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 176 aa  47  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.218132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>