More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4804 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4804  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 341 aa  687    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5640  transcriptional regulator, MerR family  62.43 
 
 		 334 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3072  MerR family transcriptional regulator  55.85 
 
 		 341 aa  348  7e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5067  MerR family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 351 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5793  MerR family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 351 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4386  MerR family transcriptional regulator  54.25 
 
 		 340 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5066  MerR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 340 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6249  MerR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1830  MerR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00524998  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1366  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 166 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0373128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2377  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 166 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2216  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 166 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.741024  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2249  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 166 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2211  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 166 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1127  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 166 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0247655  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1856  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 166 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424581  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0041  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 166 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21109  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 133 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1741  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 166 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0950545  normal  0.107699 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  34.69 
 
 		 183 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  40.23 
 
 		 255 aa  57  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1768  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 166 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  36.7 
 
 		 142 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  34.65 
 
 		 129 aa  55.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  30.09 
 
 		 255 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  34.35 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  28.57 
 
 		 171 aa  54.3  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 		 150 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  34.82 
 
 		 214 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  36.27 
 
 		 129 aa  54.3  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 215 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 		 114 aa  53.9  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  25.87 
 
 		 157 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2284  transcriptional regulator, MerR family  34.82 
 
 		 215 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  37.36 
 
 		 254 aa  53.5  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2141  MerR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 181 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0481912  normal  0.077667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3210  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 136 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.303617  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  32.08 
 
 		 269 aa  53.1  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1034  MerR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 128 aa  53.1  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0151455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  24.48 
 
 		 157 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2797  MerR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 255 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  34.86 
 
 		 272 aa  53.1  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  28.47 
 
 		 342 aa  52.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 134 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  42.19 
 
 		 92 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  44.64 
 
 		 117 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  31.62 
 
 		 262 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 142 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  30.61 
 
 		 132 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  26.53 
 
 		 267 aa  52.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 342 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 252 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1895  transcriptional regulator, MerR family  29.45 
 
 		 260 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  unclonable  1.71834e-16 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  33.94 
 
 		 155 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  35.14 
 
 		 253 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  43.1 
 
 		 138 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 254 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 268 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  30.7 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  27.18 
 
 		 347 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.3 
 
 		 142 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  29.25 
 
 		 158 aa  50.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  36.67 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  28.93 
 
 		 157 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  36.96 
 
 		 254 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  30.43 
 
 		 159 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  24.63 
 
 		 139 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  30.15 
 
 		 252 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 342 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  32.04 
 
 		 293 aa  50.4  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 342 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 133 aa  50.4  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 342 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 257 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 152 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 158 aa  50.1  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 138 aa  50.1  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4234  regulatory protein, MerR  35.42 
 
 		 96 aa  50.1  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231152  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 250 aa  50.1  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  35.62 
 
 		 253 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 254 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 254 aa  50.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 254 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1094  MerR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 159 aa  50.1  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 253 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 279 aa  49.7  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 141 aa  50.1  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 161 aa  50.1  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  41.03 
 
 		 286 aa  49.7  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>