More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1892 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1892  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 110 aa  224  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04765  putative transcriptional regulator protein  75.45 
 
 		 109 aa  170  5e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.397475  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1008  transcriptional regulator, MerR family  59.22 
 
 		 110 aa  134  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0444  transcriptional regulator, MerR family  54.37 
 
 		 208 aa  120  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1445  transcriptional regulator  54.37 
 
 		 112 aa  120  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.236755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2536  regulatory protein MerR  56.99 
 
 		 111 aa  114  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1052  transcriptional regulator, putative  42.16 
 
 		 118 aa  90.1  8e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.019007 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0580  hypothetical protein  39.81 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2379  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.3851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2301  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0713  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.245561  normal  0.461713 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1889  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000504717  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2621  MerR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361193  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3038  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0025515  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2633  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2223  transcriptional regulator, MerR family  34.58 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000299442 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1522  transcriptional regulator, putative  34.55 
 
 		 117 aa  67  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0919543  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1997  transcriptional regulator, MerR family  34.58 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0483  transcriptional regulator, MerR family  40.58 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0978  transcriptional regulator, MerR family  42.47 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1147  MerR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0571667  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1418  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000205103  normal  0.491097 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0840  transcriptional regulator, MerR family  43.04 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1313  transcriptional regulator, MerR family  37.8 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3922  MerR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.856583  normal  0.167239 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3096  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2364  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1282  MerR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 143 aa  62  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1457  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0494  MerR family transcriptional regulator  31 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0739492  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1705  transcriptional regulator, MerR family  38.75 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310194  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1058  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0761  MerR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 118 aa  62  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0874748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0434  MerR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0887  MerR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0416797  hitchhiker  0.00000266118 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1409  MerR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.783915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4387  MerR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 757 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1501  MerR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.259398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1259  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4609  MerR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.401376  normal  0.0601167 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1596  transcriptional regulator, MerR family  41.1 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.265626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0291  hypothetical protein  39.02 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3018  transcriptional regulator, MerR family  30.39 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438934  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2092  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.681298  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2054  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1167  MerR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354578  normal  0.670626 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2331  transcriptional regulator, MerR family  36.62 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3218  MerR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2472  hypothetical protein  35.06 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3741  transcriptional regulator, MerR family  36.49 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274926  normal  0.767741 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1996  MerR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000181748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1588  MerR family transcriptional regulator  31 
 
 		 195 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3474  MerR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283655 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0919  transcriptional regulator, MerR family  36.25 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2056  regulatory protein MerR  36.62 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.880106  normal  0.300945 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0836  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2017  transcriptional regulator, MerR family  36.62 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2169  regulatory protein, MerR  35.06 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1521  MerR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0401274  normal  0.779885 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1889  MerR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171431  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0051  transcriptional regulator, MerR family  31.31 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1328  MerR family transcriptional regulator  34 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000121427  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1881  putative transcriptional regulator  36.49 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.027165 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2852  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.164617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2013  MerR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 120 aa  60.1  0.000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065719  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2670  regulatory protein, MerR  36.49 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1752  MerR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0206721 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0912  MerR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 840 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2393  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1455  transcriptional regulator, MerR family  35.62 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2798  transcriptional regulator, MerR family  35.21 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1199  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2385  transcriptional regulator, putative  35.06 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170009  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1584  MerR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1288  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1877  transcriptional regulator, MerR family  34.25 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01390  transcription regulator protein  34.72 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249906  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1938  MerR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2109  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.208629  normal  0.127157 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1584  putative transcription regulator protein  36.99 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1014  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986669 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1660  MerR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1343  MerR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0831  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.087298  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2382  transcriptional regulator, MerR family  29 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1640  transcriptional regulator, MerR family  36.99 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402978  normal  0.373133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1970  transcriptional regulator, MerR family  36.99 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.858434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1408  transcriptional regulator, MerR family  28.16 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00332069  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1471  transcriptional regulator domain-containing protein  28.16 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.22835  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1974  MerR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1983  MerR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00884217  normal  0.359201 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4622  MerR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206932  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2749  transcriptional regulator, MerR family  35.21 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1148  MerR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3966  MerR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200799  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2588  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2678  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 252 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00961924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0267  MerR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 196 aa  57.4  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0772  hypothetical protein  33.8 
 
 		 193 aa  57  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1089  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>