180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1660 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1660  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 129 aa  265  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1147  MerR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 118 aa  120  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0571667  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0761  MerR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 118 aa  114  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0874748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2798  transcriptional regulator, MerR family  53.33 
 
 		 118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1167  MerR family transcriptional regulator  50.41 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354578  normal  0.670626 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1282  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1938  MerR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0919  transcriptional regulator, MerR family  55.24 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2054  MerR family transcriptional regulator  52.68 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1974  MerR family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1584  MerR family transcriptional regulator  47.11 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01390  transcription regulator protein  53.27 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249906  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1996  MerR family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000181748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28730  putative transcriptional regulator  52.38 
 
 		 118 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000134436  hitchhiker  0.00000000749265 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2511  hypothetical protein  52.38 
 
 		 118 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2169  regulatory protein, MerR  64.1 
 
 		 118 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1983  MerR family transcriptional regulator  64.56 
 
 		 118 aa  110  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00884217  normal  0.359201 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2385  transcriptional regulator, putative  64.1 
 
 		 118 aa  110  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170009  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0434  MerR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 120 aa  110  9e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1457  transcriptional regulator, MerR family  54.64 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2472  hypothetical protein  60 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3474  MerR family transcriptional regulator  60 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283655 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3218  MerR family transcriptional regulator  60 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330484 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0494  MerR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0739492  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3018  transcriptional regulator, MerR family  53.4 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1471  transcriptional regulator domain-containing protein  50.89 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.22835  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1408  transcriptional regulator, MerR family  50.89 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00332069  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2670  regulatory protein, MerR  55.66 
 
 		 125 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1640  transcriptional regulator, MerR family  58.89 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402978  normal  0.373133 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0836  MerR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 116 aa  107  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1551  MerR family transcriptional regulator  53.15 
 
 		 132 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.724017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1313  transcriptional regulator, MerR family  63.51 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1000  MerR family transcriptional regulator  58.24 
 
 		 137 aa  105  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.861508  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1482  MerR family transcriptional regulator  58.24 
 
 		 137 aa  105  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.858746  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1459  MerR family transcriptional regulator  58.24 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1378  MerR family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0815083  normal  0.541754 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1970  transcriptional regulator, MerR family  57.78 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.858434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4622  MerR family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206932  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1014  MerR family transcriptional regulator  52.43 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986669 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2013  MerR family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 120 aa  103  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065719  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3096  MerR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4609  MerR family transcriptional regulator  60.76 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.401376  normal  0.0601167 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2852  MerR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 130 aa  103  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.164617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1719  MerR family transcriptional regulator  64.94 
 
 		 134 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1406  MerR family transcriptional regulator  57.78 
 
 		 137 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1881  putative transcriptional regulator  64.94 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.027165 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1772  MerR family transcriptional regulator  65.33 
 
 		 136 aa  102  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328935  normal  0.318397 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2092  MerR family transcriptional regulator  61.25 
 
 		 118 aa  102  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.681298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1089  MerR family transcriptional regulator  65.33 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1898  MerR family regulatory protein  65.33 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2588  MerR family transcriptional regulator  65.33 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1366  MerR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1532  MerR family transcriptional regulator  65.33 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.591284  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0196  MerR family transcriptional regulator  65.33 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1742  MerR family transcriptional regulator  65.33 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0970  MerR family transcriptional regulator  65.33 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1584  putative transcription regulator protein  63.16 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2749  transcriptional regulator, MerR family  65.33 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1455  transcriptional regulator, MerR family  62.16 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2393  MerR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1752  MerR family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0206721 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2109  MerR family transcriptional regulator  60.81 
 
 		 159 aa  100  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.208629  normal  0.127157 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1425  transcriptional regulator  41.96 
 
 		 116 aa  99  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000104332  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2847  MerR family transcriptional regulator  62.16 
 
 		 162 aa  99  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.786709  hitchhiker  0.005225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1877  transcriptional regulator, MerR family  60.81 
 
 		 159 aa  97.4  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1343  MerR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 149 aa  97.1  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2607  transcriptional regulator, MerR family  56 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2236  transcriptional regulator, MerR family  56 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.039823 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3922  MerR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.856583  normal  0.167239 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1522  transcriptional regulator, putative  44.66 
 
 		 117 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0919543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1418  MerR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 116 aa  84  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000205103  normal  0.491097 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2223  transcriptional regulator, MerR family  42.99 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000299442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1997  transcriptional regulator, MerR family  47.31 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1889  transcriptional regulator, MerR family  36.61 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000504717  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1416  MerR family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0849625  normal  0.242004 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3741  transcriptional regulator, MerR family  39.82 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274926  normal  0.767741 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3038  MerR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0025515  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2364  MerR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0713  MerR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.245561  normal  0.461713 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0108  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1268  MerR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 272 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194356 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1914  MerR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 282 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.346124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2621  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361193  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2610  MerR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3966  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200799  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0483  transcriptional regulator, MerR family  37.72 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3558  MerR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_002978  WD0058  hypothetical protein  43.28 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0291  hypothetical protein  40.78 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1521  MerR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0401274  normal  0.779885 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1782  MerR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 266 aa  71.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139972 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0650  transcriptional regulator, MerR family  41.3 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00809015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0887  MerR family transcriptional regulator  37 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0416797  hitchhiker  0.00000266118 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1633  hypothetical protein  36.36 
 
 		 181 aa  70.9  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0163  MerR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0640  MerR family transcriptional regulator  48.75 
 
 		 168 aa  70.5  0.000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1501  MerR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.259398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2301  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1722  hypothetical protein  46.88 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1199  transcriptional regulator, MerR family  43.37 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>