286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0580 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0580  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  220  6e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1445  transcriptional regulator  43.81 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.236755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1008  transcriptional regulator, MerR family  53.25 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2536  regulatory protein MerR  41.35 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1892  MerR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04765  putative transcriptional regulator protein  42.86 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.397475  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0444  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 208 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1052  transcriptional regulator, putative  38.61 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.019007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2379  transcriptional regulator, MerR family  40.37 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.3851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0483  transcriptional regulator, MerR family  39.74 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2054  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4609  MerR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.401376  normal  0.0601167 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1147  MerR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0571667  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0836  MerR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1313  transcriptional regulator, MerR family  42.47 
 
 		 173 aa  70.9  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2511  hypothetical protein  35.58 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28730  putative transcriptional regulator  35.58 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000134436  hitchhiker  0.00000000749265 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0713  MerR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.245561  normal  0.461713 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0919  transcriptional regulator, MerR family  34.65 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1366  MerR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1058  transcriptional regulator, MerR family  42.31 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1406  MerR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1501  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 133 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.259398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2621  MerR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361193  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0840  transcriptional regulator, MerR family  36.46 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1970  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.858434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2633  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2588  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2652  MerR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00282985  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2013  MerR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065719  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1772  MerR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328935  normal  0.318397 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01390  transcription regulator protein  34.95 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249906  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2678  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 252 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00961924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1378  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0815083  normal  0.541754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2688  regulatory protein, MerR  38.55 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3096  MerR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1014  MerR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986669 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1719  MerR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0831  MerR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.087298  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1640  transcriptional regulator, MerR family  38.37 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402978  normal  0.373133 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4622  MerR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206932  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2798  transcriptional regulator, MerR family  33.98 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1983  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00884217  normal  0.359201 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2610  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 281 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1268  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 272 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194356 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1199  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 179 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1288  transcriptional regulator, MerR family  39.47 
 
 		 179 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0761  MerR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0874748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0978  transcriptional regulator, MerR family  40.51 
 
 		 254 aa  67  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0970  MerR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 126 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1889  transcriptional regulator, MerR family  43.06 
 
 		 116 aa  67  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000504717  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1551  MerR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.724017  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1584  putative transcription regulator protein  42.25 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1089  MerR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1898  MerR family regulatory protein  38.82 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0494  MerR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0739492  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1343  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1742  MerR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1259  transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1532  MerR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.591284  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0196  MerR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2516  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1974  MerR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2472  hypothetical protein  41.18 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3474  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283655 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1596  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.265626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2169  regulatory protein, MerR  41.18 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1914  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.346124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1938  MerR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1660  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3022  transcriptional regulator, MerR family  37.35 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1588  MerR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1167  MerR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354578  normal  0.670626 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1457  transcriptional regulator, MerR family  34.07 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3218  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330484 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2852  MerR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.164617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2393  MerR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1633  hypothetical protein  38.16 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1455  transcriptional regulator, MerR family  40.28 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1282  MerR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1425  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000104332  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1418  MerR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000205103  normal  0.491097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4629  MerR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00782953  normal  0.030329 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1584  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2109  MerR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.208629  normal  0.127157 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1459  MerR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1000  MerR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.861508  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1722  hypothetical protein  34.57 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1482  MerR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.858746  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1889  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171431  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2382  transcriptional regulator, MerR family  30.19 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1705  transcriptional regulator, MerR family  37.33 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310194  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2092  MerR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.681298  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0434  MerR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1881  putative transcriptional regulator  38.16 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.027165 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1409  MerR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 206 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.783915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3558  MerR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1148  MerR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4387  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 757 aa  64.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3018  transcriptional regulator, MerR family  33.65 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>