97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0092 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0092  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  100 
 
 
319 aa  654    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  23.55 
 
 
446 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  23.71 
 
 
442 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3476  beta-lactamase  23.7 
 
 
474 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  27.27 
 
 
348 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  27.27 
 
 
340 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  27.48 
 
 
460 aa  60.5  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  27.27 
 
 
340 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  27.27 
 
 
340 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1136  beta-lactamase  25 
 
 
357 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167829  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  24.82 
 
 
404 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  26.84 
 
 
340 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  21.53 
 
 
450 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  27.71 
 
 
446 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.36 
 
 
487 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  22.64 
 
 
450 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  27.06 
 
 
388 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  25.62 
 
 
595 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7012  beta-lactamase  21.66 
 
 
467 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.858592 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  26.61 
 
 
388 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  27.06 
 
 
388 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.06 
 
 
388 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  26.61 
 
 
388 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  26.9 
 
 
361 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  26.61 
 
 
388 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  25.74 
 
 
513 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.61 
 
 
389 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  26.61 
 
 
388 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1501  beta-lactamase  24.78 
 
 
447 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130484  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  26.61 
 
 
388 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  25.11 
 
 
377 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  28.78 
 
 
345 aa  50.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  28.02 
 
 
401 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2721  penicillin-binding protein  25.43 
 
 
340 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0897232  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  27.1 
 
 
496 aa  49.7  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  24.28 
 
 
390 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12878  beta-lactamase, putative  24.23 
 
 
504 aa  49.7  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  26.34 
 
 
349 aa  49.7  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  26.42 
 
 
494 aa  49.7  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  21.98 
 
 
590 aa  49.3  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  25.58 
 
 
381 aa  49.3  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  25.12 
 
 
2457 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1876  beta-lactamase  22.35 
 
 
493 aa  49.3  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2537  beta-lactamase  21.67 
 
 
393 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3061  beta-lactamase  23.98 
 
 
351 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.502148  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3187  beta-lactamase  25.17 
 
 
454 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000216369  hitchhiker  0.000000000911992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  27.07 
 
 
477 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  22.77 
 
 
476 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.63 
 
 
388 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1021  beta-lactamase  22.84 
 
 
353 aa  47.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.627803  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.37 
 
 
378 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4788  beta-lactamase  27.09 
 
 
400 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416977  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  26.19 
 
 
384 aa  47.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  23.29 
 
 
341 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  26.92 
 
 
369 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  24.08 
 
 
341 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.6 
 
 
407 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0398  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.74 
 
 
366 aa  46.6  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  24.32 
 
 
481 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0151  beta-lactamase  24.9 
 
 
394 aa  46.2  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.288429 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1551  beta-lactamase  23.63 
 
 
333 aa  45.8  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  0.407276 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  27.31 
 
 
453 aa  45.8  0.0009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2539  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.67 
 
 
445 aa  45.8  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2704  beta-lactamase  25.24 
 
 
371 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  21 
 
 
600 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  24.32 
 
 
463 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  26.87 
 
 
578 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  22.5 
 
 
361 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  25.12 
 
 
385 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1031  beta-lactamase  25.93 
 
 
358 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  23.83 
 
 
363 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  20.59 
 
 
616 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  25.12 
 
 
385 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  22.93 
 
 
462 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2550  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  24.88 
 
 
489 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  24 
 
 
431 aa  44.3  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  25.12 
 
 
385 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.12 
 
 
407 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  23.32 
 
 
481 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.12 
 
 
385 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  23.32 
 
 
481 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  25.12 
 
 
385 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  23.53 
 
 
356 aa  43.9  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  23.32 
 
 
481 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0674  beta-lactamase  23.04 
 
 
715 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.076052 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1814  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  28.21 
 
 
308 aa  43.9  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000499701  hitchhiker  0.00000206424 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  22.09 
 
 
862 aa  43.5  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  21.22 
 
 
513 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0971  beta-lactamase  26.38 
 
 
352 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1850  Beta-lactamase class C or other penicillin binding protein  23.11 
 
 
338 aa  43.1  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000532294  hitchhiker  0.000116253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4430  beta-lactamase  23.64 
 
 
434 aa  43.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7182  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25 
 
 
420 aa  42.7  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0226696 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0801  beta-lactamase  23.67 
 
 
478 aa  42.7  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.87828  normal  0.048033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5173  putative beta lactamase family protein  25.45 
 
 
462 aa  42.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  25.13 
 
 
343 aa  42.7  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  23.11 
 
 
434 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  23 
 
 
524 aa  42.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.847415 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>