281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1001 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 460 aa  905    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  50.11 
 
 		 455 aa  431  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  48.79 
 
 		 452 aa  409  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0195  metallo-beta-lactamase family protein  50.44 
 
 		 472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  50.44 
 
 		 472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  50.44 
 
 		 459 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  50.22 
 
 		 603 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  50.44 
 
 		 472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  50.22 
 
 		 472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  46.75 
 
 		 477 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  45.83 
 
 		 454 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  48.78 
 
 		 452 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  48.25 
 
 		 470 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  46.93 
 
 		 452 aa  404  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  46.96 
 
 		 455 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  46.93 
 
 		 452 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1662  Beta-lactamase-like  47.66 
 
 		 453 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  47.38 
 
 		 455 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  48.9 
 
 		 468 aa  397  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  47.59 
 
 		 467 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0462  metallo-beta-lactamase family protein  49.13 
 
 		 589 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2474  beta-lactamase-like protein  46.83 
 
 		 473 aa  398  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.766773  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  46.51 
 
 		 455 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  48.14 
 
 		 468 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1508  beta-lactamase domain-containing protein  47.47 
 
 		 452 aa  398  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.872448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  46.21 
 
 		 472 aa  393  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  46.61 
 
 		 453 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  47.88 
 
 		 452 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  46.05 
 
 		 452 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  45.85 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  45.85 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  46.48 
 
 		 457 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  46.31 
 
 		 452 aa  388  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  45.51 
 
 		 454 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  46.05 
 
 		 454 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  44.59 
 
 		 453 aa  386  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  42.26 
 
 		 470 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  43.86 
 
 		 452 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  42.16 
 
 		 476 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  48.58 
 
 		 454 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  43.64 
 
 		 452 aa  378  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  48.58 
 
 		 454 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  46.46 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  48.61 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  44.86 
 
 		 455 aa  376  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  48.19 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  48.4 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  44.74 
 
 		 452 aa  373  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2580  beta-lactamase domain protein  46.71 
 
 		 454 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3227  beta-lactamase domain-containing protein  46.71 
 
 		 454 aa  368  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2046  beta-lactamase domain-containing protein  41.92 
 
 		 461 aa  364  2e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  48.24 
 
 		 461 aa  358  7e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  38.89 
 
 		 467 aa  350  2e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  38.2 
 
 		 468 aa  348  1e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  37.55 
 
 		 468 aa  341  2e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.8 
 
 		 530 aa  333  3e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2623  metallo-beta-lactamase family protein  41.01 
 
 		 451 aa  330  4e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.79 
 
 		 536 aa  326  5e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  37.09 
 
 		 525 aa  319  7.999999999999999e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  41.53 
 
 		 524 aa  318  1e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  40.72 
 
 		 467 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  40.87 
 
 		 469 aa  316  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.42 
 
 		 543 aa  316  7e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.52 
 
 		 525 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  40.3 
 
 		 467 aa  312  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.76 
 
 		 541 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  39.44 
 
 		 544 aa  310  4e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  40.65 
 
 		 470 aa  310  4e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  34.68 
 
 		 522 aa  310  4e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.26 
 
 		 471 aa  309  8e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  35.85 
 
 		 570 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  37.34 
 
 		 536 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  39.23 
 
 		 468 aa  303  5.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  38.25 
 
 		 467 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.76 
 
 		 540 aa  301  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.91 
 
 		 467 aa  301  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  36.77 
 
 		 536 aa  300  3e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.48 
 
 		 469 aa  297  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  40.17 
 
 		 467 aa  296  4e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.72 
 
 		 470 aa  296  6e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0156  beta-lactamase-like protein  42.29 
 
 		 485 aa  295  9e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.98 
 
 		 474 aa  293  3e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.03 
 
 		 466 aa  294  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  34.99 
 
 		 536 aa  293  5e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  33.84 
 
 		 465 aa  292  9e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  35.73 
 
 		 535 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  36.13 
 
 		 468 aa  289  9e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.98 
 
 		 465 aa  287  2e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.46 
 
 		 455 aa  287  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  38.44 
 
 		 531 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  35.26 
 
 		 466 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  34.77 
 
 		 535 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  34.89 
 
 		 470 aa  286  7e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  36.14 
 
 		 465 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  36.46 
 
 		 469 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  36.83 
 
 		 462 aa  283  7.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  36.83 
 
 		 462 aa  283  7.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  36.85 
 
 		 462 aa  279  6e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4088  beta-lactamase-like  37.64 
 
 		 532 aa  279  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  38.06 
 
 		 465 aa  278  1e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>