More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1225 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  100 
 
 		 322 aa  660    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  53.97 
 
 		 310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  47.93 
 
 		 306 aa  267  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1563  carboxynorspermidine decarboxylase  46.48 
 
 		 312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1651  ApbE family lipoprotein  46.42 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2787  apbE family protein  40.97 
 
 		 305 aa  219  6e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.778889  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0574  ApbE-like lipoprotein  39.34 
 
 		 279 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.963363  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2333  ApbE family lipoprotein  38.83 
 
 		 319 aa  193  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00261528  normal  0.177607 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1683  ApbE family lipoprotein  41.75 
 
 		 304 aa  192  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000335311  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1926  ApbE family lipoprotein  37.77 
 
 		 301 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0099815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  37.77 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  37.77 
 
 		 301 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  37.77 
 
 		 302 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2084  ApbE family lipoprotein  37.92 
 
 		 275 aa  179  8e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107249  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  37.23 
 
 		 304 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2103  apbE family protein  37.55 
 
 		 275 aa  172  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1178  ApbE family protein  37.81 
 
 		 299 aa  172  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023385 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1127  ApbE family lipoprotein  35.97 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.390448  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  35.87 
 
 		 300 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  36.76 
 
 		 300 aa  169  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  35.51 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3407  ApbE family lipoprotein  36.24 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1898  ApbE family lipoprotein  36.48 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0683316 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  36.62 
 
 		 331 aa  159  7e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.2 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  34.2 
 
 		 315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  34.09 
 
 		 353 aa  153  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  31.25 
 
 		 335 aa  152  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  32.8 
 
 		 349 aa  149  7e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  32.8 
 
 		 349 aa  149  8e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  34.22 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  31.73 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  32.66 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  32.58 
 
 		 309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  36.33 
 
 		 386 aa  139  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  31.11 
 
 		 350 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  30.1 
 
 		 380 aa  136  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  32.72 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  30.45 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  31.23 
 
 		 348 aa  136  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  32.86 
 
 		 336 aa  136  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  32.41 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.3 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  37.17 
 
 		 355 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  35.19 
 
 		 348 aa  132  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  31.34 
 
 		 353 aa  132  9e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.22 
 
 		 320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  33.21 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  33.62 
 
 		 381 aa  130  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  30.53 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  29.83 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  30 
 
 		 343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  31.9 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  32.14 
 
 		 369 aa  125  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.47 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  33.08 
 
 		 308 aa  122  9e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0009  ApbE-like lipoprotein  30.66 
 
 		 346 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109653  normal  0.0510654 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  30.22 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.65 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  35.04 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.77 
 
 		 349 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  34.98 
 
 		 362 aa  119  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  34.76 
 
 		 339 aa  119  9e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  32.99 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  32.18 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  32.05 
 
 		 350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2878  ApbE family lipoprotein  37.93 
 
 		 348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  33.58 
 
 		 340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  29.84 
 
 		 345 aa  115  7.999999999999999e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  32.53 
 
 		 362 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  29.1 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.71 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0575  ApbE family lipoprotein  33.08 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  30.69 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.6 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  27.15 
 
 		 371 aa  112  6e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0280  nosX protein  30.93 
 
 		 330 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  32.48 
 
 		 360 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  32.03 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  25.82 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1826  ApbE-like lipoprotein  28.63 
 
 		 351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  32.03 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2382  ApbE family protein  30.11 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  35.2 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  29.12 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  26.88 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  32.51 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  29.32 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  28.91 
 
 		 347 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  35.16 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1601  ApbE family lipoprotein  31.13 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0279572  normal  0.0160847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2856  ApbE family lipoprotein  29.55 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  31.45 
 
 		 325 aa  109  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3394  ApbE family lipoprotein  29.8 
 
 		 315 aa  108  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  32.94 
 
 		 349 aa  108  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3147  twin-arginine translocation pathway signal  31.15 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  27.93 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  28.2 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  27.93 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  29.47 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>