163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0077 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0077  RNA-binding S1 domain-containing protein  100 
 
 
265 aa  525  1e-148  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.541121 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1128  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  37.8 
 
 
264 aa  170  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1567  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  38.64 
 
 
268 aa  170  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1396  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  39.37 
 
 
265 aa  170  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2051  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  35.55 
 
 
259 aa  166  3e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0416  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  35.83 
 
 
257 aa  163  2e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.131172  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1299  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  33.98 
 
 
257 aa  160  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  35.5 
 
 
265 aa  158  9e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1951  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  36.08 
 
 
263 aa  158  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.612676 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1699  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  36.26 
 
 
265 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328913  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0964  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  36.64 
 
 
265 aa  156  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.497618  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0957  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  34.38 
 
 
261 aa  155  6e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.652274  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0982  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  36.25 
 
 
265 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1152  translation initiation factor 2, alpha subunit  38.86 
 
 
254 aa  152  7e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0703  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  33.08 
 
 
262 aa  143  3e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2790  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.91 
 
 
266 aa  137  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.289487  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2880  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.46 
 
 
277 aa  135  6e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.651055  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2502  translation initiation factor 2, alpha subunit  26.17 
 
 
266 aa  126  4e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0870  translation initiation factor 2, alpha subunit  26.17 
 
 
266 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1359  translation initiation factor 2, alpha subunit  31.91 
 
 
277 aa  123  3e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.256809  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1802  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  31.36 
 
 
256 aa  121  1e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  26.95 
 
 
266 aa  118  1e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0642  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  26.79 
 
 
265 aa  115  8e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  2.04722e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2023  translation initiation factor 2, alpha subunit  29.22 
 
 
266 aa  115  8e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1783  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  30.08 
 
 
265 aa  107  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.030089 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0433  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  27.89 
 
 
264 aa  105  7e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1687  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.12 
 
 
264 aa  103  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.640158  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0995  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  27.35 
 
 
266 aa  100  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34538  predicted protein  28.35 
 
 
320 aa  93.6  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000454395  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00230  eukaryotic translation initiation factor 2 alpha subunit, putative  27.95 
 
 
300 aa  89.4  5e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.433033  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03156  translation initiation factor eIF2 alpha subunit (Eurofung)  25.1 
 
 
308 aa  78.6  9e-14  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119592  Eukaryotic translation initiation factor 2, alpha subunit  25.65 
 
 
322 aa  65.9  7e-10  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0150821  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  33.71 
 
 
121 aa  54.7  1e-06  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3511  general stress protein 13  37.78 
 
 
133 aa  54.7  1e-06  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2080  cytidylate kinase/ribosomal protein S1  36.71 
 
 
811 aa  53.5  3e-06  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19980  SSU ribosomal protein S1P  38.96 
 
 
407 aa  52.4  7e-06  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5039  general stress protein 13  34.48 
 
 
114 aa  52.4  8e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5044  general stress protein 13  34.48 
 
 
114 aa  52.4  8e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4610  general stress protein 13  34.48 
 
 
114 aa  52  9e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4632  general stress protein 13  34.48 
 
 
114 aa  52  9e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5032  general stress protein 13  34.48 
 
 
114 aa  52  9e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0608546  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5132  general stress protein 13  34.48 
 
 
114 aa  52  9e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5011  general stress protein 13  34.48 
 
 
114 aa  52  9e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0202  general stress protein 13  34.48 
 
 
114 aa  52  9e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4770  general stress protein 13  34.48 
 
 
114 aa  52  9e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4722  general stress protein 13  34.48 
 
 
114 aa  52  1e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0122  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.17 
 
 
126 aa  50.4  3e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2017  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  40.58 
 
 
718 aa  50.4  3e-05  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000536157  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0164  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.37 
 
 
704 aa  50.4  3e-05  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10450  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  28.4 
 
 
678 aa  50.1  4e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  8.87819e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0227  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.74 
 
 
722 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133448  normal  0.547858 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3632  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.74 
 
 
728 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0176906  hitchhiker  0.00320297 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3935  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.52 
 
 
715 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.138516  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4507  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.27 
 
 
745 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.398327 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2523  RNA binding S1 domain protein  36.36 
 
 
405 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2872  RNA binding S1 domain protein  36.36 
 
 
487 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.49 
 
 
411 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3070  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.49 
 
 
707 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.526485  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4916  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.95 
 
 
725 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0605  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.19 
 
 
718 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2081  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.41 
 
 
714 aa  47.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0369235  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0674  RNA binding S1  35.14 
 
 
127 aa  47  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.175739 
 
 
-
 
NC_004310  BR2169  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.41 
 
 
714 aa  47  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.184355  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0694  RNA binding S1 domain protein  34.15 
 
 
554 aa  47  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1710  RNA-binding protein  34.25 
 
 
127 aa  47  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.034913  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0970  RNA-binding protein  27.27 
 
 
143 aa  46.6  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0448  RNA-binding protein  30.77 
 
 
121 aa  47  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.308089 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15110  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  33.77 
 
 
376 aa  46.6  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44863  predicted protein  36.67 
 
 
956 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2897  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.75 
 
 
725 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0268  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  38.27 
 
 
714 aa  46.6  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00840028 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  31.65 
 
 
557 aa  45.8  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02120  30S ribosomal subunit protein S1  27.56 
 
 
504 aa  46.2  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  6.18962e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0066  RNA binding S1 domain protein  31.96 
 
 
129 aa  46.2  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0703  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.33 
 
 
713 aa  46.2  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0896  30S ribosomal protein S1  35.14 
 
 
408 aa  45.8  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0028  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.51 
 
 
718 aa  45.8  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.171141 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0436  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40 
 
 
722 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11646  30S ribosomal protein S1  35.06 
 
 
481 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.75465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2435  RNA binding S1 domain protein  35.06 
 
 
499 aa  45.4  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1102  30S ribosomal protein S1  34.88 
 
 
401 aa  45.8  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.46853e-05  normal  0.0119462 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39066  predicted protein  26.27 
 
 
325 aa  45.4  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380763  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1995  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.38 
 
 
815 aa  45.4  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3020  30S ribosomal protein S1  33.77 
 
 
479 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156856  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0142  RNA binding S1 domain protein  34.18 
 
 
128 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.17569e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1129  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.73 
 
 
694 aa  45.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  36 
 
 
491 aa  45.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0601  30S ribosomal protein S1  34.21 
 
 
500 aa  45.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  33.73 
 
 
124 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1703  RNA binding S1 domain protein  31.94 
 
 
385 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  2.41805e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0127  30S ribosomal protein S1  34.25 
 
 
551 aa  45.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4027  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.04 
 
 
752 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.749576  normal  0.189287 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4396  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.04 
 
 
745 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.735081 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0743  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.33 
 
 
713 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10381  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0089  RNA binding S1  36.26 
 
 
152 aa  45.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1795  SSU ribosomal protein S1P  30.61 
 
 
539 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3005  30S ribosomal protein S1  33.77 
 
 
479 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1154  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  38.16 
 
 
672 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3051  30S ribosomal protein S1  33.77 
 
 
479 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30354  Putative mitochondrial ribosomal protein S1  32.22 
 
 
352 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0824042 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>