More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0615 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0615  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 491 aa  968    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4172  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  47.62 
 
 		 488 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03897  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2586  putative transcriptional regulator, GntR family  40.8 
 
 		 478 aa  272  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0905182 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3373  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 478 aa  249  5e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576212  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0748  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.64 
 
 		 493 aa  244  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6790  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.89 
 
 		 487 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2093  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.32 
 
 		 503 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.619312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2248  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.4 
 
 		 486 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000288373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5956  putative transcriptional regulator, GntR family  36.8 
 
 		 486 aa  239  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.072408 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0620  GntR family transcriptional regulator  36.85 
 
 		 496 aa  238  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2700  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  34.93 
 
 		 475 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0691632 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1043  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.73 
 
 		 486 aa  227  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0925  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 485 aa  226  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2441  GntR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 449 aa  226  8e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2369  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.23 
 
 		 505 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3184  regulatory protein GntR, HTH  36.97 
 
 		 485 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1835  GntR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.422733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3410  transcriptional regulator  36.69 
 
 		 485 aa  220  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.723571  decreased coverage  0.0095682 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3924  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.53 
 
 		 468 aa  219  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1901  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 478 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1854  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 478 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4144  putative transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.805557 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1408  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.07 
 
 		 488 aa  217  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  29.52 
 
 		 477 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5610  putative transcriptional regulator, GntR family  36.34 
 
 		 468 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.04 
 
 		 477 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1217  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.51 
 
 		 466 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 477 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  29.82 
 
 		 477 aa  207  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 477 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.61 
 
 		 477 aa  206  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 477 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.98 
 
 		 477 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.28 
 
 		 477 aa  204  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  0.00000201635 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 477 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4275  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 480 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.310254  normal  0.794822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3402  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.53 
 
 		 515 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000368024  hitchhiker  0.000012724 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 520 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2084  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 504 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.87186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.52 
 
 		 480 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 480 aa  196  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  35.34 
 
 		 517 aa  195  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  29.98 
 
 		 480 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  29.2 
 
 		 480 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 480 aa  194  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 480 aa  194  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.2 
 
 		 480 aa  194  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.9 
 
 		 483 aa  193  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 480 aa  193  7e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  29.2 
 
 		 480 aa  193  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 480 aa  190  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 480 aa  190  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 547 aa  189  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  32.34 
 
 		 493 aa  188  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 480 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  32.53 
 
 		 498 aa  185  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  29.12 
 
 		 480 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 481 aa  181  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 477 aa  179  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  29.18 
 
 		 480 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 477 aa  177  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.32 
 
 		 490 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 477 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  29.66 
 
 		 477 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  29.43 
 
 		 477 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 477 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29 
 
 		 477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  39.62 
 
 		 377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  32.29 
 
 		 500 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  28.14 
 
 		 479 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 477 aa  173  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 477 aa  173  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  26.92 
 
 		 477 aa  173  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  26.96 
 
 		 503 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5787  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.85 
 
 		 483 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0208  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 466 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0251  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 467 aa  172  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3329  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 515 aa  171  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.895754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0253  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 483 aa  171  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  32.62 
 
 		 484 aa  171  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 498 aa  170  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.16 
 
 		 468 aa  169  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4096  GntR family transcriptional regulator  31.81 
 
 		 474 aa  169  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  28.95 
 
 		 482 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 477 aa  167  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  29.67 
 
 		 478 aa  167  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2335  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.04 
 
 		 470 aa  167  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.179489  normal  0.948278 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  28.98 
 
 		 482 aa  166  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 482 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  28.73 
 
 		 482 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  28.98 
 
 		 482 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  27.61 
 
 		 485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 478 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4265  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0310844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4791  transcriptional regulator  31.86 
 
 		 464 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  26.03 
 
 		 477 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  26.54 
 
 		 477 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 473 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 477 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 477 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>