More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5323 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  100 
 
 		 355 aa  704    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  65.6 
 
 		 368 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  62.39 
 
 		 373 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  65.36 
 
 		 317 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  67 
 
 		 306 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  62.87 
 
 		 312 aa  379  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  63.75 
 
 		 310 aa  375  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  60.87 
 
 		 319 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  61.54 
 
 		 322 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  62.67 
 
 		 300 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  62.67 
 
 		 300 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  62.67 
 
 		 300 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  60.94 
 
 		 335 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  61.28 
 
 		 324 aa  356  2.9999999999999997e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  56.29 
 
 		 346 aa  355  5.999999999999999e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  58.72 
 
 		 348 aa  353  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  60.33 
 
 		 314 aa  352  4e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.69 
 
 		 318 aa  351  1e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  60.27 
 
 		 328 aa  351  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  59.6 
 
 		 320 aa  350  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  60.2 
 
 		 301 aa  350  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  59.55 
 
 		 316 aa  350  2e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  60.2 
 
 		 301 aa  348  6e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  55.03 
 
 		 315 aa  344  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  58.59 
 
 		 314 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  57.24 
 
 		 306 aa  336  3.9999999999999995e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  54.88 
 
 		 361 aa  334  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  58.25 
 
 		 305 aa  333  3e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  58.75 
 
 		 314 aa  331  9e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  57.98 
 
 		 310 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  57.48 
 
 		 314 aa  330  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  54.43 
 
 		 313 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  55.35 
 
 		 319 aa  326  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  58.86 
 
 		 302 aa  325  5e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  55.74 
 
 		 313 aa  325  6e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  57.42 
 
 		 308 aa  325  9e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  58.42 
 
 		 306 aa  325  9e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  54.24 
 
 		 318 aa  324  1e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  54.43 
 
 		 318 aa  323  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  54.4 
 
 		 309 aa  323  3e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  54.78 
 
 		 314 aa  321  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  58.33 
 
 		 302 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  56.23 
 
 		 310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  55.7 
 
 		 313 aa  319  6e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  55.92 
 
 		 309 aa  314  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  54.73 
 
 		 303 aa  310  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  55.41 
 
 		 305 aa  308  6.999999999999999e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  55.26 
 
 		 304 aa  308  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  53.67 
 
 		 305 aa  304  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  58.45 
 
 		 304 aa  296  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  54.46 
 
 		 303 aa  293  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  51.62 
 
 		 327 aa  293  3e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  61.6 
 
 		 398 aa  287  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  51.37 
 
 		 330 aa  285  7e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  49.83 
 
 		 316 aa  284  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  50 
 
 		 337 aa  282  6.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  53.85 
 
 		 311 aa  280  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  45.28 
 
 		 330 aa  276  4e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  52.8 
 
 		 311 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  51.2 
 
 		 300 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  48.66 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  49.5 
 
 		 298 aa  267  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  44.74 
 
 		 457 aa  266  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.32 
 
 		 324 aa  265  8e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  59.72 
 
 		 244 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.5 
 
 		 252 aa  260  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.08 
 
 		 368 aa  259  5.0000000000000005e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  55.13 
 
 		 496 aa  255  9e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  57.34 
 
 		 241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.96 
 
 		 319 aa  248  8e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  50.17 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  49.15 
 
 		 314 aa  246  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  59.5 
 
 		 258 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  47.96 
 
 		 300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  46.82 
 
 		 297 aa  243  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  46.39 
 
 		 305 aa  243  5e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  48.12 
 
 		 297 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  45.07 
 
 		 316 aa  233  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.07 
 
 		 350 aa  232  7.000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  56.52 
 
 		 234 aa  232  9e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  45.95 
 
 		 309 aa  230  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  46.26 
 
 		 303 aa  229  6e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  53.88 
 
 		 242 aa  228  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  53.4 
 
 		 245 aa  226  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  53.52 
 
 		 238 aa  225  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  46.76 
 
 		 302 aa  225  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  48.31 
 
 		 299 aa  225  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  44.85 
 
 		 298 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  48.31 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.5 
 
 		 247 aa  219  7.999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  44.05 
 
 		 307 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  51.63 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  54.27 
 
 		 317 aa  212  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  49.1 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2958  ABC transporter related protein  42.43 
 
 		 310 aa  203  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.66 
 
 		 264 aa  201  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.330888  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2408  ABC transporter related  51.63 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799647  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  41.32 
 
 		 311 aa  199  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  40.96 
 
 		 301 aa  199  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  43.39 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>