More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4681 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 333 aa  659    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  58.05 
 
 		 314 aa  342  7e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  50.33 
 
 		 341 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  51.02 
 
 		 340 aa  300  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  52.68 
 
 		 340 aa  299  5e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  52.68 
 
 		 340 aa  298  8e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  52.68 
 
 		 340 aa  298  8e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  51.99 
 
 		 361 aa  295  9e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  51.34 
 
 		 350 aa  293  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  52.23 
 
 		 340 aa  291  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  47.42 
 
 		 350 aa  290  4e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  49 
 
 		 301 aa  283  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  48.68 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  48.01 
 
 		 322 aa  253  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  48.01 
 
 		 290 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  47.96 
 
 		 287 aa  244  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  48.57 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  48.57 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  48.57 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  48.92 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 291 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  44.52 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  34.31 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  34.75 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  34.05 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  33.94 
 
 		 284 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 		 339 aa  115  8.999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 		 286 aa  108  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 		 309 aa  105  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  32.4 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1079  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.622662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 271 aa  102  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 287 aa  99.4  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 		 312 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  32.41 
 
 		 299 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  33.1 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 271 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 		 346 aa  97.4  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  28.11 
 
 		 313 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  28.51 
 
 		 313 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  31.54 
 
 		 274 aa  97.1  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 288 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 		 290 aa  96.7  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 		 316 aa  96.3  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.74 
 
 		 372 aa  96.3  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.23 
 
 		 370 aa  95.9  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 		 286 aa  95.9  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 		 310 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  25.09 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 272 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 		 279 aa  95.5  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 345 aa  95.1  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  28.77 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  29.79 
 
 		 275 aa  95.1  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  22.5 
 
 		 281 aa  94.4  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 279 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 316 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  27.81 
 
 		 278 aa  93.2  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 297 aa  92.8  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  28.42 
 
 		 300 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 		 263 aa  92.8  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5882  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 		 273 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 		 260 aa  92.8  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  28.1 
 
 		 462 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  24.32 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  31.95 
 
 		 272 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 270 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  46.67 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 		 240 aa  91.7  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  27.72 
 
 		 300 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  27.37 
 
 		 300 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 		 315 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  29.63 
 
 		 289 aa  90.9  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.6 
 
 		 370 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 270 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  27.37 
 
 		 300 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  27.37 
 
 		 300 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.11 
 
 		 369 aa  89.7  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  28.42 
 
 		 270 aa  89.7  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  27.92 
 
 		 315 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  27.92 
 
 		 315 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 291 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 288 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 291 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 		 277 aa  89.4  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0348  magnesium chelatase accessory protein  33.1 
 
 		 322 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  27.11 
 
 		 456 aa  89.4  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  38.14 
 
 		 321 aa  89  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  27.02 
 
 		 300 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 270 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  30.15 
 
 		 271 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  32.1 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>