More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0623 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 302 aa  601  1.0000000000000001e-171  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  55.94 
 
 		 316 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  55.24 
 
 		 316 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  55.52 
 
 		 316 aa  299  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  52.76 
 
 		 318 aa  298  9e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  53.31 
 
 		 315 aa  295  5e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  53.31 
 
 		 312 aa  295  5e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  51.19 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  52.3 
 
 		 295 aa  288  7e-77  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  51.85 
 
 		 295 aa  279  4e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  50.17 
 
 		 315 aa  275  9e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  52.5 
 
 		 295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  49.83 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  48.24 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  47.96 
 
 		 312 aa  265  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  49.3 
 
 		 309 aa  265  5.999999999999999e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  51.55 
 
 		 317 aa  265  8e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  49.3 
 
 		 321 aa  259  4e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  51.64 
 
 		 317 aa  258  9e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  50.34 
 
 		 304 aa  257  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  50.7 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  51.82 
 
 		 317 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  51.82 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  50.18 
 
 		 328 aa  255  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  50.18 
 
 		 328 aa  255  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  50.88 
 
 		 315 aa  253  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  50 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  50 
 
 		 353 aa  250  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  50.18 
 
 		 313 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  49.12 
 
 		 313 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  46.9 
 
 		 308 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2232  protoheme IX farnesyltransferase  49.16 
 
 		 330 aa  245  8e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0835279  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  51.39 
 
 		 345 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  48.42 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1239  protoheme IX farnesyltransferase  49.3 
 
 		 316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  47.72 
 
 		 313 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  44.98 
 
 		 310 aa  241  9e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  44.98 
 
 		 310 aa  241  9e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2347  protoheme IX farnesyltransferase  49.63 
 
 		 317 aa  239  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  46.8 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  43.25 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  45.07 
 
 		 305 aa  235  6e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2335  protoheme IX farnesyltransferase  45.33 
 
 		 313 aa  233  3e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  44.98 
 
 		 310 aa  232  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  43.51 
 
 		 622 aa  232  5e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0262  protoheme IX farnesyltransferase  47.87 
 
 		 317 aa  231  9e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  44.76 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  46.43 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1141  protoheme IX farnesyltransferase  47.77 
 
 		 328 aa  228  7e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  44.48 
 
 		 301 aa  226  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  46.43 
 
 		 296 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  48.16 
 
 		 312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  42.57 
 
 		 304 aa  225  8e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  45.55 
 
 		 306 aa  225  9e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0150  protoheme IX farnesyltransferase  45.49 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  42.76 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  42.23 
 
 		 304 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  48.26 
 
 		 297 aa  223  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  44.29 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  46.81 
 
 		 302 aa  220  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  43.77 
 
 		 305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  42.7 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  43.71 
 
 		 535 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  44.74 
 
 		 317 aa  216  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  43.77 
 
 		 298 aa  216  4e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  43.54 
 
 		 309 aa  216  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  45 
 
 		 297 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  43.45 
 
 		 301 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  44.12 
 
 		 300 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  44.12 
 
 		 300 aa  215  9e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  44.24 
 
 		 300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  43.75 
 
 		 300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  41.84 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  40.92 
 
 		 300 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  40.92 
 
 		 300 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  41.84 
 
 		 300 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  41.84 
 
 		 300 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  43.31 
 
 		 301 aa  212  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  40.92 
 
 		 300 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  41.84 
 
 		 300 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  40.92 
 
 		 300 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  43.38 
 
 		 301 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  43.38 
 
 		 301 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  40.92 
 
 		 300 aa  212  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  41.58 
 
 		 303 aa  212  7e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  44.12 
 
 		 301 aa  211  9e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  40.92 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  40.92 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  43.38 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  40.78 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0630  protoheme IX farnesyltransferase  44.59 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.781454  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  44.59 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  43.37 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  40.92 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  43.38 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  42.14 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2402  protoheme IX farnesyltransferase  45.71 
 
 		 306 aa  210  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  41.84 
 
 		 300 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  42.31 
 
 		 313 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>