More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3196 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3196  ethanolamine transproter  100 
 
 
479 aa  938    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0275904  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4842  ethanolamine transproter  83.97 
 
 
490 aa  671    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2931  ethanolamine transproter  82.94 
 
 
479 aa  719    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4869  ethanolamine transproter  83.33 
 
 
467 aa  764    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154328  normal  0.109482 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1848  ethanolamine transporter  79.5 
 
 
479 aa  750    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.079886  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3442  ethanolamine transproter  91.67 
 
 
469 aa  786    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4486  ethanolamine permease  83.33 
 
 
467 aa  764    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4573  ethanolamine transproter  83.33 
 
 
467 aa  764    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3632  ethanolamine transproter  70.29 
 
 
488 aa  620  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0702672  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  63.06 
 
 
482 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1083  ethanolamine permease  62.24 
 
 
482 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11790  putative amino acid transporter  62.45 
 
 
482 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0380626  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0589  ethanolamine transproter  62.58 
 
 
482 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360598  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3197  ethanolamine permease  64.56 
 
 
480 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0544  ethanolamine transproter  62.16 
 
 
482 aa  571  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0583  ethanolamine transproter  62.16 
 
 
482 aa  571  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1638  ethanolamine transproter  62.47 
 
 
483 aa  561  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4037  ethanolamine transproter  59.22 
 
 
486 aa  549  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2075  ethanolamine transproter  62.37 
 
 
471 aa  512  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2100  ethanolamine transproter  57.46 
 
 
486 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00738274  normal  0.254622 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0475  ethanolamine transproter  58.8 
 
 
468 aa  499  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0941613  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000712  probable transport protein  55.86 
 
 
467 aa  498  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.234899  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0278  ethanolamine transproter  55.72 
 
 
463 aa  484  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  49.04 
 
 
467 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4336  ethanolamine transproter  45.32 
 
 
499 aa  358  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4032  amino acid permease-associated region  42.72 
 
 
500 aa  330  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182943  decreased coverage  0.00720195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2056  amino acid permease-associated region  40.98 
 
 
509 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2039  amino acid permease-associated region  40.98 
 
 
509 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2102  amino acid permease-associated region  40.98 
 
 
509 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0313964 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0774  ethanolamine transporter  45.42 
 
 
485 aa  320  5e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.886156 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1967  ethanolamine transproter  41.43 
 
 
505 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.536053 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1399  amino acid permease-associated region  42.89 
 
 
497 aa  276  8e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  38.22 
 
 
467 aa  266  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  37.58 
 
 
467 aa  263  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1030  amino acid permease-associated region  39.05 
 
 
474 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0422459  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  37.92 
 
 
467 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  37.07 
 
 
477 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  37.08 
 
 
461 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  38.55 
 
 
458 aa  249  7e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  37.92 
 
 
441 aa  247  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  35.49 
 
 
445 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2299  amino acid permease-associated region  37.5 
 
 
463 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  37.44 
 
 
470 aa  246  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  38.55 
 
 
456 aa  246  9e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  36.98 
 
 
470 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  37.21 
 
 
470 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  37.21 
 
 
470 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  38.29 
 
 
463 aa  244  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  38.32 
 
 
458 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  36.98 
 
 
470 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  36.98 
 
 
470 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1835  amino acid permease-associated region  37.77 
 
 
454 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355552  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  37.09 
 
 
469 aa  242  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2026  ethanolamine permease family protein  37.06 
 
 
454 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169235  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  37.38 
 
 
469 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  37.38 
 
 
469 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  37.38 
 
 
469 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  37.38 
 
 
469 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  37.38 
 
 
469 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  37.38 
 
 
469 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  37.38 
 
 
469 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  38.22 
 
 
457 aa  240  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2262  putative transport protein  37.41 
 
 
470 aa  240  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  39.43 
 
 
455 aa  236  7e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0380  ethanolamine transproter  37.31 
 
 
455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0585  amino acid permease-associated protein  39.04 
 
 
467 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21992  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4034  amino acid permease-associated region  37.12 
 
 
454 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.880837  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4990  amino acid permease-associated region  36.47 
 
 
456 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4773  ethanolamine transproter  36.84 
 
 
469 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0304  ethanolamine transproter  37.09 
 
 
455 aa  231  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2980  ethanolamine permease  37.56 
 
 
470 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391636  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3275  ethanolamine transproter  38.99 
 
 
473 aa  230  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0068  ethanolamine transproter  36.18 
 
 
453 aa  226  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1782  ethanolamine transporter  35.98 
 
 
495 aa  218  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0168265  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4353  amino acid permease-associated region  38.52 
 
 
443 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1379  ethanolamine transporter  33.5 
 
 
445 aa  205  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0847  monomethylamine permease  33.16 
 
 
467 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0838  amino acid transporter  28.97 
 
 
456 aa  128  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0101004  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2522  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 
483 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0242402  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0216  amino acid permease-associated region  29.06 
 
 
483 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3297  amino acid permease-associated region  28.11 
 
 
465 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 
520 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  28.15 
 
 
478 aa  116  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2628  amino acid permease-associated region  27.38 
 
 
474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 
468 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  28.82 
 
 
468 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  26.38 
 
 
476 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  25.74 
 
 
515 aa  114  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  28.11 
 
 
468 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  29.06 
 
 
468 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  29.06 
 
 
468 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  28.99 
 
 
460 aa  113  9e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  28.16 
 
 
491 aa  113  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  29.15 
 
 
466 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  28.82 
 
 
466 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2172  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 
477 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.722417 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  29.31 
 
 
466 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 
517 aa  109  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  26.18 
 
 
471 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2714  amino acid permease-associated region  27.94 
 
 
521 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101766  normal  0.124746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>