More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0251 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  100 
 
 
216 aa  433  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  70 
 
 
213 aa  298  5e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  50.23 
 
 
225 aa  221  9e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  48.37 
 
 
228 aa  213  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  48.36 
 
 
217 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  46.95 
 
 
220 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  46.15 
 
 
228 aa  202  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  56.25 
 
 
231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  44.19 
 
 
241 aa  165  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  43.52 
 
 
221 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  43.06 
 
 
218 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1761  HAD family hydrolase  42.11 
 
 
230 aa  155  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0120798  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1676  HAD-like hydrolase  46.26 
 
 
219 aa  155  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.340852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  42.86 
 
 
227 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3475  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.55 
 
 
221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0272  HAD-superfamily hydrolase  41.01 
 
 
221 aa  141  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  39.07 
 
 
218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2948  HAD-superfamily hydrolase  40.93 
 
 
221 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7216  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  42.93 
 
 
223 aa  131  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40332  predicted protein  39.64 
 
 
247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1893  HAD family hydrolase  41.51 
 
 
222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.84 
 
 
225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.33 
 
 
233 aa  107  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.74 
 
 
231 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3112  hypothetical protein  44.62 
 
 
142 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.472591  normal  0.561703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.67 
 
 
220 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.04 
 
 
233 aa  100  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  31.63 
 
 
456 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.73 
 
 
218 aa  96.7  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.23 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  33.81 
 
 
221 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.1 
 
 
254 aa  95.9  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  31.63 
 
 
456 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  29.9 
 
 
233 aa  93.6  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  31.63 
 
 
456 aa  94  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  33.84 
 
 
236 aa  92.8  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1348  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
226 aa  92.4  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.523514  hitchhiker  0.0000000193697 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1614  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.19 
 
 
224 aa  92.4  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147527  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.41 
 
 
223 aa  92.4  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.16 
 
 
232 aa  90.9  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.73 
 
 
229 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1839  HAD superfamily hydrolase  31.84 
 
 
228 aa  89.7  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.605398  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.43 
 
 
238 aa  89.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.52 
 
 
235 aa  88.2  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  32.09 
 
 
188 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  34.85 
 
 
228 aa  87.4  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  25 
 
 
221 aa  87.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.85 
 
 
234 aa  86.7  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01370  conserved hypothetical protein  29.55 
 
 
250 aa  86.3  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.647335  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  29.41 
 
 
214 aa  86.3  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.6 
 
 
235 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  28.22 
 
 
215 aa  86.7  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  30.92 
 
 
216 aa  86.3  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4360  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.09 
 
 
223 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  29.63 
 
 
223 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1114  HAD family hydrolase  29.73 
 
 
218 aa  86.3  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.35546  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2233  HAD family hydrolase  31.9 
 
 
225 aa  85.9  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.01 
 
 
224 aa  85.1  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0108500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  32.62 
 
 
188 aa  85.1  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  30.92 
 
 
216 aa  85.1  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.4 
 
 
219 aa  85.1  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2702  HAD family hydrolase  29.33 
 
 
232 aa  85.1  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.64 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.84 
 
 
224 aa  84  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2280  HAD family hydrolase  32.57 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299074  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.51 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.5 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0349  HAD superfamily hydrolase  30.58 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.123194 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.05 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  29.95 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  32.42 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1871  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.37 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  32.42 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  32.42 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  32.42 
 
 
188 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  32.42 
 
 
188 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  32.42 
 
 
188 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  32.42 
 
 
188 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0581  HAD family hydrolase  30.85 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.696178  normal  0.657435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0953  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.91 
 
 
253 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0990  HAD family hydrolase  30.91 
 
 
253 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.480228 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2787  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.87 
 
 
230 aa  81.6  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  hitchhiker  0.0000132599 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_10396  predicted protein  33.33 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.44 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0457  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase cbbY-like protein  31.74 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0760422 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.31 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  28.8 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  32.11 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  29.35 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4107  HAD superfamily hydrolase  29.89 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.08 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1096  hypothetical protein  29.27 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4427  HAD superfamily hydrolase  29.89 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.7 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  34.76 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0931  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.36 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22053  normal  0.844847 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1545  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.7 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  30.57 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.13 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1749  HAD family hydrolase  28.85 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>