216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4611 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4611  polysaccharide export protein  100 
 
 		 429 aa  863    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1072  polysaccharide export protein  43.49 
 
 		 423 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.660733  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5877  polysaccharide export protein  41.94 
 
 		 425 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694613  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3561  polysaccharide export protein  32.38 
 
 		 441 aa  195  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  30.51 
 
 		 816 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  25.28 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  25.37 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  26.3 
 
 		 441 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4815  polysaccharide export protein  25.54 
 
 		 434 aa  91.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6413  polysaccharide export protein  24.86 
 
 		 438 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  23.81 
 
 		 415 aa  87.4  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6217  polysaccharide export protein  25.14 
 
 		 436 aa  86.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.166454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  34.4 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  27.1 
 
 		 435 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  25.19 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  23.67 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  29.68 
 
 		 184 aa  82.4  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  23.67 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  26.51 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  35.17 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  27.72 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2548  Outer membrane polysaccharide export protein, exoF  28.76 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  25.74 
 
 		 459 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1207  polysaccharide export protein  28.76 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150349 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  26.15 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  32.05 
 
 		 216 aa  79  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4021  polysaccharide export protein  25.98 
 
 		 451 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2593  polysaccharide export protein  26.84 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  22.04 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  27.21 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  32.23 
 
 		 175 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  31.45 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3185  polysaccharide export protein  24.46 
 
 		 451 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  30.77 
 
 		 195 aa  72.8  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  30.77 
 
 		 196 aa  72.8  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.28 
 
 		 152 aa  72.4  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  30.08 
 
 		 178 aa  72  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  33.6 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  31.71 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  40.8 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  24.77 
 
 		 452 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  37.09 
 
 		 192 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  29.13 
 
 		 186 aa  68.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  29.37 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6863  polysaccharide export protein  27.53 
 
 		 529 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  28.46 
 
 		 153 aa  67  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  29.37 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  30.58 
 
 		 191 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  29.75 
 
 		 189 aa  66.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  33.13 
 
 		 193 aa  66.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  35.76 
 
 		 192 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  35.76 
 
 		 192 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  30.58 
 
 		 191 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  31.2 
 
 		 195 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  30.58 
 
 		 191 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  29.29 
 
 		 910 aa  65.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  30.82 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  31.15 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  29.77 
 
 		 919 aa  63.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  37.9 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  33.06 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  30.65 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  25 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  26.15 
 
 		 196 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  28.69 
 
 		 235 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3022  polysaccharide export protein  24.43 
 
 		 451 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  25.68 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  28.24 
 
 		 921 aa  62  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  32.17 
 
 		 264 aa  62  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  37.1 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.75 
 
 		 193 aa  62  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  31.43 
 
 		 837 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  30.3 
 
 		 920 aa  61.6  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  30.6 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  31.43 
 
 		 837 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  31.43 
 
 		 837 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  30.3 
 
 		 919 aa  61.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  29.77 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  28.78 
 
 		 828 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  27.87 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  28.24 
 
 		 931 aa  60.1  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  28.24 
 
 		 912 aa  60.1  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  29.6 
 
 		 192 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  29.51 
 
 		 213 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.77 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  29.29 
 
 		 828 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  27.42 
 
 		 177 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  29.29 
 
 		 828 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  30.67 
 
 		 232 aa  58.9  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  34.43 
 
 		 196 aa  58.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  29.51 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  29.51 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  34.68 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  32.24 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  29.87 
 
 		 781 aa  56.6  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  26.81 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  28.46 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  27.07 
 
 		 915 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  31.58 
 
 		 247 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  25.62 
 
 		 185 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>