89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3593 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3593  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 290 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  decreased coverage  0.000150106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2911  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  80.21 
 
 		 297 aa  476  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2684  xylose isomerase domain-containing protein  78.47 
 
 		 297 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.16562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2806  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  78.47 
 
 		 297 aa  461  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2286  xylose isomerase domain-containing protein  75.46 
 
 		 277 aa  407  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0370511  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1020  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  53.65 
 
 		 275 aa  285  4e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3316  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  39.68 
 
 		 313 aa  211  9e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2326  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  44.49 
 
 		 284 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00147679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11110  sugar phosphate isomerase/epimerase  47.89 
 
 		 480 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2522  xylose isomerase domain-containing protein  43.01 
 
 		 281 aa  202  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  31.02 
 
 		 274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.82 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.69 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  29.35 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3432  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.88 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0982928  normal  0.0112247 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2524  xylose isomerase domain-containing protein  26.36 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  26.48 
 
 		 271 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  30.09 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4048  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.24 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3018  hypothetical protein  29.55 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.130345  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4487  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.77 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1048  Myo-inosose-2 dehydratase  28.75 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.513171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4299  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.8 
 
 		 275 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.172805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1346  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.2 
 
 		 301 aa  52.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  22.46 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4472  Hydroxypyruvate isomerase  29.09 
 
 		 250 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0435966  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0509  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.4 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.440598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3816  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  23.98 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00643692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.33 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1247  putative myo-inositol catabolism protein  27.59 
 
 		 313 aa  49.7  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04064  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  23.98 
 
 		 284 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04026  hypothetical protein  23.98 
 
 		 284 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4668  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  23.98 
 
 		 284 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2612  xylose isomerase domain-containing protein  27.06 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4758  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  23.98 
 
 		 284 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3796  hexulose-6-phosphate isomerase  23.65 
 
 		 284 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.542065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5713  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  23.98 
 
 		 284 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4727  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  23.98 
 
 		 284 aa  49.3  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639292  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4441  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  23.98 
 
 		 284 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3352  Myo-inosose-2 dehydratase  27.82 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0467219  normal  0.0568196 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1429  xylose isomerase domain-containing protein  29.53 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0947  xylose isomerase-like TIM barrel  29.53 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1407  xylose isomerase domain-containing protein  29.53 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3969  xylose isomerase domain-containing protein  27.82 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3314  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.11 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0346457 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1722  xylose isomerase-like TIM barrel  31.85 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.688264  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.91 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0273  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  19.4 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3905  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.2 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5562  Myo-inosose-2 dehydratase  32.38 
 
 		 281 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4079  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.2 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2929  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27 
 
 		 327 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.712071  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1909  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.59 
 
 		 280 aa  46.6  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5448  Myo-inosose-2 dehydratase  29.37 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1969  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.59 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2613  hydroxypyruvate isomerase  32.84 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2054  xylose isomerase domain-containing protein  27.4 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.69 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2461  hydroxypyruvate isomerase  28.03 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731976  normal  0.599526 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1348  xylose isomerase domain-containing protein  28.76 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3496  hydroxypyruvate isomerase  26.42 
 
 		 258 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0849997  normal  0.283205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8495  Myo-inosose-2 dehydratase  30.4 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3786  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  23.84 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0132  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  23.84 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.482678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0474  hydroxypyruvate isomerase  24.53 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166076  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0128  hexulose-6-phosphate isomerase  23.84 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3271  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.170281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1781  hydroxypyruvate isomerase  26.75 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168778  normal  0.857209 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1309  xylose isomerase domain-containing protein  27.81 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4655  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.9 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2848  xylose isomerase-like TIM barrel  25.88 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.561386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3693  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.54 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4784  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.9 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.871942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5989  xylose isomerase domain-containing protein  28.04 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.171061 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.83 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03434  predicted L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  23.49 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0499  xylose isomerase domain-containing protein  26.75 
 
 		 282 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3595  Myo-inosose-2 dehydratase  25.83 
 
 		 297 aa  43.5  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.5 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03385  hypothetical protein  23.49 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2721  xylose isomerase domain-containing protein  27.91 
 
 		 280 aa  42.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543869  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4050  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.21 
 
 		 284 aa  43.1  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00790933  normal  0.0910238 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3406  xylose isomerase domain-containing protein  29.95 
 
 		 295 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784337 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4190  xylose isomerase-like TIM barrel  29.21 
 
 		 371 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7800  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30 
 
 		 301 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1362  Myo-inosose-2 dehydratase  27.82 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  26.19 
 
 		 260 aa  42.7  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4748  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.48 
 
 		 284 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4665  L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  24.48 
 
 		 284 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>