206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1342 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1342  cyclic nucleotide-binding  100 
 
 		 731 aa  1405    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0056  cyclic nucleotide-binding  28.37 
 
 		 739 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5025  cyclic nucleotide-binding  28.61 
 
 		 749 aa  211  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0554599  normal  0.33022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0030  sulfate transporter  28.1 
 
 		 734 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127752  normal  0.27039 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1175  sulphate transporter  26.02 
 
 		 730 aa  180  9e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0317024  normal  0.332491 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0366  putative sulfate transporter  27.88 
 
 		 727 aa  159  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.972082  normal  0.273026 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1111  cyclic nucleotide-binding  27.08 
 
 		 729 aa  159  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.804267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0635  putative sulfate permease with cyclic nucleotide-binding domain  28.18 
 
 		 733 aa  151  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0466798  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3069  hypothetical protein  21.12 
 
 		 721 aa  136  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2926  hypothetical protein  21.16 
 
 		 721 aa  135  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00680  vacuole protein, putative  25.33 
 
 		 1177 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0220987  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03665  sulfate transporter family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12440)  23.51 
 
 		 1053 aa  106  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50075  predicted protein  22.7 
 
 		 955 aa  90.5  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3904  cyclic nucleotide-binding:Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  25.94 
 
 		 736 aa  84  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  25.44 
 
 		 747 aa  83.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85698  sulfate transporter Sulfate/bicarbonate/oxalate exchanger SAT-1 and related transporters (SLC26 family)  24.41 
 
 		 963 aa  73.2  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.525688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  30.41 
 
 		 624 aa  72.4  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3926  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 608 aa  70.9  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0555  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 601 aa  68.6  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07961  putative sulfate transporter  25.89 
 
 		 573 aa  66.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  25.75 
 
 		 570 aa  65.1  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02441  putative sulfate transporter  24.31 
 
 		 551 aa  65.1  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0624614  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  25.51 
 
 		 575 aa  64.7  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  26.34 
 
 		 551 aa  63.2  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02911  putative sulfate transporter  25.74 
 
 		 555 aa  62.4  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6450  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.48 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02351  putative sulfate transporter  23.44 
 
 		 550 aa  61.2  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.779533  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42555  predicted protein  22.92 
 
 		 1159 aa  61.2  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.240204  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1581  putative sulfate transporter  25.63 
 
 		 555 aa  59.7  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42556  predicted protein  22.22 
 
 		 964 aa  59.7  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162025  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  26.03 
 
 		 572 aa  59.3  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0386  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1398  cyclic nucleotide-binding protein  30.25 
 
 		 157 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  26.67 
 
 		 158 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  20.99 
 
 		 568 aa  57  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02331  putative sulfate transporter  24.31 
 
 		 550 aa  57.4  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.868992  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.08 
 
 		 222 aa  56.2  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3891  cyclic nucleotide-binding protein  30.47 
 
 		 155 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  23.73 
 
 		 572 aa  55.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1831  putative sulfate transporter  24.61 
 
 		 560 aa  55.8  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.505905  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0216  putative sulfate transporter  24.12 
 
 		 550 aa  55.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3912  cyclic nucleotide-binding protein  27.27 
 
 		 144 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4944  cyclic nucleotide-binding protein  27.43 
 
 		 454 aa  55.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  25.2 
 
 		 568 aa  54.7  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0223  sulphate transporter  22.56 
 
 		 539 aa  54.7  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.836452  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02341  putative sulfate transporter  25.53 
 
 		 577 aa  54.3  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  30.16 
 
 		 563 aa  53.9  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2455  cyclic nucleotide-binding protein  37.39 
 
 		 594 aa  53.5  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0911  sulphate transporter  21.81 
 
 		 539 aa  53.5  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.791463  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02853  low affinity sulfate transporter  24.52 
 
 		 545 aa  53.9  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1640  cyclic nucleotide-binding protein  25.84 
 
 		 624 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.346806 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1689  sulphate transporter  22 
 
 		 539 aa  53.5  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3203  cyclic nucleotide-binding protein  40 
 
 		 165 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0236  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.18 
 
 		 179 aa  52.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.754806 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4903  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.05 
 
 		 163 aa  52.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.65 
 
 		 225 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4790  cyclic nucleotide-binding protein  33.64 
 
 		 170 aa  53.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0497  putative sulfate transporter YchM  27.65 
 
 		 565 aa  53.5  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3152  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 487 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833452  normal  0.47191 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1553  sulphate anion transporter  21.54 
 
 		 553 aa  52.4  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364529  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3549  cyclic nucleotide-binding protein  31.48 
 
 		 582 aa  52.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.864417 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0504  putative sulfate transporter  26.25 
 
 		 558 aa  52  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.602665  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 225 aa  52  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1459  SulP family sulfate permease  22.22 
 
 		 551 aa  51.6  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.032999  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0608  putative sulfate transporter YchM  23.24 
 
 		 594 aa  51.2  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.288861  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0301  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34 
 
 		 858 aa  51.2  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50333  predicted protein  22.34 
 
 		 619 aa  51.2  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3735  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.4 
 
 		 210 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 224 aa  50.8  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1016  cyclic nucleotide-binding protein  35.05 
 
 		 156 aa  50.8  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458369 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 228 aa  50.8  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 214 aa  50.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  21.79 
 
 		 570 aa  50.4  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  24.48 
 
 		 568 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  34.83 
 
 		 388 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0964  cyclic nucleotide-binding protein  33.03 
 
 		 152 aa  50.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2005  cyclic nucleotide-binding protein  30.28 
 
 		 153 aa  49.7  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  23.64 
 
 		 568 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  29.89 
 
 		 241 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0235  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.17 
 
 		 171 aa  49.7  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.742856 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04370  cyclic nucleotide-binding protein, hydrogenase accessory protein, HoxI  36.71 
 
 		 152 aa  49.7  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339125  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4477  sulphate transporter  27.13 
 
 		 624 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.496082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.13 
 
 		 408 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  36.36 
 
 		 388 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3511  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 233 aa  49.7  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 227 aa  49.3  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1731  SulP family sulfate permease  21.84 
 
 		 551 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.281721  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  25 
 
 		 581 aa  49.7  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 		 226 aa  49.7  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3842  cyclic nucleotide-binding protein  30.56 
 
 		 582 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1928  cyclic nucleotide-binding protein  30.28 
 
 		 153 aa  49.3  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  24.27 
 
 		 568 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3504  sulphate transporter  23.31 
 
 		 576 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.44 
 
 		 237 aa  48.9  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  34.74 
 
 		 412 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1780  cyclic nucleotide-binding protein  29.47 
 
 		 156 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  23.43 
 
 		 606 aa  48.5  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0005  sulphate transporter  22.38 
 
 		 511 aa  48.5  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6054  cyclic nucleotide-binding protein  33.65 
 
 		 159 aa  48.5  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507117  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>