More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1484 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1484  haloacid dehalogenase  100 
 
 		 257 aa  512  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.514428 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1517  HAD family hydrolase  62.33 
 
 		 272 aa  257  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  decreased coverage  0.0000688846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3750  HAD family hydrolase  59.03 
 
 		 249 aa  239  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.773366 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0853  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  47.37 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1182  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.16 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.91289 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1452  HAD family hydrolase  50.45 
 
 		 241 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1466  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.16 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2478  HAD family hydrolase  46.96 
 
 		 254 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0642975  normal  0.83029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5014  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  49.19 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.652483  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0810  HAD family hydrolase  50.23 
 
 		 241 aa  192  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.731901  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0690  HAD family hydrolase  45.97 
 
 		 253 aa  192  6e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32351  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4341  HAD family hydrolase  50.85 
 
 		 248 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4237  HAD family hydrolase  50.21 
 
 		 248 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00960992  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3617  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.43 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3556  HAD family hydrolase  46.43 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0990  HAD family hydrolase  46.22 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.480228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0953  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.22 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0732  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.34 
 
 		 252 aa  189  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.595583  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0931  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.66 
 
 		 253 aa  188  8e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22053  normal  0.844847 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0553  HAD family hydrolase  48.62 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0608  HAD family hydrolase  45.41 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.675821  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.99 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2894  HAD family hydrolase  47.95 
 
 		 233 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.338332  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.91 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121216 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1885  HAD family hydrolase  46.98 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4648  HAD family hydrolase  39.67 
 
 		 252 aa  175  7e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.842677  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1067  HAD family hydrolase  47.25 
 
 		 249 aa  174  8e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.307396  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3262  hypothetical protein  45.34 
 
 		 250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6394  haloacid dehalogenase-like hydrolase  48.86 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0880  HAD family hydrolase  42.39 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1242  HAD family hydrolase  39.92 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.496272  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3629  HAD family hydrolase  49.32 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.956312 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0609  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.18 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.447765  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1980  HAD family hydrolase  47.6 
 
 		 253 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2025  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.39 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2000  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.39 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2785  haloacid dehalogenase  43.95 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3317  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.92 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000267703  hitchhiker  0.00944163 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.6 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2280  HAD family hydrolase  43.97 
 
 		 256 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299074  normal  0.0109793 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2709  HAD family hydrolase  43.19 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.672792 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3124  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.59 
 
 		 254 aa  148  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1033  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.11 
 
 		 260 aa  148  8e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0457  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase cbbY-like protein  42.5 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0760422 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1279  CbbY family protein  41.36 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183021  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2938  HAD family hydrolase  41.36 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0079  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.56 
 
 		 248 aa  144  9e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09091  putative CbbY-like protein  34.17 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.642347  hitchhiker  0.000010947 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_12969  predicted protein  37.89 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5695  predicted protein  36.04 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10181  putative CbbY-like protein  32.34 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10171  putative CbbY-like protein  31.84 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.606492  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0356  HAD family hydrolase  35.35 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.138453  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10371  putative CbbY-like protein  34.85 
 
 		 248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.549559  hitchhiker  0.0000687535 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0949  putative CbbY  30.85 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.283596  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27888  predicted protein  34.75 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0126093  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1156  HAD family hydrolase  36.82 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.10504  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1319  HAD family hydrolase  39.15 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0765605 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09281  putative CbbY-like protein  29.13 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14541  putative CbbY-like protein  37.77 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13261  predicted protein  31.91 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684824  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1057  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.81 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1073  hydrolase  30.81 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48254  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1064  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.85 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1084  hydrolase  30.81 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7216  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.53 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  35.35 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  33.33 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1614  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.05 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147527  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.91 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0432  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.5 
 
 		 218 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000498152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  29.28 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  32.49 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  25.36 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.91 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  33.02 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3082  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.01 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48861  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3593  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.5 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4047  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.46 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000965281  normal  0.234971 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2787  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.68 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  hitchhiker  0.0000132599 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  28.21 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  29.06 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  33.63 
 
 		 241 aa  72  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.85 
 
 		 227 aa  72  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.5 
 
 		 217 aa  72  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  31.98 
 
 		 256 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.27 
 
 		 217 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  30.95 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  27.57 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.44 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.54 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0108500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3906  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.93 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000443869  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  31.66 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  31.07 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0284  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.29 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458991 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  34.22 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3054  HAD family hydrolase  31.84 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.751068  normal  0.223571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>