160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1789 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 109 aa  219  7e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  46.39 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  48.96 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  42.53 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  41.84 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  41.84 
 
 		 254 aa  70.1  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  44.58 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  39.74 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  45.12 
 
 		 104 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  38.14 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  42.05 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  40.21 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  38.64 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  36.67 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  38.71 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  38.64 
 
 		 97 aa  62  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  38.95 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  39.53 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  36.89 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  38.64 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  37.65 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  39.13 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  35.23 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  37.5 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  36.08 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  38.37 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  37.11 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  38.46 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 		 96 aa  60.1  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  39.76 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  41.89 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3447  DNA polymerase beta subunit  38.36 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.665517  normal  0.0889414 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  31.63 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  34.38 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  39.53 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  33.67 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  37.63 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  41.33 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  33.67 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  34.65 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  41.3 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  36.9 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  34.74 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 115 aa  57  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  38.04 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  37.35 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  38.27 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  38.27 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  39.29 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2615  hypothetical protein  34.15 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.111377 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  33.77 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  37.65 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  40.48 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0369  DNA polymerase beta subunit  33 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.832865  normal  0.194305 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  34.57 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  35.06 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  36.67 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  35.29 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2453  DNA polymerase beta domain protein region  30.61 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  35.87 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  35.23 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3907  DNA polymerase beta domain protein region  32.93 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  37.84 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  39.02 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  36.96 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  35 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  40.26 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  41.33 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  42.25 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  35.37 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  40.26 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  36 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1178  DNA polymerase beta subunit  37.84 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448012  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2495  DNA polymerase beta domain protein region  32.61 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  34.74 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  33.67 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  32.05 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  29.41 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  30.43 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  37.8 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  31.58 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  31.58 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  32.95 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  37.8 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  41.46 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  32.58 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  32.95 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  29.79 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  35.14 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  38.04 
 
 		 103 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  34.09 
 
 		 97 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  31.17 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  42.03 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  34.94 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>