218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0076 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0076  thymidylate synthase, methanogen type  100 
 
 		 244 aa  510  1e-144  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.527741 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0549  thymidylate synthase  65.69 
 
 		 241 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000344627  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0521  thymidylate synthase  64.29 
 
 		 241 aa  333  2e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.700013 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0109  hypothetical protein  57.56 
 
 		 239 aa  298  5e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.302253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0624  thymidylate synthase  40 
 
 		 210 aa  169  4e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1294  thymidylate synthase  39.53 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.368464  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0199  thymidylate synthase  40 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.732391  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0689  thymidylate synthase  38.6 
 
 		 212 aa  161  9e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1049  thymidylate synthase  37.22 
 
 		 222 aa  154  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1795  thymidylate synthase-like  34.28 
 
 		 285 aa  122  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0890  thymidylate synthase  34.31 
 
 		 217 aa  122  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1079  thymidylate synthase  31.37 
 
 		 217 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0710  thymidylate synthase  30.54 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1327  thymidylate synthase-like protein  31.67 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0948  thymidylate synthase-like  28.33 
 
 		 460 aa  74.3  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1545  thymidylate synthase  36.27 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2001  thymidylate synthase  28.65 
 
 		 367 aa  65.1  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.745525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1792  thymidylate synthase  30.39 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  24.51 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3105  thymidylate synthase  26.43 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.447667  hitchhiker  0.0000000000170345 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2266  thymidylate synthase  26.43 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0871479  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4706  thymidylate synthase  29.94 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2020  thymidylate synthase  26.43 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2348  thymidylate synthase  26.43 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000465459  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  28.46 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2543  thymidylate synthase  30.39 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.33393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0319  thymidylate synthase  31.37 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49676  predicted protein  29.6 
 
 		 499 aa  62.4  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21688 
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  29.41 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4007  thymidylate synthase  27.2 
 
 		 264 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1355  thymidylate synthase  29.41 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0901  thymidylate synthase  29.7 
 
 		 264 aa  62  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  30.77 
 
 		 283 aa  62  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2082  thymidylate synthase  25.71 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2020  thymidylate synthase  25.71 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2236  thymidylate synthase  25.71 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.376946  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1639  thymidylate synthase  23.98 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00770076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2219  thymidylate synthase  25.71 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.615313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2263  thymidylate synthase  25.71 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45604e-29 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2812  thymidylate synthase  29.37 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000021691  hitchhiker  0.0000331365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  30.39 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  28.43 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  28.43 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1487  thymidylate synthase  25.15 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.225159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1516  thymidylate synthase  25.15 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2061  thymidylate synthase  25 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691147  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0769  thymidylate synthase  28.7 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1751  thymidylate synthase  30.39 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575891  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0830  thymidylate synthase  26.97 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0147447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0926  thymidylate synthase  27.72 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48170  thymidylate synthase  29.41 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0815  thymidylate synthase  30.71 
 
 		 508 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.148226 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1003  thymidylate synthase  23.2 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1582  thymidylate synthase  23.2 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2036  thymidylate synthase  28.43 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2730  thymidylate synthase  26.19 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  29.41 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4213  thymidylate synthase  30.69 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2060  thymidylate synthase  27.64 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2887  Thymidylate synthase  30.69 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.189852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0458  thymidylate synthase  25.79 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  29.41 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4525  thymidylate synthase  29.7 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  26.98 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2351  thymidylate synthase  27.2 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.914614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1962  thymidylate synthase  24.06 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3266  thymidylate synthase  26.4 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394281  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3354  thymidylate synthase  29.7 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819498 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1729  thymidylate synthase  27.27 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  27.45 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0404  thymidylate synthase  23.04 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13308  thymidylate synthase  24.32 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.372372  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  21.95 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2660  thymidylate synthase  29.7 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2782  Thymidylate synthase  28.1 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0986115  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2331  thymidylate synthase  29.91 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226871 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09380  thymidylate synthase  29.7 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21237  normal  0.43537 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_1690  predicted protein  30.4 
 
 		 495 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2314  thymidylate synthase  28.71 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1289  thymidylate synthase  27.45 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.994913  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0906  thymidylate synthase  25.71 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1050  thymidylate synthase  25.71 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1789  thymidylate synthase  23.45 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.748216  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0726  thymidylate synthase  25.51 
 
 		 512 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04649  thymidylate synthase  27.18 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0874843  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0097  thymidylate synthase  28.45 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1242  thymidylate synthase  23.39 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0595722  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0214  thymidylate synthase  33.02 
 
 		 354 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  27.72 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2044  thymidylate synthase  30.08 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.544458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2166  thymidylate synthase  27.81 
 
 		 342 aa  54.7  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2011  thymidylate synthase  28 
 
 		 300 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0593  thymidylate synthase  26.73 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.931359 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0390  thymidylate synthase  31.01 
 
 		 298 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.137762  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_723  thymidylate synthase  24.07 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0738  thymidylate synthase-like protein  24.07 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.912305  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0819  thymidylate synthase, putative  24.07 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2040  thymidylate synthase  27.72 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00561284  normal  0.510775 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29370  thymidylate synthase  26.73 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1309  thymidylate synthase  25.96 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00097821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>