263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8301 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8301  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 292 aa  592  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  46.18 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  45.52 
 
 		 294 aa  247  2e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  44.48 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3119  Beta-lactamase-like  40.48 
 
 		 297 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  38.41 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  39.02 
 
 		 302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  39.02 
 
 		 302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  40.07 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4444  beta-lactamase domain-containing protein  38.68 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.398437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  38.08 
 
 		 282 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  39.72 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  37.63 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1508  Beta-lactamase-like  37.04 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.93 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  36.65 
 
 		 282 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4368  Beta-lactamase-like  35.76 
 
 		 315 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  35.46 
 
 		 282 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  42.47 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0731  beta-lactamase-like  38.49 
 
 		 283 aa  156  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.894293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0290  beta-lactamase domain protein  41.45 
 
 		 317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.69 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5633  beta-lactamase domain-containing protein  38.7 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  35.84 
 
 		 299 aa  145  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3214  beta-lactamase  34.68 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  38.96 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  32.63 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1053  beta-lactamase domain protein  36.59 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  34.03 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  29.29 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  32.92 
 
 		 327 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  31.51 
 
 		 279 aa  99  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  32.35 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  31.93 
 
 		 321 aa  96.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  30.24 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  34.31 
 
 		 281 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  31.42 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  34.31 
 
 		 281 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  32.24 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  29.35 
 
 		 288 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  33.94 
 
 		 281 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  29.59 
 
 		 322 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  33.03 
 
 		 238 aa  93.6  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  29.35 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  29.66 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  30.21 
 
 		 329 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 326 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  33.47 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  28.82 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  29.97 
 
 		 329 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  25.69 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  31.1 
 
 		 316 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  29.73 
 
 		 339 aa  89.7  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  30.6 
 
 		 330 aa  89.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  28.45 
 
 		 315 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  33.15 
 
 		 284 aa  88.6  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  31.51 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  32.76 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  25.87 
 
 		 330 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  33.76 
 
 		 315 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  27.53 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.03 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  27.43 
 
 		 329 aa  87  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  30.45 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  32.31 
 
 		 312 aa  87  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 		 335 aa  87  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  28.03 
 
 		 321 aa  87  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  26.81 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  29.87 
 
 		 287 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  29.74 
 
 		 305 aa  86.3  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  33.02 
 
 		 291 aa  85.9  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  30.47 
 
 		 333 aa  85.5  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  25.96 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  31.42 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  30.74 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  28.38 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  31.02 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  26.69 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  27.24 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  27.43 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  28.33 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  27.03 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  28.67 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  30.53 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  30.1 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  30.1 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  30.38 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  31.02 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  26.64 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  28.99 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  28.26 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  32.58 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  25.52 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  30.8 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5276  beta-lactamase domain-containing protein  32.98 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.872928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  31.17 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  29.29 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  28.39 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>