53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1976 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1976  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 227 aa  471  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0972  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 228 aa  124  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.385835 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0258  putative phage repressor  28.57 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  27.03 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  47.54 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  27.03 
 
 		 264 aa  54.3  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  30.48 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0617  hypothetical protein  45.9 
 
 		 71 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  hitchhiker  0.00000289495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  53.57 
 
 		 230 aa  52  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  25.41 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2209  putative phage repressor  31.73 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111819 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  27.5 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  27.5 
 
 		 237 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  28.49 
 
 		 240 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3687  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 79 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2335  putative phage repressor  26.79 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  unclonable  0.0000000160936 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  27.84 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  42.86 
 
 		 259 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  26.67 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  26.37 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 120 aa  45.8  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0077  phage repressor like transcriptional regulator  27.81 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  25.13 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  39.68 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 72 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  40.62 
 
 		 75 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1809  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 66 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06790  hypothetical protein  40.32 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  27.5 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  27.5 
 
 		 244 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  41.82 
 
 		 377 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 192 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0707  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 104 aa  43.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  25.85 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  38.18 
 
 		 220 aa  43.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  43.14 
 
 		 376 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  38.75 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  31 
 
 		 201 aa  42.7  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3853  XRE family molybdate metabolism transcriptional regulator  44.9 
 
 		 377 aa  42.4  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.593506  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0669  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 383 aa  42.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0207  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 106 aa  42.4  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000425004  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  42.37 
 
 		 508 aa  42.4  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15700  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  46.15 
 
 		 507 aa  42.4  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.645755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3831  putative phage repressor  26.97 
 
 		 246 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  23.32 
 
 		 216 aa  42  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  25.37 
 
 		 240 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3098  transcriptional regulator, XRE family  31.37 
 
 		 158 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0675  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 120 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00325967 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0540  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 120 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1892  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 120 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  42.86 
 
 		 218 aa  41.6  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2321  putative phage repressor  23.23 
 
 		 243 aa  41.6  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>