More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1990 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 243 aa  496  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3231  short chain dehydrogenase  58.16 
 
 		 245 aa  275  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0505  short chain dehydrogenase  56.79 
 
 		 246 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0339  short chain dehydrogenase  53.78 
 
 		 245 aa  248  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2430  short chain dehydrogenase  52.05 
 
 		 248 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4196  short chain dehydrogenase  54.88 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3552  short chain dehydrogenase  56.25 
 
 		 241 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5468  short chain dehydrogenase  56.25 
 
 		 241 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.107727 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4815  short chain dehydrogenase  56.25 
 
 		 241 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4719  short chain dehydrogenase  54.07 
 
 		 252 aa  234  8e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.358577 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3788  short chain dehydrogenase  55.79 
 
 		 248 aa  231  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798977 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1926  short chain dehydrogenase  51.24 
 
 		 248 aa  231  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00605891  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1913  short chain dehydrogenase  51.24 
 
 		 248 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1193  short chain dehydrogenase  51.24 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2074  short chain dehydrogenase  51.24 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0299  short chain dehydrogenase  51.24 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.71932  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0862  short chain dehydrogenase  51.24 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.140204  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1636  short chain dehydrogenase  51.24 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.140639  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0889  short chain dehydrogenase  55.24 
 
 		 252 aa  228  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122847  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 241 aa  215  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.68 
 
 		 247 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 		 241 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5343  carbonyl reductase  48.13 
 
 		 242 aa  212  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.08 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.64 
 
 		 242 aa  184  9e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0115742  normal  0.0276223 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2155  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0553289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2043  short chain dehydrogenase  41.06 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1811  short chain dehydrogenase  37.9 
 
 		 256 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.780661  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1794  short chain dehydrogenase  37.9 
 
 		 256 aa  151  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.503189  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0363  short chain dehydrogenase  37.9 
 
 		 256 aa  151  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2073  short chain dehydrogenase  37.9 
 
 		 256 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.844507  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1100  short chain dehydrogenase  37.9 
 
 		 256 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0809  short chain dehydrogenase  37.9 
 
 		 256 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  37.04 
 
 		 252 aa  151  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2568  short chain dehydrogenase  38.68 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0458  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000170009  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3287  short chain dehydrogenase  37.04 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3420  short chain dehydrogenase  37.04 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0769277  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2818  short chain dehydrogenase  36.63 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0950  short chain dehydrogenase  37.04 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.477872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2791  short chain dehydrogenase  36.63 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2835  short chain dehydrogenase  36.63 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0641  short chain dehydrogenase  35.25 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1400  short chain dehydrogenase  35.25 
 
 		 256 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0683679  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.48 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1629  short chain dehydrogenase  34.84 
 
 		 257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1573  short chain dehydrogenase  34.84 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0631529  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4068  short chain dehydrogenase  34.43 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625011  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2462  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.131471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0423365  hitchhiker  0.00643231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 		 251 aa  132  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.400321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 		 247 aa  132  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00790972  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  34.78 
 
 		 259 aa  131  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03440  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  38.31 
 
 		 257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2468  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  31.75 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000411328  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0935  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  30.49 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.67 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40266  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  36.59 
 
 		 255 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 		 254 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 246 aa  128  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.96 
 
 		 249 aa  128  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00384997  hitchhiker  0.000208801 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0987  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  30.08 
 
 		 251 aa  128  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3369  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  30.08 
 
 		 251 aa  128  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.589225 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.677514  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11729  oxidoreductase  33.6 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123352  normal  0.515207 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101369  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5524  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.14 
 
 		 257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 		 252 aa  125  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2807  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 		 253 aa  125  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 		 266 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000468902  normal  0.0104317 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  33.73 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000174886  normal  0.399546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.82409  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 		 257 aa  123  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000516058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1819  glucose 1-dehydrogenase  34.15 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00010189  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 		 250 aa  122  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1953  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.1 
 
 		 269 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660502  hitchhiker  0.0000443121 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 		 267 aa  122  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 		 255 aa  122  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>