More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0826 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  96.19 
 
 
341 aa  676    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  100 
 
 
341 aa  697    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  94.13 
 
 
341 aa  664    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  78.24 
 
 
341 aa  560  1e-158  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1026  biotin synthase  73.1 
 
 
344 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  52.23 
 
 
349 aa  361  9e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1545  Radical SAM domain protein  28.09 
 
 
337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.160602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2151  biotin synthase  26.69 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  30.57 
 
 
328 aa  110  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  30.19 
 
 
328 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1674  hypothetical protein  27.69 
 
 
343 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  27.36 
 
 
351 aa  102  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  31.27 
 
 
345 aa  102  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0181  Radical SAM domain protein  25.84 
 
 
349 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4857  Radical SAM domain protein  23.7 
 
 
365 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  28.89 
 
 
347 aa  96.3  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  28.68 
 
 
329 aa  96.3  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  32.92 
 
 
324 aa  96.3  7e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  26.46 
 
 
352 aa  95.9  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  28.52 
 
 
347 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  21.76 
 
 
350 aa  92.8  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 
346 aa  92.8  8e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  30.22 
 
 
325 aa  92  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  23.16 
 
 
368 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  28.52 
 
 
338 aa  91.3  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  25.09 
 
 
333 aa  89.7  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0144  Radical SAM domain protein  21.97 
 
 
352 aa  89  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000047373  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  27.2 
 
 
322 aa  88.6  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1597  biotin synthase  25.44 
 
 
341 aa  88.6  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  25.79 
 
 
320 aa  89  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  29.39 
 
 
328 aa  87.8  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0166  radical SAM domain-containing protein  24.21 
 
 
370 aa  87.4  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.372295  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  22.98 
 
 
380 aa  87.4  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  26.28 
 
 
328 aa  87  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  27 
 
 
349 aa  85.9  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  25.71 
 
 
321 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2070  biotin synthase  25.09 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4622  biotin synthase  27.44 
 
 
332 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.151493 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0352  biotin synthase  28.67 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.643225  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  26.97 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1607  biotin synthase  24.03 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  25 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  25.45 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  27.83 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  27.83 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0657  biotin synthase  28.17 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0078  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.43 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  25.67 
 
 
368 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2916  biotin synthase  27.04 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0436  biotin synthase  26.16 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726909 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0259  biotin synthase  26.16 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  26.45 
 
 
360 aa  81.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1204  hypothetical protein  25.21 
 
 
354 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  23.94 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  26.84 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0612  biotin synthase  25.25 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  25.67 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0112  biotin synthase  24.65 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  27.92 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  25.75 
 
 
370 aa  80.1  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3925  biotin synthase  23.62 
 
 
359 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1428  biotin synthase  27.02 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 
359 aa  80.1  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1491  biotin synthase  25.91 
 
 
357 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1556  biotin synthase  27.02 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1117  biotin synthase  27.78 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0841  biotin synthase  24.92 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  24.18 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2458  Biotin synthase  22.84 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  25.12 
 
 
364 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  26.32 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1844  biotin synthase  24.61 
 
 
360 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0706  biotin synthase  23.96 
 
 
359 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.997344  hitchhiker  0.000263623 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2085  biotin synthase  22.92 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000297943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8311  Biotin synthase  28.57 
 
 
332 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3331  biotin synthase  26 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2190  Biotin synthase  23.66 
 
 
337 aa  77  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  28.12 
 
 
331 aa  77  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  26.71 
 
 
375 aa  77  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  26.54 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1722  biotin synthase  25.16 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000337366  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  24.22 
 
 
412 aa  76.3  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  24.68 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1551  biotin synthase  25.56 
 
 
348 aa  76.3  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  27.31 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  23.85 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  24.05 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  23 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1100  Radical SAM domain protein  25.82 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00787041  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2103  biotin synthase  27.14 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.881041  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0963  biotin synthase  25.94 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.032686  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2081  biotin synthetase  24.33 
 
 
330 aa  74.7  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  25.07 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2430  Biotin synthase  24.73 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1301  Biotin synthase  24.29 
 
 
316 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2466  biotin synthase  27.73 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0190546 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  26.22 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  26.69 
 
 
375 aa  73.9  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  22.29 
 
 
360 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1020  biotin synthase  22.78 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>