173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0377 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  264  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  96.15 
 
 
130 aa  257  4e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  96.92 
 
 
130 aa  256  9e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  83.59 
 
 
129 aa  228  3e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  72.44 
 
 
130 aa  194  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  53.97 
 
 
130 aa  158  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  53.91 
 
 
130 aa  153  7e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  55.64 
 
 
134 aa  153  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  52.71 
 
 
132 aa  152  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1934  hypothetical protein  50.79 
 
 
133 aa  149  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108502  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  49.61 
 
 
129 aa  148  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  49.21 
 
 
152 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  47.66 
 
 
130 aa  142  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  47.66 
 
 
132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  49.61 
 
 
135 aa  122  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  47.2 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0984  hypothetical protein  43.28 
 
 
132 aa  110  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0428  hypothetical protein  41.73 
 
 
131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0261769  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1357  hypothetical protein  44.88 
 
 
132 aa  107  5e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1145  protein of unknown function DUF35  41.73 
 
 
133 aa  104  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0574924  hitchhiker  0.0000746026 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  42.74 
 
 
133 aa  103  5e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1083  hypothetical protein  46.83 
 
 
134 aa  101  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1241  hypothetical protein  41.54 
 
 
137 aa  99  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0148077  normal  0.0127741 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1648  hypothetical protein  36.89 
 
 
135 aa  89  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  36.22 
 
 
133 aa  87.8  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3871  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  37.5 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  40.2 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  34.38 
 
 
576 aa  71.6  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  41.18 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4194  protein of unknown function DUF35  33.58 
 
 
473 aa  70.5  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492043  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  37.76 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  36.46 
 
 
319 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  37.76 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  30.91 
 
 
182 aa  67  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  31.52 
 
 
189 aa  67  0.00000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1925  protein of unknown function DUF35  32.14 
 
 
474 aa  67  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  36.08 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  37.08 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  34.86 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  34.69 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  33.64 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  35.71 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  34 
 
 
177 aa  63.2  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  35.71 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  38.82 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  36 
 
 
319 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  33.98 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 
913 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3587  hypothetical protein  36.84 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  33.68 
 
 
137 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  34.44 
 
 
136 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  30.93 
 
 
178 aa  60.8  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  32.67 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0597  protein of unknown function DUF35  29.86 
 
 
490 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  33.65 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  29 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  34.95 
 
 
140 aa  58.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  33.67 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4021  protein of unknown function DUF35  31.88 
 
 
481 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605764  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  35.35 
 
 
120 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  27.03 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  36.17 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  41.54 
 
 
322 aa  57  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  34.55 
 
 
132 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3659  hypothetical protein  26.67 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17734  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3732  hypothetical protein  26.67 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  33.65 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  33.63 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  30 
 
 
143 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3388  hypothetical protein  26.92 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  30.61 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  28.81 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4422  protein of unknown function DUF35  29.5 
 
 
474 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00766931  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  29.79 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  32.69 
 
 
130 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2520  hypothetical protein  27.41 
 
 
146 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167569  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3240  hypothetical protein  26.19 
 
 
485 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.57921  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  32.65 
 
 
141 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1630  hypothetical protein  31.91 
 
 
128 aa  53.5  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4138  hypothetical protein  28.99 
 
 
146 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.342554 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  28.32 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  31.73 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  33.01 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  32.14 
 
 
333 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  52  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  30.19 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0854  protein of unknown function DUF35  32.04 
 
 
116 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0219431  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0940  hypothetical protein  26.81 
 
 
153 aa  51.6  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8927  hypothetical protein  30.58 
 
 
134 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3672  hypothetical protein  25.18 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.108807  normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  29.36 
 
 
151 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  32.14 
 
 
142 aa  51.2  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  30.3 
 
 
146 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  27.68 
 
 
311 aa  50.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>